男，1943年2月生，江蘇高郵人，國家級重點學科中醫(yī)基礎(chǔ)理論學科帶頭人，現(xiàn)任北京中醫(yī)藥大學博士生導(dǎo)師、北京中醫(yī)藥大學學術(shù)委員會委員、中醫(yī)體質(zhì)與生殖醫(yī)學研究中心主任，享受國務(wù)院特殊津貼的有突出貢獻專家，國家人事部、衛(wèi)生部、中醫(yī)藥管理局遴選的全國第二、三批五百名著名老中醫(yī)之一。還擔任全國科學技術(shù)名詞審定委員會中醫(yī)藥名詞審定委員會委員，國家自然科學基金會委員評審專家，中華醫(yī)學會醫(yī)療事故技術(shù)鑒定專家?guī)斐蓡T，中國醫(yī)師協(xié)會理事，中華中醫(yī)藥學會常務(wù)理事，中華中醫(yī)藥學會體質(zhì)分會主任委員，國際體質(zhì)研究會主席，中華中醫(yī)藥學會臨床藥物評價專家委員會副主任委員，國家中醫(yī)藥管理局優(yōu)秀中醫(yī)臨床人才研修項目專家指導(dǎo)委員會委員，中國性學會常務(wù)理事、《中國性科學》副主編等職。2014年10月30日，人力資源和社會保障部、國家衛(wèi)生計生委和國家中醫(yī)藥管理局共同在京舉辦第二屆國醫(yī)大師表彰大會，授予王琦等29人“國醫(yī)大師”榮譽稱號，享受省部級先進工作者和勞動模范待遇。

作為男科學的創(chuàng)始人、學科帶頭人，主編出版了我國第一部男科系統(tǒng)專著《中醫(yī)男科學》，將男科分化成一門獨立的臨床學科。此后又主編出版了在男科發(fā)展史上具有重要意義的《中華中醫(yī)男性學叢書》、《王琦男科學》等多部專著。由他創(chuàng)立的“陽痿從肝論治”等理論，帶來了男科疾病診治的重大變革。王琦教授是一位飲譽中外的名醫(yī)，對男性性功能障礙、男性不育、前列腺疾病等具有豐富的臨床經(jīng)驗，研制了我國治療勃起功能障礙的國家新藥“疏肝益陽膠囊”和治療男性不育新藥“黃精贊育膠囊”，獲得兩項發(fā)明專利。

還創(chuàng)建了中醫(yī)體質(zhì)學，主編出版了第一部中醫(yī)體質(zhì)學專著《中醫(yī)體質(zhì)學說》，對過敏體質(zhì)與肥胖體質(zhì)的研究達到了國內(nèi)外先進水平。由王琦教授主持的研究中醫(yī)腹診的衛(wèi)生部課題，挽救了我國瀕臨失傳的寶貴診療方法--腹診，在中日醫(yī)學界產(chǎn)生巨大影響。其有關(guān)男科、體質(zhì)、腹診的研究成果均被載入新中國40年及50年中醫(yī)藥科技成就。還確立了中醫(yī)藏象學這一中醫(yī)基礎(chǔ)理論的重要學術(shù)地位。

先后獲各種獎項16項，主編《中醫(yī)男科學》、《王琦男科學》、《中醫(yī)體質(zhì)學》、《中國腹診》、《中醫(yī)藏象學》等醫(yī)學專著40余部，發(fā)表論文500余篇，培養(yǎng)博士后、博士生、碩士生、學術(shù)經(jīng)驗繼承人共23名。多次應(yīng)邀赴亞、歐、美洲等國家、地區(qū)講學。中央電視臺“東方之子”、《人民日報》、《新華社》等海內(nèi)外50多家新聞媒體對其作了報道。

擅長治療過敏性疾病、脂肪肝、高脂血癥、抑郁癥、尿毒癥、內(nèi)分泌失調(diào)、糖尿病、膽石癥、尿路系統(tǒng)結(jié)石癥。對膽囊炎、慢性胃炎、偏頭痛、頑固性失眠、不孕癥、不育癥、急慢性前列腺炎、前列腺增生癥、對男性性功能障礙等療效顯著。

《中醫(yī)男科學》，《中華中醫(yī)男性學叢書》、《王琦男科學》，《中醫(yī)體質(zhì)學說》，《九種體質(zhì)使用手冊》（北京磨鐵圖書有限公司策劃發(fā)行）。

2019年11月22日，當選中國工程院院士。