1994-1998：浙江農(nóng)業(yè)大學(xué)（現(xiàn)浙江大學(xué)）土壤農(nóng)化系，博士（課程）。

1995-1998：國際水稻研究所土壤與水科學(xué)系，博士（論文）。

1985-1988：浙江農(nóng)業(yè)大學(xué)土壤農(nóng)化系，碩士。

1979-1983：浙江農(nóng)業(yè)大學(xué)土壤農(nóng)化系，學(xué)士。

2004-至今：中國農(nóng)業(yè)大學(xué)教授，博士生導(dǎo)師。

2002-2004：德國馬普學(xué)會陸地微生物學(xué)研究所，客座研究員。

2000-2002：日本名古屋大學(xué)農(nóng)學(xué)院，日本科技振興協(xié)會特別研究員。

1999：國際水稻研究所，聯(lián)合國發(fā)展計劃署全球環(huán)境研究計劃項目顧問。

1988-2000：中國水稻研究所，助理研究員、副研究員。

2008-至今：國際學(xué)術(shù)刊物《FEMS Microbiology Ecology》編委

2006-至今：國際微生物生態(tài)學(xué)會雜志《Microbial Ecology》編委

2006-至今：國際微生物生態(tài)學(xué)會會員

2005-至今：中國土壤學(xué)會土壤生物與生化專業(yè)委員會委員

2005-至今：中國微生物學(xué)會會員

2004- 至今：《Microbial Ecology》、《Soil Biology and Biochemistry》、《Plant and Soil》、《Nutrient Cycling in Agroecosystems》、《生態(tài)學(xué)報》、《應(yīng)用生態(tài)學(xué)報》、《植物病理學(xué)報》和《植物營養(yǎng)學(xué)報》等雜志評審人

2006年獲國務(wù)院政府特殊津貼

2006年獲國家自然科學(xué)基金委員會杰出青年基金資助

2006年入選教育部新世紀(jì)優(yōu)秀人才支持計劃

2006年獲北京市“教育創(chuàng)新標(biāo)兵”稱號

2002年獲德國馬普學(xué)會博士后獎學(xué)金

2000年獲日本科技振興協(xié)會特別研究員獎學(xué)金

1999年獲浙江省科技進步二等獎

1995年獲菲律賓國際水稻研究所博士研究生獎學(xué)金

2017年8月1日，陸雅海入圍2017年中國科學(xué)院院士增選初步候選人名單。

l 分子微生物生態(tài)和環(huán)境基因組學(xué)

l 環(huán)境微生物多樣性與生態(tài)功能

l 環(huán)境物質(zhì)轉(zhuǎn)化的微生物學(xué)機理

l 本科生《環(huán)境微生物學(xué)》

l 碩士研究生《環(huán)境微生物與分子生態(tài)學(xué)》

l 博士生《資源環(huán)境生物技術(shù)SEMI》

2006-2011：主持中國農(nóng)大－德國馬普分子微生物生態(tài)伙伴實驗室合作項目“水稻土碳氮轉(zhuǎn)化微生物學(xué)機理”。

2007-2010：主持國家自然科學(xué)基金杰出青年基金“土壤生物學(xué)”（項目編號：40625003；經(jīng)費：200萬元）。

2008-2010：主持國家科技部高新技術(shù)863項目“多環(huán)芳烴污染土壤的根際微生物原位修復(fù)技術(shù)” （項目編號：SQ2007AA06Z329344；經(jīng)費：98萬元。

2009-2012：主持國家自然科學(xué)基金重點項目“干濕交替條件下水稻土的碳循環(huán)特征及微生物學(xué)機理”（項目編號：40830534；經(jīng)費：200萬元）。

2006.1-2008.12：主持國家自然科學(xué)基金面上項目“稻田植物殘體降解過程及其關(guān)鍵微生物種群和功能研究”（項目編號：40571080；經(jīng)費：42萬元）。

2004.10-2007.9：主持中國農(nóng)業(yè)大學(xué)人才基金“土壤微生物分子生態(tài)和環(huán)境生物技術(shù)”（項目編號：10022521；經(jīng)費：100萬元）。

2004.10-2006.12：主持農(nóng)業(yè)部948重大國際合作項目子課題“養(yǎng)分資源綜合管理的土壤微生物生物技術(shù)”（項目編號：2003-Z53；經(jīng)費：15萬元）。

2004.10-2006.12： 德國馬普學(xué)會陸地微生物學(xué)研究所合作研究項目“水稻根際甲烷氧化細(xì)菌的穩(wěn)定同位素探針研究”（項目編號：DFG395；經(jīng)費：20萬元）。 2002.6-2004.10：德國馬普學(xué)會陸地微生物學(xué)研究所客座研究員獎學(xué)金項目。從事水稻根際微生物群落結(jié)構(gòu)、生態(tài)功能和生物多樣性研究。

2000.5-2002.5：日本名古屋大學(xué)農(nóng)學(xué)院，日本科技振興協(xié)會特別研究員獎學(xué)金項目。從事水稻光合碳循環(huán)及微生物機理研究。

1999.3-1999.12：參加國際水稻研究所聯(lián)合國發(fā)展計劃署全球環(huán)境研究基金項目“亞洲地區(qū)稻田甲烷釋放研究”（ 編號：GLO/91/631；總經(jīng)費：600萬美元）。

1999.1-2002.1：主持浙江省自然科學(xué)基金“水稻根釋放碳激發(fā)稻田甲烷產(chǎn)生及釋放的研究”（編號：498011；經(jīng)費：4萬元）。

1993.1-1999.12：參加國際水稻研究所聯(lián)合國發(fā)展計劃署全球環(huán)境研究合作項目“亞洲地區(qū)稻田甲烷釋放研究”（編號：GLO/91/631；總經(jīng)費：600萬美元）。

1985.4-1989.12：參加浙江省u2018八五u2019攻關(guān)課題“稻田以水帶氮深施技術(shù)”項目。

德國馬普學(xué)會陸地微生物學(xué)研究所Conrad教授；

德國國家生物技術(shù)研究中心Abraham教授；

荷蘭生態(tài)研究院陸地生態(tài)研究中心Kowalchuk教授；

日本名古屋大學(xué)Kimura教授、Watanabe教授；

法國農(nóng)業(yè)環(huán)境研究中心Bouchez教授；

瑞典國立研究院Noll博士。

長期以來在水稻土微生物學(xué)和碳素轉(zhuǎn)化領(lǐng)域開展了一系列研究，主要學(xué)術(shù)成績是：建立了研究土壤微生物結(jié)構(gòu)和功能的穩(wěn)定同位素探針技術(shù), 解決了長期以來難以對土壤微生物進行原位研究的技術(shù)難題；發(fā)現(xiàn)一組未培養(yǎng)古菌在水田甲烷生產(chǎn)中的重要作用；揭示水稻光合同化碳被土壤微生物快速利用的現(xiàn) 象；量化了水稻光合同化碳在地上和地下部的分配規(guī)律。共發(fā)表SCI論文15篇，其中第一作者12篇；2001年以來發(fā)表SCI論文8篇，第一作者7篇，1 篇發(fā)表在美國《Science》雜志，2001年以來被SCI總引用117次，他引97次。

（一）土壤微生物研究方法取得突破

土壤微生物是土壤最活躍的成分，但長期以來土壤微生物常常被看作是一個“黑匣子”，缺乏有效研究方法是對土壤微生物深入研究的主要障礙。我們以穩(wěn)定同位素示蹤技術(shù)為主要研究手段，結(jié)合環(huán)境微生物研究技術(shù)的最新進展，在水稻根際微生物研究方法上取得了突破性進展。

自上世紀(jì)90年代以來，通過用16S rRNA基因等分子生物技術(shù)手段，土壤微生物學(xué)家發(fā)現(xiàn)土壤中99%以上微生物難以用傳統(tǒng)分離培養(yǎng)方法研究，因此，對土壤微生物的研究十分依賴于研究方法的 創(chuàng)新。2000年英國學(xué)者在《Nature》首次報道了用DNA指紋分析與穩(wěn)定同位素示蹤技術(shù)相結(jié)合的方法研究土壤甲基氧化細(xì)菌，該方法成為原位連接土壤 微生物種群結(jié)構(gòu)和功能的有力工具。但該方法自面世以來基本都只在實驗室進行穩(wěn)定同位素的富集標(biāo)記，缺乏真正的“原位研究”意義，它們在原位應(yīng)用碰到的最大 困難是同位素稀釋和微生物種群之間的交叉標(biāo)記。我們針對上述困難進行了一系列技術(shù)改進，通過增加脈沖標(biāo)記次數(shù)解決了同位素標(biāo)記不足的問題，通過設(shè)立平行的 非標(biāo)記處理以效正交叉標(biāo)記的影響，最終在“水稻－土壤－微生物”原位系統(tǒng)取得突破（圖1）。研究結(jié)果發(fā)表在美國《Science》雜志后得到了國際同行的 廣泛關(guān)注和高度評價，美國微生物科學(xué)院理事（Fellow of the American Academy of Microbiology）、歐盟微生物學(xué)會雜志《FEMS Microbiology Ecology》主編 Prosser教授指出：“學(xué)術(shù)界過去對u2018植物－土壤微生物u2019的相互作用進行了大量研究，但主要問題沒有解決，現(xiàn)在，穩(wěn)定同位素探針技術(shù)提供了解決這些問 題的途徑”。德國馬普學(xué)會的Friedrich教授也指出“Lu和Conrad跟蹤了植物光合碳進入水稻根際產(chǎn)甲烷古菌的過程，是一項完美的RNA穩(wěn)定同 位素探針研究”。

（二）發(fā)現(xiàn)一組尚未培養(yǎng)的新古菌在水田甲烷生產(chǎn)中重要作用

通過用RNA穩(wěn)定同位素探針技術(shù)，我們發(fā)現(xiàn)水稻光合同化碳通過 根系分泌作用很快進入土壤，并使一組未培養(yǎng)古菌（暫名為RC-I）獲得顯著13C標(biāo)記，研究揭示了這類古菌在水稻根際碳轉(zhuǎn)化和甲烷生產(chǎn)中的關(guān)鍵作用。為進 一步理解RC-I古菌的生理生態(tài)特性，我們又用DNA穩(wěn)定同位素探針技術(shù)研究了根表面的古菌活性對H2濃度的響應(yīng)，結(jié)果證實RC-I古菌在水稻根際的 CO2還原和甲烷生產(chǎn)過程中起主要作用，并且在自然的低H2條件下特別活躍。RC-I古菌是一類尚未分離培養(yǎng)的產(chǎn)甲烷古菌，自1998年最早在意大利水稻 土被發(fā)現(xiàn)后，已經(jīng)在全球各地的水稻土、泥炭土、湖泊沉積物和污染水體等環(huán)境中被檢測到，其廣泛分布性暗示它們在全球碳轉(zhuǎn)化過程中可能起重要作用。但因為 RC-I古菌非常難以分離培養(yǎng)，至今學(xué)術(shù)界對這類新古菌區(qū)系的生理生態(tài)特性的理解非常有限。我們分別用RNA和DNA穩(wěn)定同位素探針技術(shù)在原位條件下，發(fā) 現(xiàn)了它們在水稻根際的產(chǎn)甲烷功能和生理生態(tài)特性。研究結(jié)果發(fā)表在《Science》和《Environmental Microbiology》后，引起了國際學(xué)術(shù)界的廣泛關(guān)注和評論。馬普學(xué)會的Friedrich教授指出：“活躍于厭氧環(huán)境的產(chǎn)甲烷古菌目前還非常難以 分離和培養(yǎng)，Lu等（2005）用DNA穩(wěn)定同位素探針技術(shù)發(fā)現(xiàn)RC-I古菌在自然的低氫濃度下特別活躍，用RNA穩(wěn)定同位素探針技術(shù)，他們進一步證實在 水稻根際原位環(huán)境中，RC-I古菌在利用植物來源性碳生成甲烷的過程中起了主要作用，這些關(guān)于RC-I古菌的生態(tài)生理特性的重要發(fā)現(xiàn)為將來分離培養(yǎng)它們提 供了重要線索”。英國Whiteley教授評論指出：“通過對水稻進行13C-CO2脈沖標(biāo)記，Lu和Conrad（2005）證明目前尚未培養(yǎng)的RC- I古菌能利用最新的水稻光合產(chǎn)物。該工作堪稱是一項理想巧妙的RNA穩(wěn)定同位素研究，其重要價值在于指出了RC-I古菌可能在全球甲烷排放中起重要作用 ”。Prosser教授指出：“Lu和Conrad（2005）用RNA穩(wěn)定同位素探針技術(shù)在水稻根際發(fā)現(xiàn)RC-I古菌的產(chǎn)甲烷功能后，又用DNA穩(wěn)定同 位素探針技術(shù)在離體水稻根系辨別了不同生理型的產(chǎn)甲烷古菌區(qū)系，這項研究證明了穩(wěn)定同位素探針技術(shù)在原位研究不同生理特性微生物區(qū)系的功能上具有很大潛力 ”。

（三）發(fā)現(xiàn)革蘭陰性細(xì)菌和革蘭陽性的梭菌簇在水稻根際碳循環(huán)中的重要作用

磷酯脂肪酸（PLFA）分析技術(shù)是研究土壤微生物種群多樣性 的有效手段之一。我們用該方法測定了水稻光合同化碳被不同土壤微生物種群利用的規(guī)律（Lu等2004a）。水稻植株經(jīng)13CO2脈沖標(biāo)記后，提取根際土壤7,w7, 18:1w樣品，用高精確度的GC-C-IRMS系統(tǒng)定量分析13C標(biāo)記的磷酯脂肪酸指紋圖譜。結(jié)果發(fā)現(xiàn)直鏈單不飽和脂肪酸（16:1 9）受到13C顯著標(biāo)記，這類脂肪酸代表革蘭陰性細(xì)菌和革蘭陽性的梭菌簇（Clostridia），表明這兩類細(xì)菌在水稻根際碳循環(huán)中起主要作18:1 用。英國Evershed教授撰文指出：“Lu等（2004a）的研究提供了植物與微生物相互作用的有力證據(jù)，并清楚展示了13C標(biāo)記方法在植物與土壤微 生物相互作用研究領(lǐng)域的應(yīng)用前景”。

（四）量化了水稻光合同化碳對土壤微生物量的貢獻

用穩(wěn)定同位素示蹤技術(shù)結(jié)合微生物量測定的經(jīng)典方法 （氯仿熏蒸法），我們定量分析了水稻光合同化碳對土壤微生物量的貢獻（Lu等2002a），結(jié)果發(fā)現(xiàn)光合產(chǎn)物向土壤微生物量快速轉(zhuǎn)移的現(xiàn)象，并發(fā)現(xiàn)水稻種 植一季后植物對微生物量的貢獻約占總微生物量的三分之一。該研究證明了土壤微生物活動與植物光合作用的緊密關(guān)系，為量化水稻土微生物量的動態(tài)變化提供了理 論基礎(chǔ)。

（五）揭示了水稻光合同化碳在地上與地下不同碳庫的分配規(guī)律

植物光合同化碳在地上－地下部的分配規(guī)律是理解地上與地下（土壤）生 命相互作用的關(guān)鍵，通過對國際上常用的同位素連續(xù)標(biāo)記法和脈沖標(biāo)記法進行整合改進，發(fā)現(xiàn)水稻向土壤輸入的光合產(chǎn)物隨植物生長而減少（Lu等2002b）， 但水稻光合同化碳對土壤水溶性有機碳和微生物量的貢獻在水稻生長中期出現(xiàn)最大值 (Lu等2002a, 2004b)。該研究為全面理解水稻光合同化碳在“植物－土壤”系統(tǒng)不同碳庫的循環(huán)轉(zhuǎn)化提供了理論基礎(chǔ)。

（六）發(fā)現(xiàn)水稻根際活躍的甲烷氧化菌

用穩(wěn)定同位素探針技術(shù)首次在田間條件下研究了氮肥對水稻根際甲烷氧化菌群落和功能的影響，發(fā)現(xiàn)I型甲烷氧化菌在水稻根際起主要作用，其甲烷氧化功能不受氮肥使用的影響（Qiu等2008）。

（七）揭示了水稻植物殘體降解過程中產(chǎn)甲烷古菌的動態(tài)變化及關(guān)鍵調(diào)控因子

在厭氧培養(yǎng)條件下，詳細(xì)比較了秸稈和根系殘體的降解過程，用克隆、測序和T-RFLP指紋分析技術(shù)研究了降解過程中產(chǎn)甲烷古菌的動態(tài)變化以及培養(yǎng)溫度的影 響，發(fā)現(xiàn)培養(yǎng)體系中產(chǎn)甲烷古菌的主要底物H2和乙酸濃度是調(diào)控產(chǎn)甲烷古菌群落結(jié)構(gòu)的關(guān)鍵因子；從理論上揭示了產(chǎn)甲烷古菌在田間條件下動態(tài)變化的機理 （Peng等2008）。

參加相關(guān)國際學(xué)術(shù)會議15次，其中在根際微生物方面被邀請作口頭報告6次：

1、 第15屆國際植物營養(yǎng)大會， 2005年9月14-15 日，中國北京， “Detecting the active prokaryotes in the plant rhizosphere using stable isotope probing”。

2、第二屆微生物環(huán)境基因組學(xué)國際會議，2005年6月12-15日，中國上海，“Stable isotope probing of active prokaryotes on rice roots”。

3、第一屆國際根際大會，2004年9月12-17日，德國慕尼黑，“Acetogenic bacteria on rice roots identified by stable isotope probing”。

4、日本土壤與肥料學(xué)會年會，2002年4月2-4日，日本名古屋，“ Distribution and microbial utilization of photosynthesized carbon in a rice paddy”。

5、 日本土壤與肥料學(xué)會年會，2001年4月2-4日，日本高知， “Distribution of photosynthetically fixed C in irrigated rice: I. Contribution to soil dissolved organic C and microbial biomass”。

6、國際水田甲烷排放研討會，1998年8月21-26 日，中國北京，“The role of root-derived carbon on methane production and emission from rice paddy”。

[1] Chen Y, L Wu, R Boden, A Hillebrand, D Kumaresan1, H Moussard, M Baciu, Y Lu, JC Murrell. 2009. Life without light: microbial diversity and evidence of sulfur- and ammonium-based chemolithotrophy in Movile Cave. The ISME Journal 3:1094 u2013 1104. (shared first author)

[2] Qiu Q, R Conrad, Y Lu*. 2009. Cross feeding of methane carbon among bacteria on rice roots revealed by DNA-stable isotope probing. Environmental Microbiology Reports 1:355 u2013 361.

[3] Rui J, J Peng, Y Lu*. 2009. Succession of bacterial populations during plant residue decomposition in rice field soil. Applied & Environmental Microbiology 75: 4879-4886.

[4] Wang Y, X Ke, L Wu, Y Lu*. 2009. Community composition of ammonia-oxidizing bacteria and archaea in rice field soil as affected by nitrogen fertilization. Systematic & Applied Microbiology 32: 27-36.

[5] Wu L, K Ma, Y Lu*. 2009. Prevalence of betaproteobacterial sequences in nifH gene pools associated with roots of modern rice cultivars. Microbial Ecology 57: 58-68.

[6] Wu L, K Ma, Y Lu*. 2009. Rice roots select for type I methanotrophs in rice field soil. Systematic & Applied Microbiology 32: 421-428

[7] Wu L, K Ma, Q Li, X Ke, Y Lu*. 2009. Composition of archaeal community in a paddy field as affected by rice cultivar and N fertilizer. Microbial Ecology 58:819 u2013 826.

[8] Yuan Q, Y Lu*. 2009. Response of methanogenic archaeal community to nitrate addition in rice field soil. Environmental Microbiology Reports 1:362 u2013 269.

[9] Yuan Y, R Conrad, Y Lu*. 2009. Responses of methanogenic archaeal community to oxygen exposure in rice field soil. Environmental Microbiology Reports 1:347 u2013 354.

[10] Fan F, F Zhang, Z Qu, Y Lu*. 2008. Plant carbon partitioning below ground in the presence of different neighboring species. Soil Biology & Biochemistry 40:2266-2272.

[11] Peng J, Z Lü, J Rui, Y Lu*.2008. Dynamics of the methanogenic archaeal community during plant residue decomposition in an anoxic rice field soil. Applied & Environmental Microbiology 74:2894-2901.

[12] Qiu Q, M Noll, W-R Abraham, Y Lu, R Conrad. 2008. Applying stable isotope probing of phospholipid fatty acids and rRNA in a Chinese rice field to study activity and composition of the methanotrophic bacterial communities in situ. The ISME Journal 2:602-614.

[13] Yang L, FS Zhang, RZ Mao, XT Ju, XB Cai, Y Lu*. 2008. Conversion of Natural Ecosystems to Cropland Increases the Soil Net Nitrogen Mineralization and Nitrification in Tibet. Pedosphere 18:699-706.

[14] Lu Y, W-R Abraham, R Conrad. 2007. Spatial variation of active microbiota in the rice rhizosphere revealed by in situ stable isotope probing of phospholipid fatty acids. Environmental Microbiology 9:474-481.

[15] Lu Y, D Rosencrantz, W Liesack, R Conrad. 2006. Structure and activity of bacterial community inhabiting rice roots and the rhizosphere. Environmental Microbiology 8: 1351-1360.

[16] Lu Y, R Conrad. 2005. In situ stable isotope probing of methanogenic archaea in the rice rhizosphere. Science 309:1088-1090.

[17] Lu Y, T Lueders, MW Friedrich, R Conrad. 2005. Detecting active methanogenic populations on rice roots using stable isotope probing. Environmental Microbiology 7:326-336.

[18] Lu Y * , J Murase, A Watanabe, A Sugimoto, M Kimura. 2004. Linking microbial community dynamics to rhizosphere carbon flow in a wetland rice soil. FEMS Microbiology Ecology 48:179-186.

[19] Lu Y * , A Watanabe, M Kimura. 2004. Contribution of plant photosynthates to dissolved organic carbon in a flooded rice soil. Biogeochemistry 71:1-15.

[20] Kimura M, J Murase, Y Lu. 2004. Carbon cycling in rice field ecosystems in the context of input, decomposition and translocation of organic materials and the fates of their end products (CO2 and CH4). Soil Biology & Biochemistry 36: 1399-1416. (review)

[21] Lu Y * ,A Watanabe, M Kimura. 2003. Carbon dynamics of rhizodeposits, root- and shoot-residues in a rice soil. Soil Biology & Biochemistry 35:1223-1230.

[22] Lu Y * ,A Watanabe, M Kimura. 2002. Input and distribution of photosynthesized C in a flooded rice soil. Global Biogeochemical Cycles 16: article no. 1085, doi:10.1029/2002GB001864.

[23] Lu Y * ,A Watanabe, M Kimura. 2002. Contribution of plant-derived carbon to soil microbial biomass dynamics in a paddy rice microcosm. Biology & Fertility of Soils 36(2):136-142.

[24] Lu Y * ,JRM Arah, R Wassmann and HU Neue. 2000. Simulation of methane production in anaerobic rice soils by a simple two-pool model. Nutrient Cycling in Agroecosystems 58:277-284.

[25] Lu Y * ,R Wassmann, HU Neue and C Huang. 2000. Dynamics of dissolved organic carbon and methane emissions in a flooded rice soil. Soil Science Society of America Journal 64:2011-2017.

[26] Lu Y * ,R Wassmann, HU Neue and C Huang. 2000. Dissolved organic carbon and methane emissions from a rice paddy fertilized with ammonium and nitrate. Journal of Environmental Quality 29:1733-1740.

[27] Lu Y,R Wassmann, HU Neue, C Huang and CS Bueno. 2000. Methanogenic responses to exogenous substrates in anaerobic rice soils. Soil Biology & Biochemistry 32:1683-1690.

[28] Lu WF, W Chen, BW Duan, WM Guo, Y Lu,RS Lantin, R Wassmann, HU Neue. 2000. Methane emissions and mitigation options in irrigated rice fields in southeast China. Nutrient Cycling in Agroecosystems 58:65-73.

[29] Wassmann R, RS Lantin, HU Neue, LV Buendia, TM Corton and Y Lu.2000. Characterization of methane emissions from rice fields in Asia. III. Mitigation options and future research needs. Nutrient Cycling in Agroecosystems 58:23-36.

[30] Lu Y, R Wassmann, HU Neue and C Huang. 1999. Impact of phosphorus supply on root exudation, aerenchyma formation and methane emission of rice plants. Biogeochemistry 47:203-218.

2015年7月31日，入選中國科學(xué)院院士增選初步候選人名單。