民國2年（1913年），侯入江蘇省立水產(chǎn)學(xué)校漁撈科就讀，民國7年畢業(yè)后去日本，先后在農(nóng)商省及日本中央氣象臺為水產(chǎn)、海洋及氣象研究生。民國11年初回國，任廈門集美水產(chǎn)航海學(xué)校教務(wù)主任代理校務(wù)；民國14～18年，任江蘇省立水產(chǎn)學(xué)校、國立中央大學(xué)農(nóng)學(xué)院水產(chǎn)學(xué)校校長兼遠(yuǎn)洋漁業(yè)�？浦魅�；民國19～36年歷任國民政府農(nóng)礦部、實業(yè)部、經(jīng)濟(jì)部、農(nóng)林部及江蘇省農(nóng)礦廳、實業(yè)廳技正、設(shè)計委員、漁業(yè)科長、參事、漁業(yè)專門委員會主任委員等職。在此期間，先后兼任江浙區(qū)漁業(yè)改進(jìn)委員會常務(wù)委員，上海魚市場常務(wù)委員、常務(wù)理事、理事，青島漁鹽實驗區(qū)主任委員、國貨審查技師、審查委員，敵貨審查委員會常務(wù)委員，農(nóng)業(yè)復(fù)員委員會委員等職；民國36年，任上海市吳淞水產(chǎn)�？茖W(xué)校校長、教授；1949年5月，上海解放后歷任上海市吳淞水產(chǎn)專科學(xué)校校長，上海水產(chǎn)專科學(xué)校副校長、教授，上海水產(chǎn)學(xué)院副教務(wù)長、教授兼海洋漁業(yè)系主任。1949年8月，為上海市各界代表會議代表。

侯朝海在國民政府農(nóng)礦部工作時，主管漁業(yè)技術(shù)與行政，十分關(guān)心水產(chǎn)教育。民國20年，他在《中國建設(shè)》發(fā)表題為《中央及各省應(yīng)有之水產(chǎn)教育設(shè)施》一文，闡述水產(chǎn)教育對發(fā)展中國漁業(yè)的重要性，并強(qiáng)調(diào)要加強(qiáng)漁民教育，培養(yǎng)漁民子弟成為水產(chǎn)專門技術(shù)人才，還提出為補中國師資不足，聘用歐洲專家擔(dān)任教師，并可以“謀抵制東鄰侵漁之方策”。

民國22年，為籌建上海魚市場，侯朝海以實業(yè)部江浙區(qū)漁業(yè)改進(jìn)委員會常務(wù)委員身份，率設(shè)計委員及建筑師3人，去日本考察。返滬后寫出詳細(xì)考察報告。民國23年6月20日，侯朝海以實業(yè)部主辦漁業(yè)行政的身份，在中國國民黨中央黨部廣播無線電臺作題為《我國漁業(yè)概況與漁政設(shè)施方案》的演講。闡述漁業(yè)與國防、民生的關(guān)系；列舉近20年中國水產(chǎn)品大量入超，民國21年，入超白銀1520萬關(guān)平兩；列舉日本多年對中國侵漁，甚至舉行中國東海、黃海、渤海漁業(yè)會議，僅上海一港日本漁輪年進(jìn)出港1000多艘次，影響中國國防和民生；痛惜中國漁業(yè)衰落，漁村瀕于破產(chǎn)，漁業(yè)前途危險。

抗日戰(zhàn)爭期間，侯朝海先后在重慶國民政府經(jīng)濟(jì)部、農(nóng)林部任職時，仍不忘水產(chǎn)教育，用自己薪金收入，借合川國立二中開辦水產(chǎn)班�？谷諔�(zhàn)爭勝利后回到上海，為恢復(fù)吳淞水產(chǎn)�？茖W(xué)校竭盡全力。學(xué)校成立后任校長，但學(xué)校經(jīng)費拮據(jù)，常以省下薪金接濟(jì)貧苦學(xué)生，并以樂觀精神鼓舞、團(tuán)結(jié)師生共渡難關(guān)。1949年上海解放前夕，侯聯(lián)絡(luò)上海中等以上學(xué)校校長組成校長聯(lián)席會議，侯被推為臨時主席，他組織有關(guān)院校師生，為迎接中國人民解放軍進(jìn)入上海市區(qū)積極做好準(zhǔn)備。當(dāng)時，吳淞水產(chǎn)專科學(xué)校的學(xué)生被困在定海島（今復(fù)興島），他冒著危險孤身在夜間步行穿越封鎖線進(jìn)島，帶領(lǐng)全體學(xué)生安全撤到市區(qū)妥善安置。1950年朝鮮戰(zhàn)爭爆發(fā)，他鼓勵青年學(xué)生參軍參干，投身抗美援朝、保家衛(wèi)國。1952年上海水產(chǎn)學(xué)院成立，他在校（院）任職期間，為提高教學(xué)質(zhì)量，四出訪問，延聘著名專家到校任教。

上海水產(chǎn)大學(xué)校友會為紀(jì)念侯朝海對發(fā)展水產(chǎn)教育事業(yè)作出的貢獻(xiàn)，于1989年11月成立侯朝海獎學(xué)金基金會，從1990年開始頒發(fā)侯朝海獎學(xué)金。