斐迪南二世為施蒂里亞大公卡爾二世與巴伐利亞的瑪麗亞·安娜之子，生于格拉茨。從1595年起，他接管本家族在施蒂里亞、克恩滕和卡尼鄂拉的領(lǐng)地。曾去羅馬朝圣。由于自小接受?chē)?yán)格的耶穌會(huì)教育，斐迪南二世表現(xiàn)為狂熱的天主教信徒，對(duì)宗教改革活動(dòng)持極端敵對(duì)態(tài)度；1598年他在自己的領(lǐng)地上率先壓制一切非天主教信仰。

1617年，斐迪南當(dāng)選為波希米亞國(guó)王。由于西班牙哈布斯堡王朝的明顯支持，他繼承無(wú)嗣的馬提亞斯皇帝的皇位和匈牙利王位幾乎也成定局。斐迪南頑固的宗教政策引起了新教信徒的極度不安；在登上王位后不久，斐迪南就撕毀了皇帝魯?shù)婪蚨�世頒布的在波希米亞準(zhǔn)許宗教信仰自由的敕令。很快他在波希米亞便受到來(lái)自各個(gè)社會(huì)階層的反對(duì)。

1618年5月22日，在布拉格發(fā)生了擲出窗外事件，成為波希米亞起義和整個(gè)三十年戰(zhàn)爭(zhēng)的開(kāi)端。捷克貴族宣布廢黜斐迪南二世，選舉普法爾茨選侯腓特烈五世為國(guó)王。

1619年皇帝馬提亞斯去世，斐迪南二世順利地繼承了神圣羅馬帝國(guó)的帝位和匈牙利王位。匈牙利幾乎立刻爆發(fā)了反對(duì)他的運(yùn)動(dòng)，在運(yùn)動(dòng)中斐迪南被廢黜（1620年），特蘭西瓦尼亞親王加布雷爾·貝特倫在奧斯曼帝國(guó)的支持下僭越稱(chēng)王。借助天主教聯(lián)盟（包括西班牙、波蘭和巴伐利亞）的支持，斐迪南二世著手鎮(zhèn)壓新教徒的反叛活動(dòng)。

1620年11月8日，天主教軍隊(duì)在白山戰(zhàn)役中取得勝利，徹底擊敗剛剛加冕的腓特烈五世的捷克軍隊(duì)及其支持者。腓特烈五世被迫逃往尼德蘭，他的領(lǐng)地遭到皇帝的主要后臺(tái)西班牙人的洗劫，而天主教聯(lián)盟的領(lǐng)袖之一巴伐利亞公爵馬克西米連一世則取代了他的選侯地位。同時(shí)在匈牙利，加布雷爾·貝特倫的政府也宣告倒臺(tái)，斐迪南二世重獲王位，但是反抗他的活動(dòng)一直持續(xù)到1626年。復(fù)辟的斐迪南二世著手建立天主教會(huì)在這兩國(guó)的統(tǒng)治地位：通過(guò)削弱議會(huì)的權(quán)力，他在波希米亞實(shí)際上實(shí)行的是占領(lǐng)軍統(tǒng)治。斐迪南二世下令?yuàn)W地利和波希米亞的新教徒強(qiáng)制性地皈依天主教。但是，德意志的新教王公們?cè)缭?618年即已組成抵制皇帝此種努力的新教聯(lián)盟；他們將與斐迪南二世進(jìn)行一場(chǎng)長(zhǎng)期斗爭(zhēng)。

與新教聯(lián)盟的戰(zhàn)爭(zhēng)使帝國(guó)開(kāi)支劇增。到1625年，盡管有來(lái)自西班牙和教皇的資金支援，斐迪南二世仍陷入了嚴(yán)重的財(cái)政危機(jī)。就在此時(shí)他得到了三十年戰(zhàn)爭(zhēng)中最具威力的人物之一、捷克豪族阿爾布雷希特·馮·華倫斯坦的幫助。華倫斯坦接受了帝國(guó)統(tǒng)帥的任命，附加條件是他的軍隊(duì)的維護(hù)開(kāi)支完全來(lái)自他個(gè)人和在戰(zhàn)斗中的劫掠。很快他組建起一支至少30,000人的隊(duì)伍，并與天主教聯(lián)盟軍隊(duì)的總指揮官蒂利伯爵協(xié)同作戰(zhàn)。華倫斯坦用這支軍隊(duì)在西里西亞和安哈爾特打敗了新教聯(lián)盟和魯莽地介入的丹麥。

華倫斯坦和蒂利伯爵的一系列勝利使斐迪南二世得以在國(guó)內(nèi)大力推行反動(dòng)政策。他于1626年鎮(zhèn)壓了上奧地利農(nóng)民起義，然后在1629年頒布了所謂歸還教產(chǎn)敕令。根據(jù)該敕令，自1552年以來(lái)被世俗挪用的所有天主教會(huì)財(cái)產(chǎn)都須無(wú)條件歸還。然而，天主教勢(shì)力的擴(kuò)張最終導(dǎo)致信奉新教的瑞典國(guó)王古斯塔夫二世·阿道夫直接進(jìn)入神圣羅馬帝國(guó)。

由于來(lái)自天主教聯(lián)盟其他領(lǐng)袖、尤其是深受寵信的巴伐利亞選侯馬克西米連的猜忌，斐迪南二世于1630年解除了華倫斯坦的職務(wù)。結(jié)果在瑞典人打擊下，天主教軍隊(duì)遭到連續(xù)的慘重失敗。蒂利伯爵于1632年陣亡，迫使斐迪南二世重新起用華倫斯坦。華倫斯坦在要求更多權(quán)力并獲得滿(mǎn)足之后開(kāi)始領(lǐng)導(dǎo)軍隊(duì)。

1632年11月在關(guān)鍵的呂岑戰(zhàn)役中，雖然華倫斯坦的軍隊(duì)失敗，但瑞典人的天才領(lǐng)袖古斯塔夫二世陣亡了。接下來(lái)的發(fā)展十分戲劇化：在1633年戰(zhàn)事顯然沒(méi)有確定結(jié)果時(shí)，華倫斯坦謀求與瑞典人會(huì)談。

1634年，很可能是由于巴伐利亞的馬克西米連的慫恿，也許是斐迪南二世本人的意愿，華倫斯坦被指控叛國(guó)并被其下屬刺殺了。

1635年布拉格和約的簽署標(biāo)志著斐迪南二世的權(quán)力達(dá)到了頂峰。由于瑞典筋疲力盡和薩克森選侯約翰·喬治一世的馴服，斐迪南二世幾乎快要在整個(gè)帝國(guó)實(shí)現(xiàn)他的目的。但是迄今為止一直站在幕后的決定性力量法國(guó)的公開(kāi)介入打碎了這一夢(mèng)想。

斐迪南二世于1637年去世，他的兒子和繼承人斐迪南三世將承擔(dān)三十年戰(zhàn)爭(zhēng)的真正后果。

妻子：

·表姐巴伐利亞的瑪麗亞·安娜，1600年結(jié)婚

·埃萊奧諾拉·貢扎加，1622年結(jié)婚

子女（全部為第一個(gè)妻子所生）：