王君正讀初中時，隨父母前往北京，并開始對導(dǎo)演藝術(shù)產(chǎn)生興趣。1964年，高中畢業(yè)，報考了北京電影學(xué)院導(dǎo)演系；之后，“文化大革命”開始，因此她的大學(xué)生涯是在“動亂”中度過的。1968年，王君正被分配到北京電影制片廠，先后在《烽火少年》、《百花爭艷》等影片中擔任導(dǎo)演助理、副導(dǎo)演。

1980年，獨立執(zhí)導(dǎo)個人首部電影《苗苗》，該片獲得中國文化部優(yōu)秀影片獎、第1屆中國電影金雞獎特別獎。1982年，自編自導(dǎo)劇情電影《應(yīng)聲阿哥》，該片講述了6歲的北京兒童京京來到景頗山區(qū)看望在那里工作的媽媽，與當?shù)氐木邦H小朋友結(jié)下深厚情誼的故事，而影片也獲得了中國文化部優(yōu)秀影片獎。

1987年，由其執(zhí)導(dǎo)的劇情電影《山林中頭一個女人》上映，該片由李秀明、李緯等共同主演。1988年，執(zhí)導(dǎo)由李雪健、喬奇等共同主演的動作電影《大偵探》。1989年，執(zhí)導(dǎo)由胡亞捷、劉斌合作主演的劇情電影《黑眼睛太陽神》。1991年，執(zhí)導(dǎo)由潘虹、丁嘉麗共同主演的劇情電影《女人·TAXI·女人》，該片以兩位不同階層的現(xiàn)代女性在偶遇相識后發(fā)生的生活故事，來反應(yīng)社會的扭曲以及人與人之間的溫情。

1992年，執(zhí)導(dǎo)由張豐毅、趙君、王艷平聯(lián)袂主演的劇情電影《私人保鏢》；同年，執(zhí)導(dǎo)兒童電影《天堂回信》，影片透過兒童的眼光，兒童的心靈來觀察世界，感受世界，用兒童的稚幼方式來表達人與人之間的親情與真情，該片獲得第43屆柏林國際電影節(jié)國際青少年兒童影視中心獎、美國第10屆芝加哥兒童節(jié)最佳故事片獎。1993年，由其執(zhí)導(dǎo)的戲曲傳記劇《猴娃》播出。2000年，執(zhí)導(dǎo)由葉靜、劇雪搭檔主演的劇情電影《愛上新世紀》。

2001年，執(zhí)導(dǎo)由強子、趙越、姚洋聯(lián)合主演的電視電影《男人四十》。2002年，由其執(zhí)導(dǎo)的家庭兒童電影《你生命中那時光》上映。

王君正執(zhí)導(dǎo)的三部兒童電影《苗苗》、《應(yīng)聲阿哥》和《天堂回信》，在新時期兒童電影創(chuàng)作中占有各自的位置，并且?guī)в酗L(fēng)格形成過程中漸變的印記。其中也存在著某種主題和風(fēng)格上獨特的連續(xù)性，似乎不是獨立的三部影片，而是超越時空的距離，遙相呼應(yīng)。然而，對于王君正而言，她最感興趣、最關(guān)注的那一點，或者說是能夠傳達個性的細微特點和印記的語言，在其創(chuàng)作初期就已經(jīng)體現(xiàn)出來了。樸素平靜而溫馨的影像背后是導(dǎo)演王君正那永不倦怠的天真、純凈的心。她用心去追尋、觀察、體驗兒童世界，為孩子們獻上一個真正屬于自己的美好世界（《電影藝術(shù)》評）。