淞滬會(huì)戰(zhàn)時(shí)，王晏清正在陸軍大學(xué)第十五期學(xué)習(xí)。羅卓英要王中斷學(xué)業(yè)，暫回部隊(duì)參戰(zhàn)。接到電報(bào)后，王晏清趕赴上海前線，任第十六集團(tuán)軍總司令參謀，參加了羅店戰(zhàn)役。日軍從金山衛(wèi)登陸后，國(guó)民黨部隊(duì)全面撤退，王晏清隨部退守，南京參加南京保衛(wèi)戰(zhàn)。南京失守后，王晏清回校繼續(xù)學(xué)習(xí)。

1938年任第18軍參謀處長(zhǎng)。

1939年任第18軍18師52團(tuán)團(tuán)長(zhǎng)。

1941年任第18軍11師參謀長(zhǎng)。

1942年調(diào)任中國(guó)遠(yuǎn)征軍第1路司令長(zhǎng)官部參謀處長(zhǎng)；

1943年任軍令部科長(zhǎng)，不久調(diào)任軍事委員會(huì)桂林干訓(xùn)團(tuán)教育處長(zhǎng)；

1944年11月任青年軍編練總監(jiān)部少將參謀長(zhǎng)；

1945年任青年軍第208師副師長(zhǎng)；

1948年任第87軍副軍長(zhǎng)，同年8月任第45軍97師少將師長(zhǎng)；

1949年3月24日在南京率部起義。后任解放軍南京軍事學(xué)院情報(bào)處副主任，江蘇省人民政府參事室副主任，江蘇省黃埔軍校同學(xué)會(huì)理事，南京市政協(xié)副主席，全國(guó)政協(xié)委員。

1955年被授予解放軍大校軍銜。

1992年12月12日在南京病逝。

1939年夏，彭善任第十八軍軍長(zhǎng)，從陸大畢業(yè)的王晏清任軍參謀處長(zhǎng)，隨彭善入川整訓(xùn)。1940年6月10日，第十八軍進(jìn)駐宜昌。11日拂曉，日軍從東山寺南側(cè)、東山寺以北、鎮(zhèn)鏡山以東三個(gè)方向猛烈進(jìn)攻，到中午前后，第五十二團(tuán)正面被日軍突破，敵人乘勢(shì)直撲飛機(jī)場(chǎng)，致使防守城區(qū)和效區(qū)的部隊(duì)被分割，第一線部隊(duì)腹背受敵，造成混亂，第五十四團(tuán)逃往南岸，這樣宜昌就落入日軍手中。第十八師撤回四川整補(bǔ)，第五十三團(tuán)團(tuán)長(zhǎng)唐啟琨以作戰(zhàn)不力免職，以王晏清調(diào)任。1941年，第十一師參謀長(zhǎng)王元直調(diào)任遠(yuǎn)征軍總部任參謀處長(zhǎng)，王晏清接任師參謀長(zhǎng)。1942年，王晏清隨羅卓英去遠(yuǎn)征軍，任長(zhǎng)官部參謀處長(zhǎng)。1943年，王晏清任軍令部科長(zhǎng)。不久，王晏清任軍事委員會(huì)桂林干部訓(xùn)練團(tuán)教育處長(zhǎng)。1944年11月，王晏清調(diào)任青年軍編練總監(jiān)部少將參謀長(zhǎng)。

1945年，王晏清調(diào)任中央訓(xùn)練團(tuán)教育處長(zhǎng)。后調(diào)任陸軍編練司令部西南分監(jiān)部參謀長(zhǎng)、青年軍第二0八師副師長(zhǎng)，駐防北平近郊。1948年，第二0八師改編為第八十七軍，王晏清升為副軍長(zhǎng)。

同年8月，“首都警衛(wèi)師”師長(zhǎng)趙霞升任第四十五軍軍長(zhǎng)，警衛(wèi)師師長(zhǎng)一職空缺。國(guó)民黨許多高級(jí)將領(lǐng)對(duì)此垂涎三尺，不少人不惜花費(fèi)大把大把的金條來(lái)打通關(guān)節(jié)，以圖換取此位。但國(guó)防部接連開(kāi)出的幾份候選人名單，都未能得到蔣介石的認(rèn)可。蔣經(jīng)國(guó)向其父極力推薦王晏清。不久，蔣任命王晏清為警衛(wèi)師——第九十七師師長(zhǎng)。同年9月22日，王晏清晉升陸軍少將。中共南京地下黨派陸平促王起義。陸平向他闡明了時(shí)局的發(fā)展和中共的政策，鼓勵(lì)他棄暗投明，王晏清決定起義。

1949年1月，王晏清在全師干部會(huì)上說(shuō)“現(xiàn)在雖有長(zhǎng)江天險(xiǎn)，也無(wú)必勝把握”，給全師官兵以震動(dòng)，南京衛(wèi)戍區(qū)總司令張耀明知情后，即將王晏清扣押。湯恩伯要把王晏清送老虎橋監(jiān)獄關(guān)押，南京衛(wèi)戍副總司令覃異之知情后，將王晏清放了回去。3月23日，王晏清脫險(xiǎn)回到江寧鎮(zhèn)后，立即決定以執(zhí)行軍事任務(wù)為借口把部隊(duì)拉到江北，再公開(kāi)宣布起義。會(huì)后，王晏清發(fā)布了全師當(dāng)晚“過(guò)江游擊”的命令。第二八九團(tuán)團(tuán)長(zhǎng)楊正洲和第二九0團(tuán)團(tuán)長(zhǎng)黃子安接到命令后，率兩團(tuán)官兵渡過(guò)長(zhǎng)江，到達(dá)江北岸。第二九一團(tuán)團(tuán)長(zhǎng)王義鸞上任時(shí)間不長(zhǎng)，一聽(tīng)要晚上到江北執(zhí)行軍務(wù)，不知所措，向師部請(qǐng)示，電話打不通，只好把電話打到了軍部。直到這時(shí)，第四十五軍軍部才知道王晏清果真要“反”，張耀明派飛機(jī)散發(fā)傳單，謂王晏清投共，官兵返回原防的均有重賞，割回王人頭的特賞銀元5萬(wàn)，等等。第二九0團(tuán)團(tuán)長(zhǎng)黃子安看到傳單后率部南返，第二八九團(tuán)跟著返回，王晏清帶著師部警衛(wèi)排等100多人投奔到了解放區(qū)。24日，王晏清到達(dá)滁縣，參加中國(guó)人民解放軍，受到第八兵團(tuán)司令員陳士榘、政委江渭清的接見(jiàn)。4月22日，王晏清隨解放大軍南渡長(zhǎng)江，解放南京。

中華人民共和國(guó)成立后，王晏清歷任華東軍政大學(xué)戰(zhàn)術(shù)研究室主任。同年12月，王晏清任解放軍南京軍事學(xué)院情報(bào)處副主任。1954年，王晏清任該院軍事史料研究處副處長(zhǎng)。1958年，王晏清被授予大校軍銜和二級(jí)解放勛章。當(dāng)選為南京市政協(xié)第一至六屆常委、南京市政協(xié)副主席，第六屆全國(guó)政協(xié)委員。1988年，王晏清任江蘇省人民政府參事室副主任、江蘇省黃埔軍校同學(xué)會(huì)理事。1992年12月12日，王晏清在南京病逝，終年82歲。