1978.09——1985.04天津輕工業(yè)學(xué)院（現(xiàn)天津科技大學(xué)）食品工程系工程專(zhuān)業(yè)學(xué)生，獲學(xué)士、碩士學(xué)位。

1985.04——1993.02鄭州輕工業(yè)學(xué)院食品工程系教師，教研室主任（其間：1988.09—1989.07 任鄭州市快餐食品有限公司研發(fā)中心主任）。

1993.02——1993.06華南理工大學(xué)食品與生物工程學(xué)院做教育部國(guó)內(nèi)高級(jí)訪問(wèn)學(xué)者。

1993.06——1996.07華南理工大學(xué)食品與生物工程學(xué)院工學(xué)博士研究生。

1996.07——1998.04南京大學(xué)生命科學(xué)院生物學(xué)博士后研究工作。

1998.04——1999.09中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)食品科學(xué)與營(yíng)養(yǎng)工程學(xué)院教師，食品學(xué)院生物工程籌備組組長(zhǎng)，系主任。

1999.09——2002.07中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)食品科學(xué)與營(yíng)養(yǎng)工程學(xué)院副院長(zhǎng)兼生物工程系主任。

2002.07——2003.12中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)食品科學(xué)與營(yíng)養(yǎng)工程學(xué)院食品生物術(shù)系主任（2003.12 當(dāng)選為九三學(xué)社中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)委員會(huì)委員暨第三支社主任委員）。

2003.12——2007.07 掛職開(kāi)封市人民政府副市長(zhǎng)，負(fù)責(zé)農(nóng)業(yè)項(xiàng)目開(kāi)發(fā)、農(nóng)業(yè)科技推廣及與高�？蒲性核�的聯(lián)系等方面的工作。

2007.07——2008.01 九三學(xué)社北京市第十一屆委員會(huì)專(zhuān)職副主任委員。

2008.01—— 九三學(xué)社北京市第十一屆委員會(huì)專(zhuān)職副主任委員，北京市政協(xié)第十一屆委員會(huì)常委、副秘書(shū)長(zhǎng)。

2011年3月25日政協(xié)北京市第十一屆委員會(huì)常務(wù)委員會(huì)第二十三次會(huì)議通過(guò)， 根據(jù)政協(xié)北京市第十一屆委員會(huì)秘書(shū)長(zhǎng)閆仲秋同志的提議，免去孫君社政協(xié)北京市第十一屆委員會(huì)副秘書(shū)長(zhǎng)職務(wù)。

孫君社主持或參與（完成或正在進(jìn)行）的國(guó)家863、科技攻關(guān)及省市級(jí)科研項(xiàng)目等20余項(xiàng)，出版專(zhuān)著7部、發(fā)表論文100余篇，6篇論文被SCI收錄，2篇被SCI、EI同時(shí)收錄，先后獲得專(zhuān)利13項(xiàng)，鑒定成果6項(xiàng)，部分成果國(guó)內(nèi)領(lǐng)先，其中“生物技術(shù)在煙草工業(yè)中的應(yīng)用”獲得國(guó)家煙草總局科技進(jìn)步二等獎(jiǎng)（2005年12月）。

孫君社現(xiàn)任中國(guó)農(nóng)業(yè)工程學(xué)會(huì)農(nóng)產(chǎn)品加工與貯藏分會(huì)副理事長(zhǎng)兼秘書(shū)長(zhǎng)、中國(guó)微生物學(xué)會(huì)工業(yè)微生物專(zhuān)業(yè)委員會(huì)委員、中國(guó)化工學(xué)會(huì)生物化工學(xué)會(huì)委員、中國(guó)農(nóng)機(jī)學(xué)會(huì)農(nóng)產(chǎn)品加工與貯藏工程分會(huì)副理事長(zhǎng)、中國(guó)綠色食品發(fā)展中心綠色食品專(zhuān)家咨詢委員會(huì)委員、農(nóng)業(yè)部農(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量安全中心無(wú)公害農(nóng)產(chǎn)品認(rèn)證評(píng)審委員會(huì)委員、聯(lián)合國(guó)工業(yè)發(fā)展組織中國(guó)投資貿(mào)易促進(jìn)處綠色專(zhuān)家委員會(huì)專(zhuān)家組成員，曾任國(guó)家科學(xué)技術(shù)獎(jiǎng)評(píng)審專(zhuān)家、《中國(guó)生化藥物雜志》編委。