她只身到 北京，考入高等女子師范（今 北京師范大學(xué)），1911年畢業(yè)。畢業(yè)后第二年，在 辛亥革命的洪流激蕩下，她懷著一腔熱血，奔赴祖國(guó)西南邊陲廣西，受聘就任廣西桂林省立女子師范校長(zhǎng)，與她同行赴任執(zhí)教的是同班摯友周蕪君，她們?cè)谀抢锾剿鳌疤岣吲�子教育、振興女權(quán)”的道路。1915年，兩人又不辭辛苦南渡 婆羅洲，余佩皋擔(dān)任婆羅洲山口洋中華學(xué)校校長(zhǎng)。當(dāng)時(shí)那里經(jīng)濟(jì)落后，文化不振，交通不便，環(huán)境不靖，生活艱苦，她們卻孤軍深入偏遠(yuǎn)山區(qū)，開(kāi)創(chuàng)華僑教育事業(yè)。

余佩皋鑒于當(dāng)時(shí)新加坡是華僑愛(ài)國(guó)進(jìn)步活動(dòng)的中心，革命氣氛高漲，有較好的創(chuàng)業(yè)環(huán)境，便輾轉(zhuǎn)來(lái)到新加坡。此時(shí)， 莊希泉在新加坡經(jīng)營(yíng)中華國(guó)貨公司，探索“實(shí)業(yè)救國(guó)”與“教育救國(guó)”的道路，兩人志同道合，便共同創(chuàng)辦新加坡南洋女子師范學(xué)校（今南洋女子中學(xué)前身），著重培養(yǎng)華僑學(xué)校師資。余佩皋任校長(zhǎng)， 莊希泉任董事長(zhǎng)。這是南洋女子教育之先驅(qū)。余、莊傾盡心力辦學(xué)，師生員工通力合作，使這所學(xué)校聞名南洋。

11月7日，在并肩斗爭(zhēng)中風(fēng)雨同舟的 莊希泉、余佩皋，宣布“組織新家庭”�；槎Y從簡(jiǎn)，只在同德書(shū)報(bào)社開(kāi)了一個(gè)演說(shuō)會(huì)。星馬總督敗訴后惱羞成怒，在莊、余新婚的第二天，再次下令逮捕 莊希泉，并宣布將他“永遠(yuǎn)驅(qū)逐出境”。余佩皋不甘示弱，直奔殖民政府“華民政務(wù)司”，昂首而進(jìn)，嚴(yán)辭質(zhì)問(wèn)�！把蟠笕恕北蛔穯�(wèn)得語(yǔ)無(wú)倫次，丑態(tài)百出。她以不畏難、不怕險(xiǎn)、不屈不撓的斗爭(zhēng)精神享譽(yù)南洋僑界，人們稱(chēng)贊她是“女界中錚錚的人物”。

12月5日，余佩皋受“ 華僑學(xué)務(wù)維持處”推選，肩負(fù)南洋400萬(wàn)華僑、300多所華僑學(xué)校師生爭(zhēng)取“享有共辦教育、學(xué)習(xí)華文的權(quán)利”之重托，只身回國(guó)呼吁各界支持。

1920年12月27日，余佩皋抵上海，拜訪(fǎng)各界要人并到各團(tuán)體、各機(jī)關(guān)、各報(bào)館發(fā)表演說(shuō)，陳述她作為華僑代表返國(guó)爭(zhēng)取聲援的意義和目的。黃炎培先生特邀余佩皋到青年會(huì)發(fā)表演說(shuō)。各界群情激昂，紛紛發(fā)出抗議書(shū)，分致英國(guó)外交部、英國(guó)駐華公使及有關(guān)當(dāng)局。

1月5日，余佩皋帶病離浦口赴 北京。1月7日抵 北京，她即演講宣傳，四處呼吁，多次赴外交部、教育部，直接向外交總長(zhǎng)顏惠慶呈遞請(qǐng)?jiān)笗?shū)，申述僑胞之急情。 北京學(xué)生聯(lián)合會(huì)、福建旅京學(xué)生會(huì)，均開(kāi)會(huì)作出決議，以實(shí)際行動(dòng)支持南洋僑胞的斗爭(zhēng)。

當(dāng)時(shí)，全國(guó)各報(bào)先后刊登有關(guān)此事的通電、通告和 公函，廈門(mén)、 北京、上海等地學(xué)生團(tuán)體紛紛成立后援會(huì)，一時(shí)震動(dòng)全國(guó)。

盡管輿論聲援，群情鼎沸，無(wú)奈 北洋政府腐敗無(wú)能，交涉失敗。余佩皋回國(guó)請(qǐng)?jiān)笟v時(shí)一年又三個(gè)月，最后懷著無(wú)限憤慨的心情回到廈門(mén)。此后，余佩皋決心在自己的國(guó)土上， 重振旗鼓，繼續(xù)辦學(xué)。

在愛(ài)國(guó)僑胞的支持下，1922年5月1日，廈門(mén)廈南女學(xué)正式開(kāi)辦。廈南女學(xué)后改為“廈南女子中學(xué)”（簡(jiǎn)稱(chēng)廈南女中）并附設(shè)小學(xué)。余佩皋的辦學(xué)宗旨是教育與救國(guó)相結(jié)合。她提倡自由、科學(xué)、反帝、反封建，開(kāi)展歌舞、戲劇活動(dòng)，推廣普通話(huà)。抱著為中華民族爭(zhēng)光、為海外僑胞爭(zhēng)氣的赤誠(chéng)之心，她與教師們盡心協(xié)力，把廈南女中辦得生氣勃勃。

中國(guó)共產(chǎn)黨第三次全國(guó)代表大會(huì)決定建立革命統(tǒng)一戰(zhàn)線(xiàn)，進(jìn)行反帝、反封建斗爭(zhēng)。改組后的國(guó)民黨奉行“聯(lián)俄、聯(lián)共、扶助農(nóng)工”三大政策。1924年，周恩來(lái)派江董琴由廣州到廈門(mén)，組織國(guó)民黨福建省臨時(shí)省黨部，這個(gè)黨部在國(guó)民革命軍東路軍總指揮部成立之前就一直在中國(guó)共產(chǎn)黨領(lǐng)導(dǎo)下進(jìn)行活動(dòng)。余佩皋、 莊希泉參加了省黨部工作，均任執(zhí)行委員。

日本帝國(guó)主義及國(guó)民黨右派對(duì)此極為惱恨，相互勾結(jié)，日本人借口 莊希泉是日本統(tǒng)治的臺(tái)灣籍民，以所謂“臺(tái)灣籍民參加外國(guó)政治結(jié)社”為罪名，將莊希泉拘禁，于7月28日，將他押送臺(tái)灣。余佩皋聞?dòng)�，義憤填膺，帶領(lǐng)廈南女中師生和各界群眾1000多人，到碼頭抗議示威。反動(dòng)勢(shì)力將余佩皋視為眼中釘、肉中刺，必欲除之而后快。8月24日，她開(kāi)完會(huì)回家，途經(jīng)二十四崎，突遭槍擊，幸而子彈只穿透衣袖，未傷及身體。面對(duì)明槍暗箭，她毫不畏懼退縮，人們稱(chēng)她為“奇女子”、“女界之丈夫”。

當(dāng)時(shí)，廣東革命浪潮蓬勃發(fā)展，余佩皋便把自己的獨(dú)生兒子 莊炎林交托在廈南女中執(zhí)教的摯友周蕪君撫養(yǎng)，離開(kāi)廈門(mén)，到廣東參加北伐軍。

2月，余佩皋被調(diào)往福州，任國(guó)民黨福建省黨部執(zhí)行委員、婦女部長(zhǎng)。她直接參加工人運(yùn)動(dòng)，到工廠(chǎng)宣傳婦女解放的道理，發(fā)動(dòng)女工參加革命斗爭(zhēng)。1927年4月3日，國(guó)民黨右派在福州發(fā)動(dòng)反革命政變，大舉“清黨”，屠殺共產(chǎn)黨人，余佩皋和 莊希泉經(jīng)友人相助幸而脫險(xiǎn)，她仍被通緝。大革命失敗后，她和 莊希泉毅然離開(kāi)了國(guó)民黨。那時(shí)，周恩來(lái)、鄧穎超曾托人送信給 莊希泉夫婦，問(wèn)候致意。此后，余佩皋、 莊希泉流亡菲律賓，在 馬尼拉和愛(ài)國(guó)華僑王雨亭創(chuàng)辦《前驅(qū)日?qǐng)?bào)》。余佩皋繼續(xù)奔走于菲律賓、廈門(mén)、上海等地，在中國(guó)共產(chǎn)黨領(lǐng)導(dǎo)下堅(jiān)持秘密革命活動(dòng)，興辦教育。

8月間，余佩皋在蘇州突患急性上升性脊髓炎，兩腳全失去知覺(jué)，繼而逐漸蔓延到腹部、胸部，遂致全身麻痹。9月12日，逝世于上海紅十字醫(yī)院。中外醫(yī)學(xué)專(zhuān)家均不明病因，據(jù)說(shuō)此病當(dāng)時(shí)在中國(guó)為第一例。余佩皋本著科學(xué)精神，臨終前囑咐其夫 莊希泉、胞弟余壽浩，將其遺體獻(xiàn)給醫(yī)院，使醫(yī)學(xué)界得有新發(fā)現(xiàn)，以造福人群。人們稱(chēng)頌她“愛(ài)國(guó)愛(ài)群，至死不衰”。余佩皋逝世后，上海、廈門(mén)、新加坡等地都舉行了隆重的追悼大會(huì)。