1927年參加北伐戰(zhàn)爭，任國民革命軍第十師第二十九團(tuán)政治指導(dǎo)員。

同年參加南昌起義。

1929年留學(xué)日本。

1931年九一八事變時，被推選為“中華留日同學(xué)會”主席。

1933年畢業(yè)于日本早稻田大學(xué)研究院，1934年歸國，后曾任翁源縣縣長，中山大學(xué)、東吳大學(xué)、勷勤大學(xué)的經(jīng)濟(jì)學(xué)教授，文化大學(xué)校長。

1946年春協(xié)助蔡廷鍇成立中國國民黨民主促進(jìn)會。

1948年中國國民黨革命委員會成立時當(dāng)選為第一屆中央委員。

1949年出席中國人民政治協(xié)商會議第一屆全體會議，參與制訂《共同綱領(lǐng)》、議決國徽國歌國都和第一屆中央政府人選。

秦元邦一生中雖遭遇五陷囹圄之苦，但從未改變其對民主、真理的革命追求。

建國后，歷任廣東省政府委員、省教育廳副廳長、省體委主任、省政府副秘書長兼文教辦公室主任（主管廣東省高教局、教育廳、衛(wèi)生廳、文化局、省體委等工作），民革第二至六屆中央委員、廣東省委副主任委員、中央監(jiān)察委員會常委。

著有《原始社會之土地形態(tài)的研究》（商務(wù)印書館，1946年出版）；《長行廬詩詞選》等。

1948年1月，我國著名的愛國民主人士李濟(jì)深、何香凝、馮玉祥、蔡廷鍇、張文、譚平山、柳亞子、鄧初民等在香港組織成立中國國民黨革命委員會，宣布與國民黨反動派徹底決裂，反對蔣介石，擁護(hù)共產(chǎn)黨，聯(lián)合民主黨派愛國人士，推倒蔣家皇朝，建立新中國。在廣州、上海、四川等地，紛紛設(shè)立地下機構(gòu)，開展工作。是年7月，民革廣東組織，在合浦地區(qū)吸收退役和現(xiàn)役軍人參加中國國民黨民主促進(jìn)會（簡稱民促，是中國國民黨革命委員會的組織之一），成立分會。分會籌備成立廣東合欽靈防邊區(qū)人民軍指揮部，發(fā)動合浦地區(qū)國民黨的保安隊、聯(lián)防隊反蔣起義，配合中共粵桂邊縱武裝作戰(zhàn)�？上Т耸卤慌淹饺~其潤出賣，向八區(qū)專員公署告密，王宗興等九人被專員董煜派兵逮捕，解來廣州。8月15日，民革廣州的領(lǐng)導(dǎo)人秦元邦教授和成員葉少泉、余勉群、藍(lán)其偉、楊耿森（原名楊光武）、邱忠等人因此被捕。

1949年1月，蔣介石發(fā)表元旦文告宣布下野，讓副總統(tǒng)李宗仁上臺，為緩兵之計進(jìn)行和平談判。北平國共和談，要李宗仁釋放政治犯是和談內(nèi)容之一。不久，國民黨釋放了秦元邦、葉少泉兩人，秦元邦教授和葉少泉獲釋后，即赴香港向民革組織匯報，向中共主辦的《華商報》揭發(fā)國民黨廣州當(dāng)局，秘密逮捕民主人士、愛國學(xué)生，監(jiān)禁在秘密監(jiān)獄里進(jìn)行非人道的迫害、暗殺的暴行�！度A商報》發(fā)表了《血債血償還》的評論文章，警告國民黨廣州當(dāng)局。