1960年9月，許健民進(jìn)入南京氣象學(xué)院氣象系（2004年更名為南京信息工程大學(xué)），學(xué)習(xí)天氣與動(dòng)力氣象。

1965年8月，畢業(yè)后中央氣象局氣象科學(xué)研究所長(zhǎng)期預(yù)報(bào)研究室工作（至1969年10月）。

1969年11月，進(jìn)入中央氣象局江西五七干校工作（至1971年5月）。

1971年6月，進(jìn)入中央氣象臺(tái)工作（至1983年10月）。

1980年6月，作為訪問(wèn)學(xué)者，前往美國(guó)科羅拉多州立大學(xué)，學(xué)習(xí)大氣科學(xué)（至1982年6月）。

1983年10月，擔(dān)任國(guó)家氣象中心副主任（至1986年3月）。11月，加入中國(guó)共產(chǎn)黨。

1986年3月，擔(dān)任國(guó)家衛(wèi)星氣象中心主任、總工程師（至1996年10月）。

1987年，東北大興安嶺森林火災(zāi)期間，他主持了森林火災(zāi)實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)服務(wù)。

1991年夏季，江淮流域發(fā)生嚴(yán)重洪澇災(zāi)害，他提出了用氣象衛(wèi)星資料客觀有效地監(jiān)測(cè)洪澇。

1996年10月，擔(dān)任國(guó)家衛(wèi)星氣象中心總工程師（至2010年3月）。

1997年，當(dāng)選中國(guó)工程院院士，隸屬于環(huán)境與輕紡工程學(xué)部（應(yīng)用氣象）。

2012年6月，獲得第九屆光華工程科技獎(jiǎng)工程獎(jiǎng)。

在他主持國(guó)家衛(wèi)星氣象中心工作期間，氣象衛(wèi)星資料在火災(zāi)、水災(zāi)等自然災(zāi)害監(jiān)測(cè)評(píng)估，農(nóng)作物長(zhǎng)勢(shì)監(jiān)測(cè)評(píng)估，以及生態(tài)環(huán)境監(jiān)測(cè)等方面發(fā)揮了重要作用，取得了顯著的社會(huì)效益。許健民領(lǐng)導(dǎo)的研究組全面實(shí)現(xiàn)了風(fēng)云二號(hào)氣象衛(wèi)星圖像的實(shí)時(shí)、全自動(dòng)、像元級(jí)高精度定位，并開發(fā)出20種定量產(chǎn)品，為風(fēng)云二號(hào)衛(wèi)星觀測(cè)數(shù)據(jù)的定量應(yīng)用做出了貢獻(xiàn)。其中在大氣運(yùn)動(dòng)矢量產(chǎn)品的開發(fā)中，他提出了快速算法和在云高度指定中區(qū)分薄卷云和低云的新算法。

1970年-1986年，許健民在國(guó)家氣象中心工作期間，提出并組織實(shí)施了"實(shí)時(shí)氣象數(shù)據(jù)庫(kù)"，為中央氣象臺(tái)創(chuàng)建了熱帶天氣分析業(yè)務(wù)。1980年-1986年，許健民在國(guó)家氣象中心工作。當(dāng)時(shí)中國(guó)已參加世界天氣監(jiān)視網(wǎng)，并成為全球通訊系統(tǒng)上的一個(gè)節(jié)點(diǎn)，通過(guò)全球通訊，收集到大量氣象資料。但是由于檢索調(diào)用分發(fā)存盤的軟件沒(méi)有跟上，使用資料的研究業(yè)務(wù)人員仍舊感到用資料難。針對(duì)這種情況，許健民提出并組織人員實(shí)施完成了“實(shí)時(shí)氣象數(shù)據(jù)庫(kù)”和“氣象專用程序庫(kù)”。在此期間，撰寫出版了《用磁帶交換資料的技術(shù)》一書，對(duì)氣象人員使用中國(guó)以外資料起了積極作用。為適應(yīng)中國(guó)遠(yuǎn)程導(dǎo)彈試驗(yàn)的氣象保障任務(wù)，許健民提出在常規(guī)氣象資料十分匱乏的熱帶太平洋地區(qū)利用非常規(guī)資料進(jìn)行天氣分析，并在中央氣象臺(tái)創(chuàng)建了中國(guó)熱帶天氣分析業(yè)務(wù)。

1986年，許健民調(diào)國(guó)家衛(wèi)星氣象中心任主任后，注重研究氣象衛(wèi)星資料在天氣、氣候、自然災(zāi)害監(jiān)測(cè)和為國(guó)民經(jīng)濟(jì)建設(shè)服務(wù)等方面的應(yīng)用。1987年?yáng)|北大興安嶺森林火災(zāi)期間，他主持了森林火災(zāi)實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)服務(wù)，及時(shí)提出并采取一系列有效的技術(shù)和服務(wù)措施，及時(shí)準(zhǔn)確地為中央領(lǐng)導(dǎo)和公眾提供了大量有用的火情信息，為滅火做出了重要貢獻(xiàn)，受到國(guó)務(wù)院的表?yè)P(yáng)。1991年夏季江淮流域發(fā)生嚴(yán)重洪澇災(zāi)害，許健民提出了用氣象衛(wèi)星資料客觀有效地監(jiān)測(cè)洪澇，得出了87個(gè)縣淹沒(méi)情況和受災(zāi)嚴(yán)重程度的比較表，為國(guó)務(wù)院和民政部提供了準(zhǔn)確的水情信息，受到中國(guó)國(guó)家防洪指揮部表?yè)P(yáng)。

許健民在風(fēng)云一號(hào)氣象衛(wèi)星（極軌）和風(fēng)云二號(hào)氣象衛(wèi)星（靜止）應(yīng)用系統(tǒng)工程建設(shè)中，負(fù)責(zé)組織方案設(shè)計(jì)、進(jìn)行技術(shù)協(xié)調(diào)、組織人員攻關(guān)，他領(lǐng)導(dǎo)的研究組，解決了風(fēng)云二號(hào)氣象衛(wèi)星云圖高精度定位的難題，使風(fēng)云二號(hào)氣象衛(wèi)星圖像的定位精度達(dá)到了像元級(jí)，全面實(shí)現(xiàn)了實(shí)時(shí)、全自動(dòng)、高精度，為風(fēng)云二號(hào)衛(wèi)星觀測(cè)資料的應(yīng)用做出了貢獻(xiàn)。

截至2013年，許健民撰寫出版著作4本；翻譯出版和審核出版譯著5本。

截至2010年，許健民在南京信息工程大學(xué)（原南京氣象學(xué)院）、中國(guó)科學(xué)院研究生院等高等院校一共指導(dǎo)博士生10多名、碩士生10多名，根據(jù)中國(guó)科學(xué)技術(shù)信息研究所、國(guó)家工程技術(shù)數(shù)字研究館信息、全國(guó)圖書館參考咨詢聯(lián)盟，許健民培養(yǎng)學(xué)生情況如下：

許健民在氣象衛(wèi)星資料在火災(zāi)、水災(zāi)等自然災(zāi)害監(jiān)測(cè)評(píng)估，農(nóng)作物長(zhǎng)勢(shì)監(jiān)測(cè)評(píng)估，以及生態(tài)環(huán)境監(jiān)測(cè)等方面發(fā)揮了重要作用，取得了顯著的社會(huì)效益。他提出在云高度指定中區(qū)分薄卷云和低云的新算法，受到國(guó)際云導(dǎo)風(fēng)會(huì)議的高度評(píng)價(jià)。（中國(guó)氣象局評(píng)）

科學(xué)研究要仔細(xì)觀察自然現(xiàn)象，要思考自然界的事實(shí)為什么存在，是什么道理。如果你能把自然界存在的事實(shí)揭露出來(lái)，并說(shuō)出道理，而且所說(shuō)的事實(shí)和道理是別人從未說(shuō)過(guò)的，那么你就做出了創(chuàng)新。

實(shí)事求是的科學(xué)態(tài)度和堅(jiān)韌不拔的科學(xué)精神是非常重要的，只有具備了實(shí)事求是的科學(xué)精神才有可能觀察和理解自然，才有可能獲得科學(xué)知識(shí)。許健民認(rèn)為，傳遞科學(xué)精神比傳遞科學(xué)知識(shí)本身更重要。