1964年，杜祥楚大學(xué)畢業(yè)后加入 中國人民解放軍，在 邊疆戈壁軍事基地從事國防科研計(jì)算機(jī)應(yīng)用工作。他擔(dān)任了多種型號導(dǎo)彈飛行試驗(yàn)及定型，以及多種實(shí)時控制系統(tǒng)軟件及模擬仿真軟件的總體設(shè)計(jì)和編程工作；參加了“ 兩彈一星”的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的處理和承擔(dān)了“兩彈結(jié)合”的飛行測量和數(shù)據(jù)處理任務(wù)。1977年，他獲得基地首次科技大會的嘉獎，榮立三等功。1978年，他成功設(shè)計(jì)光遙測自動化系統(tǒng)，再次榮立三等功。同年，杜祥楚加入了 中國共產(chǎn)黨。1979年—1982年，杜祥楚到瑞士學(xué)習(xí)工作三年，完成了基地新型測量系統(tǒng)的引進(jìn)工作，獲得國外實(shí)時控制軟件系統(tǒng)畢業(yè)證書。他回國后，將實(shí)踐經(jīng)驗(yàn)與軍隊(duì)實(shí)際應(yīng)用相結(jié)合，完成了引進(jìn)系統(tǒng)與原有系統(tǒng)的正確對接和全系統(tǒng)的正常運(yùn)行任務(wù)，又一次榮立三等功。

1985年，杜祥楚調(diào)入 中國人民解放軍空軍指揮學(xué)院擔(dān)任教學(xué)與科研工作。他將基礎(chǔ)理論與高科技相結(jié)合，根據(jù)航空兵戰(zhàn)術(shù)教學(xué)的需要，開設(shè)新課程，設(shè)立新的研究生專業(yè)方向“航空兵戰(zhàn)術(shù)模擬”和“航空武器作戰(zhàn)使用”。1987年，他被評為教授級高級工程師。1988年，他開發(fā)的“HKB軍用圖形軟件包”，榮獲北京地區(qū)、軍隊(duì)院校協(xié)作中心微機(jī)開發(fā)應(yīng)用優(yōu)秀成果獎。1989年，杜祥楚被授予大校 軍銜。1990年，他開發(fā)的《DSC—1多功能數(shù)據(jù)采集專用機(jī)》，榮獲空軍指揮學(xué)院優(yōu)秀科研成果獎。1992年，他開發(fā)的“PL—8格斗導(dǎo)彈戰(zhàn)斗使用分析研究”，榮獲全軍科技進(jìn)步二等獎，并被評為學(xué)院優(yōu)秀共產(chǎn)黨員。1994年，杜祥楚被調(diào)為副軍級，并被 中國科學(xué)技術(shù)協(xié)會聘任為全國計(jì)算機(jī)專家。1995年，他開發(fā)的“塔臺基礎(chǔ)數(shù)據(jù)管理系統(tǒng)”榮獲全軍科技進(jìn)步三等獎和空軍指揮學(xué)院二等獎；開發(fā)的“塔臺指揮自動化系統(tǒng)中定位、標(biāo)圖的設(shè)計(jì)與實(shí)施方案”，榮獲空軍軍事學(xué)術(shù)研究成果三等獎。1999年，他開發(fā)的“軍民合用機(jī)場信息管理系統(tǒng)”，榮獲全軍科技進(jìn)步三等獎和空軍指揮學(xué)院一等獎；開發(fā)的“航空武器裝備研制、使用系統(tǒng)的理論及應(yīng)用”，榮獲空軍軍事理論研究成果三等獎。

杜祥楚在 空軍指揮學(xué)院工作期間，還擔(dān)任了一些院外學(xué)術(shù)科研工作。他曾被國防科工委聘為全國軍用共性軟件立項(xiàng)評審組評委，兩屆空軍科技進(jìn)步成果獎評審委員；被航天部聘為研究生論文評審人和哈工大博士生論文評審人；被聘為空軍后勤部《指揮自動化系統(tǒng)》專家組組長；并多次參加了軍內(nèi)各大部及研究所有關(guān)計(jì)算機(jī)系統(tǒng)項(xiàng)目的評審和技術(shù)鑒定。

2001年，經(jīng)組織批準(zhǔn)，杜祥楚退休，享受副軍級待遇。他退休后，先后被北京市工商局、北京市地方稅務(wù)局聘為信息系統(tǒng)建設(shè)專家顧問。