隆慶四年正月初一、十五兩天，日月俱食，他借此上疏言事，請(qǐng)布德、緩刑、納諫、節(jié)用，飭大小官員關(guān)心民困。繼加官太子太保，以本官兼文淵閣大學(xué)士入閣辦事。以俺答封貢成，北部安寧，進(jìn)為少保，改為武英殿大學(xué)士。內(nèi)閣大臣高拱、張四維被御史彈劾，懷疑殷士儋所指使，遂相攻訐。一次于朝廷上竟與高拱揮拳相擊，張居正為之調(diào)解，亦被詬罵。他再次上疏，力請(qǐng)辭官，家居11年而死，贈(zèng)官太保，謚"文通"，后又改謚"文莊"。