六年夏，流賊大擾河北、畿南。命九州協(xié)剿，與左良玉等屢破賊兵，賊悉渡河而南。其冬，大敗過天星于吳城鎮(zhèn)，斬首四百二十級。追賊闖天王等五華集，又?jǐn)≈�，斬首六百四十余級。七年擊賊嵩縣之潭頭，斬首三百二十級。賊駐商、雒，謀再入山西。左良玉迎擊于商南，九州遣部將趙柱、周爾敬逆之雒南。賊至商州返。已，復(fù)侵閿鄉(xiāng)。九州病，遣部將凌元機(jī)、胡良翰等搜山，悉敗歿。九州尋赴援山西。未幾，以河南剿賊功，加署都督僉事。八年春，被劾褫官，從軍自效。洪承疇入關(guān)，以吳村、瓦屋為商南賊走內(nèi)鄉(xiāng)、淅川要地，令九州偕良玉扼之。尋移駐洛陽。九年二月，賊走登封石陽關(guān)，與伊、嵩賊合。九州期良玉夾擊，良玉半道歸。九州以孤軍千二百人由嵩縣深入。賊屢敗，窮追四十余里，誤入深崖。遇賊數(shù)萬，據(jù)險攻圍。九州勢不敵，夜移營，為賊所乘，遂戰(zhàn)歿。從孫文瓊伏闕三上書請恤，不報。文瓊后亦殉難。