劉士元（？-？）名魁，以字行，山東承宣布政使司東昌府高唐州（今山東省高唐縣）人，明朝政治人物、進(jìn)士出身。

正德六年，登進(jìn)士，授監(jiān)察御史，巡按京畿輔進(jìn)等地。正德十三年，明武宗在古北口行獵，講招朵顏衛(wèi)花當(dāng)、把兒孫等設(shè)宴，劉士元上疏勸阻。當(dāng)時(shí)武宗抵達(dá)河西務(wù)，指揮黃勛假意供奉而行擾民，劉士元負(fù)責(zé)按察。黃勛恐懼，于是逃到皇帝行在處，通過太監(jiān)等關(guān)系向武宗詆毀劉士元，稱其聽聞皇帝駕到，而命民間盡嫁其女，藏匿婦人。武宗聽后大怒，命其裸背捆綁面訊。當(dāng)時(shí)在野外沒有廷杖，所以取生柳束痛笞四十下，幾乎死去，放置于檻車馳入京，并一同逮捕知縣曹俊等十余人，一同下詔獄。都御史王璟及科道陳沾、牛天麟等交章論救，不予批報(bào)。隨后貶為麟山驛丞。明世宗繼位后，恢復(fù)官職，出任湖州府知府，遷湖廣副使。在任期間，他修荒政，積粟至百萬余石。嘉靖九年，接連升至右副都御史，巡撫貴州。三年后被罷免。

清·張廷玉等，《明史》（卷188）：“劉士元，彭縣人。正德六年進(jìn)士。官御史，巡按畿輔。十三年，帝獵古北口，將招朵顏衛(wèi)花當(dāng)、把兒孫等燕勞，士元陳四不可。先是，帝幸河西務(wù)，指揮黃勛假供奉擾民，士元按之。勛懼，逃赴行在，因嬖幸譖于帝，云士元聞駕至，令民間盡嫁其女，藏匿婦人。帝怒，命裸縛面訊之。野次無杖，取生柳干痛笞之四十，幾死，囚檻車馳入京。并執(zhí)知縣曹俊等十余人，同系詔獄。都御史王璟及科道陳沾、牛天麟等交章論救，不報(bào)，謫麟山驛丞。世宗立，復(fù)故官，出為湖州知府，遷湖廣副使。修荒政，積粟百萬余石。事聞，被旌勞。嘉靖九年屢遷右副都御史，巡撫貴州。居三年罷。”