1964年，杜祥楚大學畢業(yè)后加入 中國人民解放軍，在 邊疆戈壁軍事基地從事國防科研計算機應用工作。他擔任了多種型號導彈飛行試驗及定型，以及多種實時控制系統(tǒng)軟件及模擬仿真軟件的總體設計和編程工作；參加了“ 兩彈一星”的實驗數(shù)據(jù)的處理和承擔了“兩彈結合”的飛行測量和數(shù)據(jù)處理任務。1977年，他獲得基地首次科技大會的嘉獎，榮立三等功。1978年，他成功設計光遙測自動化系統(tǒng)，再次榮立三等功。同年，杜祥楚加入了 中國共產(chǎn)黨。1979年—1982年，杜祥楚到瑞士學習工作三年，完成了基地新型測量系統(tǒng)的引進工作，獲得國外實時控制軟件系統(tǒng)畢業(yè)證書。他回國后，將實踐經(jīng)驗與軍隊實際應用相結合，完成了引進系統(tǒng)與原有系統(tǒng)的正確對接和全系統(tǒng)的正常運行任務，又一次榮立三等功。

1985年，杜祥楚調(diào)入 中國人民解放軍空軍指揮學院擔任教學與科研工作。他將基礎理論與高科技相結合，根據(jù)航空兵戰(zhàn)術教學的需要，開設新課程，設立新的研究生專業(yè)方向“航空兵戰(zhàn)術模擬”和“航空武器作戰(zhàn)使用”。1987年，他被評為教授級高級工程師。1988年，他開發(fā)的“HKB軍用圖形軟件包”，榮獲北京地區(qū)、軍隊院校協(xié)作中心微機開發(fā)應用優(yōu)秀成果獎。1989年，杜祥楚被授予大校 軍銜。1990年，他開發(fā)的《DSC—1多功能數(shù)據(jù)采集專用機》，榮獲空軍指揮學院優(yōu)秀科研成果獎。1992年，他開發(fā)的“PL—8格斗導彈戰(zhàn)斗使用分析研究”，榮獲全軍科技進步二等獎，并被評為學院優(yōu)秀共產(chǎn)黨員。1994年，杜祥楚被調(diào)為副軍級，并被 中國科學技術協(xié)會聘任為全國計算機專家。1995年，他開發(fā)的“塔臺基礎數(shù)據(jù)管理系統(tǒng)”榮獲全軍科技進步三等獎和空軍指揮學院二等獎；開發(fā)的“塔臺指揮自動化系統(tǒng)中定位、標圖的設計與實施方案”，榮獲空軍軍事學術研究成果三等獎。1999年，他開發(fā)的“軍民合用機場信息管理系統(tǒng)”，榮獲全軍科技進步三等獎和空軍指揮學院一等獎；開發(fā)的“航空武器裝備研制、使用系統(tǒng)的理論及應用”，榮獲空軍軍事理論研究成果三等獎。

杜祥楚在 空軍指揮學院工作期間，還擔任了一些院外學術科研工作。他曾被國防科工委聘為全國軍用共性軟件立項評審組評委，兩屆空軍科技進步成果獎評審委員；被航天部聘為研究生論文評審人和哈工大博士生論文評審人；被聘為空軍后勤部《指揮自動化系統(tǒng)》專家組組長；并多次參加了軍內(nèi)各大部及研究所有關計算機系統(tǒng)項目的評審和技術鑒定。

2001年，經(jīng)組織批準，杜祥楚退休，享受副軍級待遇。他退休后，先后被北京市工商局、北京市地方稅務局聘為信息系統(tǒng)建設專家顧問。