馮玉祥視察西南時(shí)，發(fā)現(xiàn)其功績(jī)，贊其為“模范 縣長(zhǎng)”。因此，1940年6月，孔福民從三等縣桐梓調(diào)任一等縣遵義縣任縣長(zhǎng)，1943年，中共叛徒、中統(tǒng)特務(wù)鮑滄，被派到遵義專員公署作視察，這是對(duì)外掩護(hù)的身份，實(shí)際是“中國(guó)國(guó)民黨中央調(diào)查統(tǒng)計(jì)局黔北督導(dǎo)區(qū)主任”，他要派兩個(gè)特務(wù)去作鄉(xiāng)鎮(zhèn)長(zhǎng)，被縣長(zhǎng)孔福民拒絕。鮑滄就抓了一個(gè)記者，一個(gè)縣政府的股長(zhǎng)，以手槍逼使他們承認(rèn)和孔福民、以及三個(gè)科長(zhǎng)李祺增、吳樹(shù)樾、鐘麒麟6人是共產(chǎn)黨支部的。孔福民押到貴陽(yáng)監(jiān)獄，省主席吳鼎昌不相信這回事，將其釋放，1943年4月，孔福民被委任為獨(dú)山縣長(zhǎng)。

1944年，美、英、蘇三國(guó)與中國(guó)聯(lián)合修建獨(dú)山機(jī)場(chǎng)。獨(dú)山專員公署下令調(diào)集10縣3萬(wàn)多民工，自備糧食、工具，投入現(xiàn)場(chǎng)施工。施工民工，以縣為單位編中隊(duì)，縣長(zhǎng)任中隊(duì)長(zhǎng)。另一個(gè)中隊(duì)約200多人，由當(dāng)時(shí)流入獨(dú)山縣境內(nèi)的難民組成，名為“以工代撫”施工隊(duì)。總隊(duì)長(zhǎng)由獨(dú)山縣縣長(zhǎng)孔福民擔(dān)任。

1944年11月下旬桂林、柳州失守后，貴州緊急，獨(dú)山縣政府組織“國(guó)民抗敵自衛(wèi)團(tuán)”，縣長(zhǎng)孔福民兼司令，副司令羅士彬兼第1支隊(duì)長(zhǎng)，副司令莫鳳樓兼第二支隊(duì)長(zhǎng)。

1946年初，國(guó)民黨行政院院長(zhǎng)宋子文由天津抵青島，組織成立敵偽產(chǎn)業(yè)審議委員會(huì)，指定彭石年為主任委員，楊公兆、孔福民等7人為委員。后任青島市財(cái)政局局長(zhǎng)，當(dāng)選第一屆國(guó)民大會(huì)代表。?

孔福民主持編著了《桐梓縣概況》。