金樹仁，光緒十八年（1892年），以十二歲幼齡考中秀才，時人目之為神童。

光緒二十二年（1896年），清政府任云南蒙自人楊增新為河州知州。上任伊始，整頓吏治，興利除弊；修辦書院，培養(yǎng)人才。先后復(fù)興創(chuàng)辦鳳林、龍泉、愛蓮等書院，“聚士之秀而文者于三書院，月課而旬考之，于是士知響學(xué)，人文蔚起”。并拔其“邑人士之翹楚者數(shù)輩，招入署齋，躬自課之，均有成就……”金樹仁備受楊增新器重，親自教讀，學(xué)業(yè)猛進。

光緒二十七年（1901年），楊增新調(diào)任甘肅學(xué)政兼高等學(xué)堂監(jiān)督，金樹仁便負笈省城，從楊公游，留心經(jīng)世之學(xué)。旋入甘肅文高等學(xué)堂，盡師碩儒，盡友群雅，由是見聞驟廣，記覽驟博。畢業(yè)后，又進法政學(xué)堂鉆研數(shù)年，遍覽經(jīng)史，精研西學(xué)。卒業(yè)后，先后任龍泉書院、鳳林書院校長。

宣統(tǒng)元年（1909年）參加科考，舉為孝廉方正，同年又應(yīng)己酉科試，考取拔貢。

1911年辛亥革命后，全國議會選舉，金樹仁高票當(dāng)選議會議員、眾議院議員，時論榮之。詩人馬恕吟出“久仰仁山最特奇，而今晤對更相宜”，“器度推君最是賢”的詩句，譽其懷抱高遠，氣度不凡。

楊增新主政新疆之后，急需人才，金樹仁便應(yīng)楊之召，于1915年西出陽關(guān)，投其麾下，任書記官兼科員。未幾，政治研究所招考，金樹仁名列第一。翌年六月，又參加新疆全省縣長考試，以甲等成績分發(fā)任阿克蘇縣長。其后或疏附、或迪化、或庫車，皆在基層歷練，凡十余年。

1926年，因政績顯著，升任省公署政務(wù)廳廳長。 民國8年（1919年），俄國革命，沙俄中亞細亞總司令阿年科夫，因潰敗竄入新疆，以此為基地，圖謀反攻蘇俄。在新俄人紛紛聚其麾下。阿山道尹周務(wù)學(xué)被逼自殺。邊局吃緊，省垣告危，一時眾皆束手。金樹仁沉著應(yīng)對，計誘阿年科夫于省城拘押，將其軍隊分化瓦解，將一場危機消弭于無形，深得楊增新賞識。

1928年，新疆發(fā)生“七七事變”，軍務(wù)廳長兼外交署長樊耀南刺殺省長楊增新于宴會。事變乍起，金樹仁聞變不驚，臨危不懼，一邊命其部屬把守要隘，固守城防；一邊集結(jié)部隊包圍現(xiàn)場，樊耀南彈盡被捕。次日，樊全部余黨一并擒獲，磔刑處死。事后，各級軍政要員會議，一致推舉金樹仁為省主席。地方南北將領(lǐng)、各族王公通電擁護。南京政府亦以平亂有功，任其為新疆省主席兼總司令。

金樹仁剛一履任，既紹楊增新既定方略，又開創(chuàng)新局：擴充師范，新建工業(yè)、無線電等學(xué)校；各縣均設(shè)初等中學(xué)，凡住50戶以上村寨，均設(shè)小學(xué)一所；曾多次派人到德國和日本留學(xué)，還送大批學(xué)生到內(nèi)地求學(xué)。

民國18年（1929年）底，從德國購置壓路機6部，并撥其工兵修通迪化至古長城473公里車路；繼而又修通迪塔、迪伊、迪阿、迪哈等線，使省內(nèi)各區(qū)公路互相聯(lián)結(jié)。同時在新疆發(fā)展畜牧，畜牧業(yè)在新疆向來發(fā)達，尤其馬、羊。為改良馬、羊品種，曾派專家到蘇聯(lián)購來純種馬、良種卷毛羊，在迪化、伊犁、馬里坤設(shè)立牧場，專飼繁殖。

為發(fā)展工業(yè)經(jīng)濟，先披露方針政策于報端，吁請國內(nèi)外資本家來新投資，興辦實業(yè)、建設(shè)邊疆。如與德國合作，在新疆開采石油；與西門子公司接洽，商請派工程師建立大型發(fā)電廠；從英國購買機器，并要求蘇聯(lián)提供機械設(shè)備和技術(shù)人才等。還采用官辦、官督民辦等形式著手開采阿山金礦和于闐金礦。如民國22年（1933年），塔城一帶投入的淘金機就已有20余部。另外力施新政，改土歸流，安置難民；整頓軍隊，新辦軍官學(xué)校，購槍炮、置飛機，以鞏固國防。民國18年（1929年）甘肅大旱，饑民塞途，金樹仁三次撥款，賑濟災(zāi)民，恩被全隴，尤其對家鄉(xiāng)臨夏、永靖特捐急賑。 然當(dāng)時的新疆孤懸塞外，強俄逼視，英人窺伺；中央政府鞭長莫及；鄰援無望，協(xié)餉不來；地方民族，矛盾頻生；加之內(nèi)部所用非人，奸宄生心，盤踞要津，可謂內(nèi)憂外患紛至沓來。

1933年4月12日，省府參謀處長陳中、迪化縣長陶明樾、航空學(xué)校校長李笑天等輩，取得義勇軍首領(lǐng)鄭潤成和“歸化軍”首領(lǐng)巴品古特支持，率眾包圍省府，發(fā)動了新疆“四·一二政變”。金樹仁奮力抵抗，但終因眾寡懸殊，力不能支，不及攜帶印信，被迫出走。當(dāng)時，盛世才率部進至烏魯木齊城東，按兵觀望，伺機漁利。

4月13日，金樹仁攜眷去昌吉，后至塔城。時有俄國領(lǐng)使迎到綏來，表示無條件支持他恢復(fù)地方。金樹仁以內(nèi)部事務(wù)婉言謝絕。24日在塔城通電下野。各地將領(lǐng)發(fā)來電報，勸其留在塔城，與鄰邦協(xié)商，以便取得幫助，反攻省城，金樹仁以內(nèi)部矛盾，不讓外人漁利為由，皆以婉拒。并向全疆各地將領(lǐng)及行政長官發(fā)出“我不能圖一時之快，遺萬世之譏。諸君應(yīng)以地方為重，勿以我為念，黃臺之瓜，不堪再摘，望各嚴束隊伍，和衷共濟，以固邊防，而維地方”的通電后，義無反顧，瀟然離去。后假道蘇境，轉(zhuǎn)赴內(nèi)地。

是年10月，金樹仁至南昌晉謁蔣介石，繼而赴南京國民政府述職。時汪精衛(wèi)黨羽褚民誼任行政院秘書長，恨金樹仁在新疆時未以禮待，唆人控告下獄，并以金擅自與蘇聯(lián)訂立通商協(xié)定判罪。甘寧青軍政要員及士紳喇世俊、魯大昌、鄧隆、鄧寶珊、裴建準、水梓、馬鴻賓、馬步青、馬步芳、張建等20余人屢向中央政府進言為其辯護。甘寧青新各地官紳及河州各縣民眾，得悉金樹仁被羈，亦均為其表示援解。青海省主席馬麟面見蔣介石，請求釋放。當(dāng)時江寧法院雖要顧及行政院長汪精衛(wèi)的面子，不能判金無罪，又迫于各方輿論，不敢貿(mào)然判刑。同年10月10日，國民政府主席林森宣布：“金樹仁與蘇聯(lián)政府訂立臨時通商協(xié)定，是為維護地方，因以獲罪，應(yīng)予特赦�！� 獲釋后，金樹仁先寓居南京，后舉家遷至蘭州，民國30年（1941年）秋9月12日卒，終年62歲，靈骨歸葬永靖先塋。

新疆"七七政變"后，金樹仁登臺執(zhí)政，就任新疆省主席兼總司令之職。金樹仁是新疆近代歷史上一個過渡時期的重要人物 ，盡管他統(tǒng)治新疆前后不過五年 ，但卻有其自身的特殊性和復(fù)雜性。他對新疆的一些方面有所改良 ，但由于社會和自身的復(fù)雜原因很不徹底。同時為了維護自身統(tǒng)治，金樹仁政府大力擴充軍備，整軍經(jīng)武，一味使用武力，結(jié)果不但沒有達到目的，反而造成軍隊腐敗不堪，加劇政府的財政危機，社會矛盾激化，最后導(dǎo)致新疆戰(zhàn)亂頻仍、社會動蕩，加速了金樹仁政權(quán)的滅亡。

1928年，新疆發(fā)生“七七事變”，在新疆素有清譽的軍務(wù)廳長兼外交署長樊耀南被金樹仁誣陷刺殺省長楊增新于宴會。

陰險的金樹仁深知自己名望不及樊耀南，名聲不好，劣跡斑斑，又抽大煙，人稱“金槍"，為搶新疆省長大位，將樊以磔刑處死，不讓他有申辯機會。事后，他壓迫各級軍政要員會議，推舉金為省主席，地方嘩然。1933年4月22日，距“四·一二”政變金樹仁下臺才10天，新疆民眾代表就聯(lián)名致電國民黨中央黨部稱：“金樹仁曾勾結(jié)黨羽，刺殺楊督，以迅雷不及掩耳之法，即將同謀之樊耀南先行割舌，致樊某手指上蒼而無能表白。當(dāng)時株連挾嫌而遭明殺暗戕者更不勝計，遂以一手掩蓋天下之耳目�！�

金樹仁統(tǒng)治新疆期間，其政府腐敗而蠻橫，他甚至於讓楊增新好不容易才緩和下來的漢回沖突，又再度爆發(fā)了出來，造成新疆的動蕩與不安。

樊的長孫樊明莘2001年在臺灣出版《新疆三七血案真相》一書，（三七即民國17年7月7日）替祖父樊耀南鳴冤叫屈。金樹仁是殺害楊的主謀，他和軍務(wù)科長張培元及馮玉祥早先派進新疆現(xiàn)任俄文法政專門學(xué)校教務(wù)主任的張純熙三位具體組織實施了謀殺計劃。早在1923年，任西北邊防督辦的馮玉祥，為擺脫吳佩孚的羈絆，接受曹錕的旨意，試圖進軍新疆。翌年，直奉第二次開戰(zhàn)，馮玉祥倒戈，發(fā)動了震驚中外的“北京政變”，自任國民革命軍總司令。政治風(fēng)云突變，馮已無暇顧及西北，問鼎新疆的計劃也隨之夭折。

南京政府成立後，馮任國民黨第二集團軍總司令，與他的換帖拜把子兄弟蔣介石矛盾日深，馮部的幾十萬部隊受蔣介石的擠兌和限制，不供給養(yǎng)，克扣糧餉，處境十分不妙。馮玉祥萬般無奈又萌發(fā)了第二次入疆的念頭。楊增新對馮軍進疆堅決抵制，電呈南京政府，以“饑軍就全於新疆，民則必亂，到時邊民外逃，土地淪陷異邦，概不負責(zé)”為理由相要挾，拒不接受馮軍進疆，并鼓動士紳聯(lián)名寫函問南京政府請愿，以示抗議。馮派去旅長趙淼明，秘書徐之瓚前往迪化與楊交涉，楊不肯妥協(xié)，并把兩位代表抓了起來，押在督署後院，封鎖消息，隔絕和外界的一切聯(lián)系。楊增新哪里知道，馮玉祥早就留有後手，俄文法政專門學(xué)校的教務(wù)主任張純熙，就是早先馮安插在新疆迪化楊身邊的坐探，是一顆定時炸彈。此時翹首盼望兩位使者能帶來好消息的馮玉祥，接到派去的人被楊所扣的情報後，勃然大怒。為掃清進疆的這個頑固障礙，他指示張純熙聯(lián)絡(luò)張培元和金樹仁謀殺楊增新。金樹仁過去就一直嫉恨樊，和樊素有芥蒂。他知道刺殺了楊後，政界威望頗高的樊將是他上臺的致命障礙。所以他早有預(yù)謀，在殺楊後連樊一聲捎帶上，把“謀逆”的屎盆子順手扣在樊的頭上，既轉(zhuǎn)移了大家的視線，又除掉了日後順利上臺的這個障礙。這個障眼法可謂是天衣無縫。以這種說法，楊增新之死，兇手是馮玉祥、金樹仁、張培元、張純熙四人所為。

樊明莘曾訪問居留臺灣曾在新疆經(jīng)歷(三七政變)時任楊增新的俄文秘書廣祿等人.廣祿先生尊稱楊增新為"恩人",而譽先祖樊耀南為"圣人".盛贊在楊.樊二人配合下對於新疆外交內(nèi)政上的諸多貢獻;廣祿先生等學(xué)者的認同,提示與鼓勵下,更堅定為先祖平反的信念。