吳劍旗帶領(lǐng)的團(tuán)隊(duì)從事雷達(dá)研究二十余年，曾以全新體制研制出新一代三坐標(biāo)雷達(dá)（世界上首個(gè)反隱身先進(jìn)米波雷達(dá))，以小的代價(jià)解決了國防安全大問題，樹立了我國雷達(dá)研究的里程碑。

1990年，吳劍旗來到以雷達(dá)研究為核心任務(wù)的中國電子科技集團(tuán)第三十八研究所工作。1991年，海灣戰(zhàn)爭(zhēng)中隱身飛機(jī)在戰(zhàn)場(chǎng)上的巨大威力對(duì)吳劍旗產(chǎn)生了強(qiáng)烈震動(dòng)：“如果沒有能探測(cè)到隱身飛機(jī)的雷達(dá)，敵方的飛機(jī)到我國的領(lǐng)空就如入無人之境，這對(duì)國防安全是個(gè)巨大的威脅。必須攻克這個(gè)難題，恢復(fù)雷達(dá)在防空網(wǎng)中的地位，用雷達(dá)人的力量捍衛(wèi)國防安全�！睍r(shí)隔一年，吳劍旗恰巧獲得了負(fù)責(zé)一個(gè)旨在解決反隱身問題的預(yù)研課題的機(jī)會(huì)，這個(gè)課題名稱叫稀布陣綜合脈沖孔徑雷達(dá)試驗(yàn)系統(tǒng)，就這樣，沒有可以借鑒的成功經(jīng)驗(yàn)，沒有可以模仿的典型案例，沒有可以參考的經(jīng)典教材，只有這支雷達(dá)科研團(tuán)隊(duì)為國防事業(yè)奉獻(xiàn)青春的一腔熱血。吳劍旗帶著他的團(tuán)隊(duì)致力于研究反隱身雷達(dá)體制，一做就是二十一年光陰。他從空間分集和超分辨處理兩個(gè)技術(shù)路徑進(jìn)行了大膽創(chuàng)新：一是創(chuàng)立具有空間分集作用的稀布陣綜合脈沖孔徑雷達(dá)體制，二是率先使用超分辨處理和分區(qū)保形波束設(shè)計(jì)方法提高測(cè)高精度和改善空域覆蓋性能。二十一年間，懷著科技報(bào)國的信念，吳劍旗以不達(dá)目的誓不罷休的韌勁和決心，從理論模型的建立、仿真分析、試驗(yàn)系統(tǒng)到實(shí)用裝備，在雷達(dá)研究史上留下了艱難摸索、奮力前行的腳步。

2001年，他的團(tuán)隊(duì)完成了課題研究；

2012年，完成了世界上首個(gè)實(shí)用系統(tǒng)研制。

作為一名雷達(dá)科研工作者，吳劍旗早已將個(gè)人價(jià)值融入科技創(chuàng)新和國防事業(yè)發(fā)展：“技術(shù)創(chuàng)新的過程就是實(shí)現(xiàn)自我價(jià)值的過程。我們通過創(chuàng)新，研制了采購和使用成本都不高的高性能米波雷達(dá)，相比美國花巨資打造的隱身突防能力，用小的代價(jià)解決反隱身的國防安全大的問題，避免了掉入高昂的軍備競(jìng)賽陷阱,這正是雷達(dá)工作者的人生價(jià)值所在。”

1999年，我國空軍啟動(dòng)機(jī)動(dòng)式三坐標(biāo)雷達(dá)工程的研制工作，吳劍旗所在的第三十八研究所以過硬的雷達(dá)研究制造水平承擔(dān)起了這一重要任務(wù)。當(dāng)時(shí)，項(xiàng)目總設(shè)計(jì)師吳曼青院士率領(lǐng)的年輕研制團(tuán)隊(duì)作出了一個(gè)決定：采用DBF（數(shù)字波束形成）體制，吳劍旗正是這個(gè)團(tuán)隊(duì)的核心成員。他全力支持采用創(chuàng)新方案，并主動(dòng)承擔(dān)起了攻堅(jiān)克難的重任。在重點(diǎn)工程型號(hào)中采用全新方案這一決定立刻在雷達(dá)界掀起了軒然大波，眾多雷達(dá)專家的質(zhì)疑聲不絕于耳：當(dāng)時(shí)“世界上公認(rèn)最先進(jìn)的三坐標(biāo)雷達(dá)采用的是多波束相掃體制，沿用這一技術(shù)體制，省時(shí)省力，又簡(jiǎn)單穩(wěn)妥，為何要避易就難，去挑戰(zhàn)沒有成功經(jīng)驗(yàn)可借鑒的全新技術(shù)體制呢？”誠然，沿用現(xiàn)有的技術(shù)體制可借鑒程度高、研制風(fēng)險(xiǎn)小，不失為一個(gè)安全系數(shù)最大的選擇……但是，走別人走過的路，永遠(yuǎn)無法看到最美麗的風(fēng)景；爬別人爬過的山，永遠(yuǎn)無法體會(huì)首次攀登最高峰的喜悅。對(duì)于吳劍旗來說，如果沿用現(xiàn)有體制，在核心技術(shù)上難以實(shí)現(xiàn)新的突破，他不愿意總是跟在別人后面跑，“即使沒有現(xiàn)成經(jīng)驗(yàn)可以借鑒，具有相當(dāng)大的難度、風(fēng)險(xiǎn)和挑戰(zhàn)，為了實(shí)現(xiàn)趕超，也應(yīng)該勇敢地試一試，這是科研工作者的使命與責(zé)任�！� 方案確定后，吳劍旗和他的團(tuán)隊(duì)瞄準(zhǔn)DBF體制研究，勇敢地邁出了第一步。一項(xiàng)新技術(shù)的誕生、應(yīng)用必然會(huì)經(jīng)歷一個(gè)艱難的過程，DBF體制三坐標(biāo)雷達(dá)的研制也不例外。背負(fù)著重大使命的吳劍旗和他的團(tuán)隊(duì)始終處于高度緊張的工作狀態(tài)。從事雷達(dá)技術(shù)研究，離不開大量的野外試驗(yàn)、飛行試驗(yàn)。試驗(yàn)地點(diǎn)常常在偏遠(yuǎn)地區(qū)，山勢(shì)險(xiǎn)峻，非常艱苦，試驗(yàn)期間連續(xù)幾個(gè)月無法回家更是常事。因此，他們付出的不僅僅是汗水、親情，甚至冒著生命危險(xiǎn)……歷經(jīng)4年異常艱辛的研制過程，他們克服了一個(gè)又一個(gè)工程上的困難，終于取得了成功。2005年，DBF體制三坐標(biāo)雷達(dá)獲得了國家科技進(jìn)步一等獎(jiǎng)。2015年9月3日，紀(jì)念抗戰(zhàn)勝利70周年閱兵式上，由吳劍旗團(tuán)隊(duì)研制的世界上首個(gè)采用DBF體制的305A機(jī)動(dòng)式三坐標(biāo)雷達(dá)在天安門廣場(chǎng)接受了黨和全國人民的檢閱，在我國雷達(dá)發(fā)展史上留下了濃墨重彩的一筆。

2003年， 吳劍旗以一位亞洲科學(xué)家出現(xiàn)在了國際雷達(dá)會(huì)議大會(huì)開幕式特邀報(bào)告席上，并大會(huì)上就先進(jìn)米波雷達(dá)相關(guān)問題研究作了報(bào)告，引起強(qiáng)烈反響。

2014年，受法國國際雷達(dá)會(huì)議主席邀請(qǐng)，吳劍旗再次率領(lǐng)中國電子學(xué)會(huì)無線電定位技術(shù)分會(huì)代表團(tuán)出席了在法國里爾舉辦的2014年法國國際雷達(dá)會(huì)議，并在開幕式上作了關(guān)于先進(jìn)米波雷達(dá)性能提升研究的專題報(bào)告，引起國際知名雷達(dá)專家的關(guān)注。

2013年5月，吳劍旗入選中國工程院增選院士候選人名單。

2017年4月，吳劍旗入圍中國工程院2017院士增選候選人名單。