曹炳章14歲隨父遷居紹興，進(jìn)中藥鋪學(xué)業(yè)，從名醫(yī)方曉安7年。清光緒二十八年（1902），開業(yè)行醫(yī)。

光緒三十四年，與何廉臣等創(chuàng)組紹興醫(yī)學(xué)會，編輯《紹興醫(yī)藥學(xué)報》。1913年，與何廉臣一道創(chuàng)設(shè)和濟(jì)藥局，主持日常事務(wù)，刊行《醫(yī)藥學(xué)衛(wèi)生報》，并以身作則，考正傳訛藥品，改革不良炮炙，訂正丸散方書。1927年，任《紹興醫(yī)藥月報》編輯。1929年，受神州醫(yī)藥會紹興分會及紹興中西醫(yī)協(xié)會中醫(yī)部推派，赴上海參加全國醫(yī)藥團(tuán)體總聯(lián)合會號召的聲愿大會，被推為名譽(yù)理事。同年9月，籌組成立紹興縣國醫(yī)公會，并任常務(wù)主席。提出“統(tǒng)一病名”及印編“中醫(yī)處方新衡舊稱對照表”等建議，受到醫(yī)藥界的好評。

早年隨父研習(xí)藥業(yè)并在紹興經(jīng)營藥品，后從醫(yī)師方曉安，通讀傷寒、內(nèi)科、本草等名家醫(yī)書，自設(shè)診所行醫(yī)。并發(fā)奮購天下醫(yī)書，曾搜集有達(dá)3500余種，又向北平、南京、上海、蘇州甚至到國外東瀛選購未藏之醫(yī)籍，藏書樓有“集古閣”。1935年，上海大東書局將其搜集的歷代醫(yī)學(xué)古籍，編輯成《中國醫(yī)學(xué)大成》，收書365種，1 000冊。擬將出版續(xù)集和三集，合計新舊醫(yī)學(xué)書籍4 185種，藥物考證類圖書655種，其中，孤本、珍本、明刻、清抄、明抄等及其日本舊刻本有400余種。1952年，所藏醫(yī)學(xué)書籍3400余種全部捐贈給華東軍政委員會衛(wèi)生部。

曹炳章于醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)用功尤深，1934年應(yīng)上海大東書局聘請，主編《中國醫(yī)學(xué)大成》叢書，選輯醫(yī)書365種，匯集漢唐至明清一百幾十家及日本漢醫(yī)家著述，共2082卷，輯成1000冊，皆詳加校勘，撰有作者行略與內(nèi)容提要，1937年出版。新中國成立后，任《浙江中醫(yī)藥》月刊總編輯、紹興市政協(xié)委員。

精內(nèi)、婦、兒科，尤擅喉證，熟諳藥性。博采眾長，師古不泥，常說：“古人隨證以立方，非立方以待病�！薄爸挥邪宸�，沒有板病。”臨床用藥主張加減變通，遇疑難危病，或補(bǔ)或瀉，進(jìn)退自如，每收桴鼓之效。為抵制日產(chǎn)翹胡子牌仁丹，與諸名醫(yī)聯(lián)合，研制成效佳價廉的“雪恥靈丹”。每遇出診，常徒步而去，見特困病急的，診費(fèi)免去，代付藥資。

解放后，在珍藏30余年的醫(yī)籍中，選出善本百余種，獻(xiàn)給華東衛(wèi)生部，部分著作手稿呈獻(xiàn)北京中醫(yī)研究院。

一生著述甚豐，有《鴉片戒除法》2卷，《喉痧證治要略》1卷，《秋瘟證治要略》1卷，《痰證膏丸說明書》1卷，《彩圖辨舌指南》6卷，《瘟痧證治要略》1卷，《規(guī)定藥品之商榷》2卷，《醫(yī)界新智囊》1卷。補(bǔ)注、批校、增訂的有《潛齋醫(yī)學(xué)叢書十四種》，《醫(yī)學(xué)廣筆記》4卷，《慎齋遺書》10卷，《陸氏三世醫(yī)驗》8卷，《增訂醫(yī)醫(yī)病書》2卷，《臨證醫(yī)案筆記》6卷，《增訂偽藥條辨》4卷。所存手稿，有《霍亂癥治要略》、《人參通考》、《奇病通考》、《曹氏醫(yī)藏類目》、《浙江歷代名醫(yī)傳略》等約30余種。