幼時在宣威城念小學(xué)，清光緒三十三年（1907年）考入北京陸軍小學(xué)經(jīng)濟特科班學(xué)習(xí)，加入進步團體，宣傳革命思想，受到清政府通緝。民國成立后到昆明任唐繼堯部總務(wù)官。民國7年（1918年）任丘北縣長，后任胡若愚的軍需主任，隨胡部參加援川戰(zhàn)斗。胡戰(zhàn)敗后，他攜巨款30余萬元回云南交給唐繼堯。唐認為他廉明正直，即委任為軍需處長，授少將銜。唐垮臺后，龍云多次請他出來幫助治理云南，南京政府孔祥熙以同族之誼也書信邀他到南京任職。他權(quán)衡再三，決定留在云南，任龍云的軍需處長，后任滇黔綏靖公署經(jīng)理處長，領(lǐng)中將軍銜。1942年病逝于昆明。

孔繁耀為人忠厚，生活節(jié)儉，從不講排場。對子女（4男2女）要求甚嚴，教導(dǎo)有方。他離鄉(xiāng)數(shù)十年，始終念著家鄉(xiāng)，尤其關(guān)心家鄉(xiāng)的教育事業(yè)。1934年，他得知宣威建立初級中學(xué)，即捐款捐書給學(xué)校建一樓一底土木結(jié)構(gòu)樓房3間作圖書閱覽室，稱星五圖書館。