1997年，參演電視劇《和平年代》，飾演了一個廣東小老板，獲得了第17屆“飛天獎”最佳男配角提名。2000年，30歲的林永健從部隊轉(zhuǎn)業(yè)，到北京當(dāng)起"北漂"；同年，參演《風(fēng)流才子紀(jì)曉嵐》飾演“和把子”；2001年，林永健參演張國立主演的電視《鐵齒銅牙紀(jì)曉嵐2》，出演盧焯一角。2002年進(jìn)入空政話劇團(tuán)。2004年，參演張豐毅、李雪健主演的電視劇《歷史的天空》，飾演從小嘍羅到副軍長的“朱一刀”。

2004年，參演《敵后特工隊》，飾演漢奸“劉魁勝”，奪得第17屆全軍電視劇金星獎“優(yōu)秀演員”獎。2005年11月，與張國立、張默、鄧婕聯(lián)袂主演歷史傳奇輕喜劇《龍非龍鳳非鳳》。

2007年，林永健參演張國立主演的電視劇《金婚》，飾演有些小奸小滑小聰明的配角“大莊”。

2006年，參演農(nóng)村喜劇《喜耕田的故事》，飾演男主角憨厚樸實的農(nóng)民喜耕田，獲得第24屆中國金鷹電視藝術(shù)獎“最佳男演員”獎提名，奪得“觀眾喜愛的電視劇男演員”獎。

2009年，出演《孟來財傳奇》。同年，與海清主演改編自著名作家六六的同名小說情感劇《王貴與安娜》，飾演農(nóng)民出身的大學(xué)教授“王貴”，與海清飾演的“上海沒落貴族家庭”的“安娜”是夫妻，憑借王貴一角入圍“白玉蘭獎”最佳男演員提名。

2010年，主演諜戰(zhàn)劇《黎明之前》，飾演國民黨中央情報官“譚忠恕”，奪得第17屆白玉蘭獎最佳電視劇金獎 。2012年4月，領(lǐng)銜主演電視劇《我叫王土地》，飾演地商兼水利專家“王土地”，《我叫王土地》奪得第26屆中國電視金鷹獎“優(yōu)秀電視劇獎”，林永健獲得金鷹獎“觀眾喜愛的電視劇男演員獎 ” ；2012年10月，與牛莉主演的電視劇《新女婿時代》在北京衛(wèi)視、浙江衛(wèi)視、東方衛(wèi)視播出。

2013年年初，與陳數(shù)合作《天真遇到現(xiàn)實》，飾演造型多變有多種出位裝扮的“鄭現(xiàn)實”；3月，與寧靜、劉蓓、周冬齊主演的《畢有財》，飾演畢有財，從20多歲演到70多歲，經(jīng)歷三段婚姻；同年12月，參演歷史題材電視劇《聶榮臻》飾演“聶榮臻”，演繹聶榮臻從留法學(xué)習(xí)生涯、戰(zhàn)爭年代到建國時期的人生歷程。并憑借該劇獲得第27屆中國電視金鷹獎觀眾喜愛的男演員獎。

2015年，攜帶兒子林大竣參加湖南衛(wèi)視親子戶外真人秀節(jié)目《爸爸去哪兒》第三季。6月15日，主演的戰(zhàn)爭傳奇劇《怒放》在央視一套播出。主演的都市勵志輕喜劇《媽媽像花兒一樣》播出，林永健飾演了一位“居家男人”馬三強(qiáng)。11月29日，主演的都市愛情喜劇《桃花運(yùn)》開播，林永健飾演尤斌。

2016年5月11日，參演電視劇《重耳傳奇》。12月15日，參演的電視劇《我的繼父是偶像》播出。

2017年1月27日，出席中央電視臺春節(jié)聯(lián)歡晚會，搭檔馮鞏、宋寧、傅園慧表演相聲劇《信任》 ；2月，與蔣欣再度合作主演都市情感劇《凡人的品格》，在劇中飾演曾經(jīng)做過戰(zhàn)地記者的金牌制片人展大鵬 。11月1日，第13屆中美電影節(jié)在美國好萊塢舉行開幕式暨“金天使獎”頒獎典禮，林永健憑借電影《李保國》獲得年度最佳男主角獎。12月，參演電視劇《都是一家人》。同月，參演電視劇《少帝康熙》。

2018年1月11日，參演的電視劇《幸福照相館》在上海電視劇頻道播出。2月15日，參加央視狗年春晚。3月，入選《中國電視劇60年大系人物卷》。

林永健的妻子周冬齊是一位演員，比他小一歲，從解放軍藝術(shù)學(xué)院畢業(yè)的周冬齊，兩人都是空政旗下的軍人，林永健隸屬于話劇團(tuán)，周冬齊屬于電視藝術(shù)中心，兩人在合作一個小品時相識。2003年1月8日，兩人登記結(jié)婚。2010年，兒子林大竣出生。

2016年2月18日，林永健在微博中曬出一組全家到達(dá)夏威夷旅游的照片，并配文稱：“夏威夷我們一家來了！”，可見三人十分享受這難得的度假時光。

2009年4月，參加北京衛(wèi)視的大型公益節(jié)目《志愿者真情耀中華》。

2013年，零片酬出演公益微電影以“最美鄉(xiāng)村醫(yī)生”鐘晶的事跡為原型《幸福心律》。

2017年9月，當(dāng)選為中國視協(xié)第六屆副主席。

2018年5月7日，參加中國文聯(lián)文藝志愿服務(wù)團(tuán)紀(jì)念5·12汶川特大地震十周年慰問演出，與張凱麗、岳紅、陳曉等藝術(shù)家集體詩朗誦《中國，雄起》。

從《歷史的天空》中的“朱一刀”到《呂梁英雄傳》中的“王壞蛋”，從《喜耕田的故事》中的“喜耕田”到《文化站長》中的基層干部，從《親兄熱弟》到《金婚》中的精彩表演，林永健扮演的大多數(shù)都是性格突出的小人物。（成都晚報評）

長著一雙小眼睛的林永健似乎有一種魔力，無論出演好人壞蛋都令觀眾印象深刻。（ 沈陽日報評）

林永健在《聶榮臻》中越演越像聶榮臻，這部劇成功的一個條件就是選對了演員。（《聶榮臻》研討會評價）

“林永健的表演功底很扎實，懂得揚(yáng)長避短，以自己的演技演出了父親（聶榮臻）的氣質(zhì)，展現(xiàn)了父親的人格魅力，我們對他的表演感到滿意”。（聶榮臻元帥之女聶力評價電視劇《聶榮臻》）