主要從事生物醫(yī)學(xué)工程、生物力學(xué)、組織工程、航天航空生物醫(yī)學(xué)工程、康復(fù)工程研究�，F(xiàn)任北京航空航天大學(xué)生物與醫(yī)學(xué)工程學(xué)院院長，教授、博士生導(dǎo)師。現(xiàn)任世界生物力學(xué)理事會理事，全國生物力學(xué)專業(yè)委員會主任，中國生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)會理事長，中國力學(xué)學(xué)會理事，教育部“生物力學(xué)與組織工程”重點實驗室學(xué)術(shù)委員會副主任，中國生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)會組織工程分會委員，教育部生物醫(yī)學(xué)工程專業(yè)教學(xué)指導(dǎo)委員會委員，亞太生物力學(xué)理事會理事，中華醫(yī)學(xué)會醫(yī)學(xué)工程分會血管外科與組織工程專業(yè)委員會委員，《生物醫(yī)學(xué)工程雜志》副主編，《中國生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)報》、《航天醫(yī)學(xué)與醫(yī)學(xué)工程》、《計算力學(xué)學(xué)報》、《生物物理學(xué)報》、《醫(yī)用生物力學(xué)》、《四川大學(xué)學(xué)報（工程版）》編委，國家自然科學(xué)基金數(shù)理學(xué)部評審專家。入選教育部跨世紀優(yōu)秀人才計劃、教育部新世紀人才計劃,2001年獲香港Croucher大陸青年訪問學(xué)者獎勵基金，四川省學(xué)術(shù)技術(shù)帶頭人。主持開發(fā)的人體血液循環(huán)模擬實驗系統(tǒng)、人體下肢假肢接受腔設(shè)計判斷軟件系統(tǒng)、細胞力學(xué)脈動流Flow Chamber新型實驗系統(tǒng)、人體體表損傷法醫(yī)學(xué)鑒定軟件等，既具學(xué)術(shù)創(chuàng)新性又有實際應(yīng)用價值。

2020年1月10日，北京航空航天大學(xué)醫(yī)學(xué)科學(xué)與工程學(xué)院成立大會召開，北京航空航天大學(xué)生物與醫(yī)學(xué)工程學(xué)院院長樊瑜波任院長。

迄今發(fā)表論文170余篇，承擔(dān)包括國家自然科學(xué)基金重點項目在內(nèi)的20余項科研課題，獲教育部科技進步二等獎1項（2003）、四川省高校優(yōu)秀教學(xué)成果二等獎3項（1996、2000、2004）、中國寶鋼高校優(yōu)秀教師獎（1998），四川省十佳高校青年教師（2003）、成都市高校優(yōu)秀青年教師獎（1997），獲省級科技進步三等獎1項（2001）、市級二等獎1項。

血流動力學(xué)、康復(fù)工程、口腔生物力學(xué)、骨生物力學(xué)、細胞力學(xué)與組織工程等，近來涉足航天、航空生物醫(yī)學(xué)工程及人體工效學(xué)。