人物經(jīng)歷
2013年晉升為講師,2014年破格晉升為副教授。近五年發(fā)表SCI論文22篇,累積影響因子超過100,單篇最高影響因子9.202 (4篇),近五年發(fā)表的SCI論文累積引用次數(shù)超過150。主持國家自然科學(xué)基金青年項目、于維漢院士杰出青年基金、哈爾濱科技創(chuàng)新人才研究專項(青年后備人才)、中國博士后特別資助等多項課題的研究工作,作為學(xué)術(shù)骨干參加973計劃和863計劃項目各1項。擔(dān)任國家自然科學(xué)基金(重大研究計劃)通訊評審專家,擔(dān)任Molecular Biology Reports、PLoS One、Mutagenesis等多個雜志審稿人。2014年受邀在“第六屆全國生物信息學(xué)與系統(tǒng)生物學(xué)學(xué)術(shù)大會”上作專題報告,獲優(yōu)秀報告一等獎。自2008年起師從李霞教授從事生物信息學(xué)領(lǐng)域的學(xué)習(xí)和研究工作,主要研究方向為惡性腫瘤相關(guān)的非編碼RNA識別、microRNA和lncRNA相關(guān)遺傳多態(tài)研究、非編碼RNA相關(guān)生物網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建以及生物信息學(xué)軟件開發(fā)等。目前已開發(fā)了10個生物學(xué)軟件和數(shù)據(jù)庫,代表性數(shù)據(jù)庫Lnc2Cancer、LincSNP得到超過40個國家5000余次訪問,研究成果受到《Nature Reviews Genetics》、《Nature Reviews Endocrinology》等國際著名期刊的多次引用和評論。
工作經(jīng)歷
1、200309-200807:哈爾濱醫(yī)科大學(xué)生物信息學(xué)院 本科生
2、200809-201307:哈爾濱醫(yī)科大學(xué)生物信息學(xué)院 博士生
3、201307-201409:哈爾濱醫(yī)科大學(xué)生物信息學(xué)院 講師
4、201409-:哈爾濱醫(yī)科大學(xué)生物信息學(xué)院 副教授
著作譯著
1、生物信息學(xué),李霞,人民衛(wèi)生出版社,201003 |
2、生物信息學(xué)理論與醫(yī)學(xué)實踐,李霞,人民衛(wèi)生出版社,201301 |
3、生物信息學(xué),李霞,人民衛(wèi)生出版社,201401 |
成果論文
1、Lnc2Cancer: a manually curated database of experimentally supported lncRNAs associated with various ,Nucleic Acids Research,2016年1月;44(D1):D980-5,第一作者 |
2、Construction of lncRNA-mediated feed-forward loop network reveals global topological features and pr,Oncotarget,2016年6月;doi:10.18632/oncotarget.10004,第一作者 |
3、Identification of lncRNA-associated competing triplets reveals global patterns and prognostic marker,Nucleic Acids Research ,2015年4月;43(7):3478-89,并列一作 |
4、A novel re-annotating strategy for dissecting DNA methylation patterns of human long intergenic non-,Nucleic Acids Research ,2015年4月;42(13):8258-70,并列一作 |
5、A global map for dissecting phenotypic variants in human lincRNAs,Eur J Hum Genet ,2013年10月;21(10):1128-33 ,第一作者 |
6、SNP@lincTFBS: a database of polymorphisms in transcription factor binding sites of human lincRNAs,Plos One,2014年1月;doi: 10.1371/journal.pone.0103851,第一作者 |
7、LincSNP: a database for linking phenotype-associated SNPs to human large intergenic non-coding RNAs,BMC Bioinformatics,2014年5月;doi: 10.1186/1471-2105-15-152,第一作者 |
8、miRSponge: a manually curated database for experimentally supported miRNA sponges and ceRNAs,DATABASE,2015年9月;doi: 10.1093/database/bav098,通訊作者 |
9、Identification of a core miRNA-pathway regulatory network in glioma by therapeutically targeting miR,Plos One,2014年7月;doi: 10.1371/journal.pone.0101903,并列一作 |
10、mirTarPri: improved prioritization of microRNA targets through incorporation of functional genomics ,Plos One,2013年1月;doi: 10.1371/journal.pone.0053685,并列一作 |
獲獎記錄
1、2013年博士研究生國家獎學(xué)金,教育部,第一,201309 |
2、2014年“第六屆全國生物信息學(xué)大會”報告,教育部,一等獎,201406 |
3、2014年校級教師講課大賽,哈爾濱醫(yī)科大學(xué),二等獎,201408 |
4、2015年校級優(yōu)秀本科生畢業(yè)論文指導(dǎo)教師,哈爾濱醫(yī)科大學(xué),第一,201506 |
5、2015年全國數(shù)學(xué)建模競賽,中華人民共和國教育部,一等獎,201509 |