唐肅宗乾元初年，姚南仲經(jīng)科舉，登進(jìn)士第后授太子校書，歷任高陵、昭應(yīng)、萬年等縣縣尉。后遷任右拾遺，轉(zhuǎn)右補闕。大歷十三年（778），唐代宗的貞懿皇后獨孤氏去世，代宗李豫極度傷心，痛惜不已。為了紀(jì)念貞懿皇后，代宗便下詔令于都城附近建造貞懿皇后的陵墓，以便早晚可以望見于眼中。這一決定遭到不少人的置疑，姚南仲便上書疏諫，其引古論今，曉陳利害，表述得合情合理。代宗李豫覺得他反對此議的意見正確，于是準(zhǔn)奏，并嘉獎了南仲，賜緋魚袋，特別加封五品之職，宣付史館。

姚南仲與宰相常袞相善，交情很深。常袞被貶后，南仲也被下放出任海鹽縣縣令。姚南仲經(jīng)浙江東、西道觀察使韓滉薦為推官，奏授殿中侍御史，內(nèi)供奉，充支使。后詔還京都，歷任左司兵部員外，轉(zhuǎn)任郎中，升任御察中丞、給事中、同州刺史、陜虢觀察使等職。

貞元十五年(799)，姚南仲代李復(fù)為義成軍節(jié)度使，監(jiān)軍薛盈珍恃權(quán)乘勢奪軍權(quán)，姚南仲成為他的阻礙，以致多次遭到薛盈珍的誣陷讒毀。因此，唐德宗對姚南仲懷疑很深。

姚南仲幕府里有個叫崔位的，因為薛盈珍的詆毀，被外調(diào)到出遂州做別駕。東川觀察使王叔邕希旨逢迎，借故殺之。又外調(diào)一個叫馬少微的補缺，宦官護(hù)送時渡江時將其投入水中溺死。

貞元十六年(800)，薛盈珍派小使程務(wù)盈帶表書進(jìn)京，誣告陷害姚南仲。恰好南仲的裨將曹文洽也入京奏事，曹文洽知道了這件事，很是憤怒。于是就日夜兼程，快馬加鞭追趕上程務(wù)盈，終于在長樂驛站追上了程務(wù)盈，并于當(dāng)晚與程務(wù)盈同宿過夜。曹文恰在半夜中殺死了程務(wù)盈，將程務(wù)盈所帶的薛盈珍的表書投入廁所糞池內(nèi)，然后自殺身亡。

第二天，驛站人員打理雜務(wù)，推開房門，發(fā)現(xiàn)血流滿地，曹文洽身邊有兩份遺書，一份內(nèi)容告知姚南仲，講述自己殺死薜盈珍使者程務(wù)盈的動機(jī)和原因，另一書替姚南仲伸冤正義。

此事轟動一時，傳入朝廷，德宗非常驚駭。姚南仲考慮此事件的影響，便請愿回京朝見皇上。

德宗李適問姚南仲:” 薛盈珍擾亂軍政嗎? ” 姚南仲回答:“薛盈珍不擾軍政，是臣違背了陛下的法度。像薛盈珍這種人所到之處，即使羊祜、杜預(yù)復(fù)生，也無法行安穩(wěn)地處理政事、整頓軍務(wù)�！钡伦诼犃艘δ现俚淖嗍�，已知其中緣由，只是在座上久久沉默不語。

后任姚南仲為尚書右仆射。姚南仲擔(dān)任此職，直至貞元十九年(803)去世，年七十四歲。朝廷贈姚南仲太子太保，謚貞。

姚南仲，華州下邽人。干元初，擢制科，授太子校書。遷累右補闕。大歷十年，獨孤皇后崩 ，代宗悼痛，詔近城為陵，以朝夕臨望。南仲上疏曰：“臣聞人臣宅于家，帝王宅于國。長安乃祖宗所宅，其可興鑿建陵其側(cè)乎？夫葬者，藏也，欲人之不得見也。今西近宮闕，南迫大道。使近而可視，歿而復(fù)生，雖宮以待之可也。如令骨肉歸土，魂無不之，雖欲自近，了復(fù)何益？且王者必?fù)?jù)高明，燭幽隱，先皇所以因龍首而建望春也。今起陵目前，心一感傷，累日不能平。且匹夫向隅，滿堂不樂，況萬乘乎，天下謂何？陛下謚后以貞懿，而終以褻近，臣竊惑焉。今國人皆曰后陵在邇，陛下將日省而時望焉，斯有損圣德，無益先后，欲寵反辱，惟陛下孰計�！笔枳�，帝嘉納，進(jìn)五品階以酬讜言。

坐善宰相常袞，出為海鹽令。浙西觀察使韓滉表為推官，擢殿中侍御史、內(nèi)供奉。召還，四遷為御史中丞，改給事中、陜虢觀察使。拜義成節(jié)度使。監(jiān)軍薛盈珍恃權(quán)橈政，不能逞，因毀南仲于朝，德宗惑之。俄遣小使程務(wù)盈誣表以罪。會南仲裨將曹文洽入奏，知其語，則晨夜追至長樂驛，及之，與同舍，夜殺務(wù)盈，投其誣于廁。為二書，一抵南仲，一治南仲冤，且自言殺務(wù)盈狀，乃自殺。驛吏以聞，帝駭異。南仲不自安，固請入朝。帝勞曰：“盈珍橈卿政邪？”曰：“不橈臣政，臣隳陛下法耳。如盈珍輩，所在有之，雖使羊、杜復(fù)生，撫百姓，御三軍，必不能成愷悌之化而正師律也�！钡勰�然。乃授尚書右仆射。貞元十九年卒，年七十五，贈太子太保，謚曰貞。

初，崔位、馬少微者，俱在南仲幕府。盈珍之譖也，出位為遂州別駕。東川觀察使王叔邕希旨奏位，殺之。復(fù)出少微補外，使宦官護(hù)送，度江，投之水云。

姚南仲，華州下邽人。乾元初，制科登第，授太子校書，歷高陵、昭應(yīng)、萬年三縣尉。遷右拾遺，轉(zhuǎn)右補闕。大歷十三年，貞懿皇后獨孤氏崩，代宗悼惜不已，令于近城為陵墓，冀朝夕臨望于目前。南仲上疏諫曰：

伏聞貞懿皇后今于城東章敬寺北以起陵廟，臣不知有司之請乎，陛下之意乎，陰陽家流希旨乎？臣愚以為非所宜也。謹(jǐn)具疏陳論，伏愿暫留天睠而省察焉。

臣聞人臣宅于家，君上宅于國。長安城，是陛下皇居也，其可穿鑿興動，建陵墓于其側(cè)乎？此非宜一也。

夫葬者藏也，欲人之不得見也。是以古帝前王葬后妃，莫不憑丘原，遠(yuǎn)郊郭。今則西臨宮闕，南迫康莊，若使近而可見，死而復(fù)生，雖在西宮待之可也。如骨肉歸土，魂無不之，章敬之北，竟何所益？視之兆庶，則彰溺愛；垂之萬代，則累明德，此非所宜二也。

夫帝王者，居高明，燭幽滯。先皇所以因龍首建望春，蓋為此也。今若起陵目前，動傷宸慮，天心一傷，數(shù)日不平。且匹夫向隅，滿堂為之不樂；萬乘不樂，人其可歡心乎？又暇日起歌，動鐘于內(nèi)，此地皆聞，此非宜三也。

伏以貞懿皇后，坤德合天，母慈逮下，陛下以切軫旒扆，久俟蓍龜。始謚之以貞懿，終待之以褻近，臣竊惑焉，非所以稱述后德，光被下泉也。今國人皆曰：“貞懿皇后之陵邇于城下者，主上將日省而時望焉�！彼褂袚p于圣德，無益于貞懿。將欲寵之，而反辱之，此非宜四也。

凡此數(shù)事，實玷大猷，天下咸知，伏惟陛下熟計而取其長也。陛下方將偃武靖人，一誤于此，其傷實多。臣恐君子是非，史官褒貶，大明忽虧于掩蝕，至德翻后于堯、舜，不其惜哉。今指日尚遙，改卜何害？抑皇情之殊眷，成貞懿之美號。

疏奏，帝甚嘉之，賜緋魚袋，特加五品階，宣付史館。

與宰相常袞善，袞貶官，南仲坐出為海鹽縣令。浙江東、西道觀察使韓滉辟為推官，奏授殿中侍御史、內(nèi)供奉，充支使。尋征還，歷左司兵部員外，轉(zhuǎn)郎中，遷御史中丞、給事中、同州刺史、陜虢觀察使。

貞元十五年，代李復(fù)為鄭滑節(jié)度使。監(jiān)軍薛盈珍恃勢奪軍政，南仲數(shù)為盈珍讒毀，德宗頗疑之。十六年，盈珍遣小使程務(wù)盈馳驛奉表，誣奏南仲陰事。南仲裨將曹文洽亦入奏事京師，伺知盈珍表中語。文洽私懷憤怒，遂晨夜兼道追務(wù)盈，至長樂驛及之，與同舍宿；中夜殺務(wù)盈，沉盈珍表于廁中，乃自殺。日旰，驛吏辟門，見血流涂地，旁得文洽二緘，一告于南仲，一表理南仲之冤，且陳首殺務(wù)盈。上聞其事，頗駭異之。南仲慮釁深，遂乞入朝。德宗曰：“盈珍擾軍政耶？”南仲對曰：“勇珍不擾軍政，臣自隳陛下法耳。如盈珍輩所在有之，雖羊、杜復(fù)生，撫百姓，御三軍，必不能成愷悌父母之政，師律善陣之制矣。”上默然久之。授尚書右仆射。貞元十九年七月，終于位，年七十四，贈太子太保，謚曰貞。