公元338年，后趙石虎大舉進(jìn)攻鮮卑慕容部，兵勢(shì)強(qiáng)勁慕容皝屬下諸城多有降者，慕容皝一度動(dòng)搖欲放棄棘城。慕輿根勸諫慕容皝：“不要被石虎兵威所迷惑，要堅(jiān)守棘城挫敵鋒芒以待戰(zhàn)局變化。”之后趙兵四面蟻附攻城，慕輿根等晝夜力戰(zhàn)終于擊退趙軍。

公元339年，慕輿根為折沖將軍與前軍師慕容評(píng)、廣威將軍慕容軍、蕩寇將軍慕輿泥襲擊后趙遼西，俘獲千馀家。后趙鎮(zhèn)遠(yuǎn)將軍石成、積弩將軍呼延晃、建威將軍張支等追擊燕軍，慕輿根等擊敗追兵，殺死呼延晃、張支。

公元344年二月，慕容皝命慕輿根等率兵三路，攻克宇文氏都城紫蒙川（今遼寧朝陽(yáng)西北）等要地，大破宇文部。

公元346年正月，慕容皝派慕容軍、慕容恪、慕輿根等率領(lǐng)一萬(wàn)七千名騎兵，奔襲扶余國(guó)。慕輿根和眾多將領(lǐng)一樣，親冒矢石，大膽進(jìn)擊，一舉攻克扶余，俘走扶余國(guó)王。

公元349年，石虎死后趙大亂，慕容皝欲攻取中原因而爭(zhēng)取部下意見(jiàn)。慕輿根發(fā)言認(rèn)為后趙內(nèi)亂時(shí)機(jī)難得，同時(shí)燕國(guó)經(jīng)過(guò)幾代招賢養(yǎng)民，務(wù)農(nóng)訓(xùn)兵國(guó)力已經(jīng)充實(shí)，堅(jiān)決主張進(jìn)取中原。

公元350年，燕王慕容俊率領(lǐng)慕輿根等在追擊后趙征東將軍鄧桓于魯口時(shí)，遭到鄧桓部將鹿勃早反擊。鹿勃早率數(shù)千人夜襲燕軍，燕前鋒都督慕容霸部首先遭到襲擊，慕容霸?shī)^力抵抗才使燕軍不致潰敗。鹿勃早攻勢(shì)甚銳燕王慕容俊一度準(zhǔn)備撤軍避之，慕輿根勸止慕容俊后，親自發(fā)動(dòng)反擊終于消滅敵軍。

公元352年，慕輿根參與圍攻鄴城。時(shí)中山（今河北定州）蘇林糾眾，起兵于無(wú)極（今河北無(wú)極東），自稱(chēng)天子，大刀闊斧，欲建“國(guó)中之國(guó)”。閏十月，燕主慕容俊慎重決斷，派出老成善謀的慕輿根前去支援主帥慕容恪作戰(zhàn)。經(jīng)過(guò)多日苦戰(zhàn)，克敵制勝，計(jì)斬蘇林。

后來(lái)慕輿根自恃功高，目無(wú)君上，忌賢妒能。公元360年正月，伺機(jī)作亂挑撥慕容恪與慕容暐的關(guān)系，但被燕主慕容暐識(shí)破，并派皇甫真、傅顏平亂而捕之。