莫利以大規(guī)模地發(fā)掘了奇琴伊察遺址而著名，他亦發(fā)表了大量關于瑪雅象形文字的專著和論文，針對普通讀者撰寫介紹瑪雅的通俗文章。盡管隨著瑪雅文化研究的發(fā)展，他的理論和成果都被重新評估，然而他撰寫的論文，尤其是關于瑪雅歷銘文的研究，至今仍然是此領域上重要的參考文獻。在他主持由華盛頓卡內(nèi)基研究所資助的眾多項目期間，他指導和鼓勵了很多后來獲得顯著成功的人。他研究瑪雅文明的執(zhí)著和熱忱使這些項目能得到必要的資助，使古瑪雅文明得以揭示。
莫利在第一次世界大戰(zhàn)期間是為美國海軍情報局服務的間諜，以在墨西哥和中美洲的野外考古工作為掩護，調(diào)查當?shù)氐牡萝娀顒雍头疵肋\動。逝世后，其間諜身份才被公之于眾。