現(xiàn)存孤本
陳士元所著《夢林玄解》
子書類：《俚言解》二卷、《岳記》三卷、《裔語音義》四卷、《夢占逸旨》八卷、《夢林玄解》三十四卷、《堤疾恒言》十五卷、《名疑》四卷、《姓匯》四卷、《姓觿》十卷、《象教皮編》六卷、《釋氏源流》二卷、《歸云別集》七十五卷。
集書類：《百老歌》一卷、《趙童傳》一卷。
陳士元在詩詞方面的造詣也頗深。在逸居故里時。有六言詩《村居四首》流傳至今。今照錄于下，以供鑒賞：
春景：
淡淡輕煙巷陌，暉暉晴日樓臺。
人在管弦聲里，踏花沉醉歸來。
夏景：
竹屋日長茶熟，水亭風(fēng)細荷香。
不用蒲葵小扇，自然心地清涼。
秋景：
金井梧飄一葉，楚天雁唳三秋。
何處數(shù)聲長笛，月明人倚高樓。
冬景：
古木寒鴉山徑，小橋流水人家。
昨夜前村微雪，詩思欲問梅花。
后世評價
商務(wù)印書館于1921年出版、上海書店于1980年再版的《中國人名大辭典》載：“陳士元，應(yīng)城人，字心叔，嘉靖進士，官至灤州知府，有易象鉤解，五經(jīng)異文，孟子雜記、荒史、古俗字略、夢林元解、名疑、姓匯、姓觿等著述傳世�！�
近代應(yīng)城籍學(xué)者胡文玉（鳴盛）著有《陳士元先生年譜》，依編年體記述陳士元生平著述成就。在《譜序》中指出：“陳養(yǎng)吾先生……，著作繁富，體大思精……，考據(jù)瞻博。”同時對陳士元的境遇，在《序》中慨嘆：“祗以有德無位僻居在野，既鮮知名朋友，又乏顯達故吏，鴻篇巨制，無力付梓，其鋟版諸書，亦以明末兵燹頻仍，散亡殆盡！”直到“漢學(xué)漸盛，海內(nèi)碩師愈以先生著作至可寶貴，或不惜重金，購自番舶，或博訪耆舊，潔來明濱；采入?yún)矔哂兄�，翻刻專集者有之。由是先生著述中外流傳日多一日�！?