2016年鉅派杯全國游泳冠軍賽暨里約奧運選拔賽，女子200米仰泳，浙江的吳奕昕以2分12秒16列在第三進入決賽。

2017年4月26日，被體育總局授予國際級運動健將稱號。

2017年6月24日，2017年全國夏季游泳錦標賽暨全運會預選賽，女子100米仰泳預賽，浙江的吳奕昕以1分01秒99排名第一，湖北的彭旭瑋以1分02秒24排名第二。女子100米仰泳決賽，浙江的吳奕昕以1分01秒77奪得亞軍。6月26日，女子200米仰泳決賽，浙江選手吳奕昕以2分11秒71獲得亞軍。

2019年1月9日，吳奕昕獲得2019年全國春季游泳錦標賽女子200米仰泳季軍。

2019年6月16日，獲2019年全國夏季游泳錦標賽暨世錦賽選拔賽女子200米仰泳第三。