孫希旦出身于書香門第，自幼聰明好學(xué)，過目成誦。十二歲就成為縣學(xué)生員，不但文章、詩詞寫得好，學(xué)問博涉經(jīng)典、天文、輿地、歷算等。

二十七歲，乾隆二十七年（1762）中舉人。

三十四年（1769）參加禮部會試，中正榜，因限于名額，別為一榜，以內(nèi)閣中書候缺，成《尚書顧命解》。

三十六年，補授內(nèi)閣中書，時四庫全書館開，擔(dān)任分校官。校勘宋朝王應(yīng)麟撰的《玉�！罚�200卷），《四庫全書》第一部成，議敘加一級。

四十三年（1778），他參加會試、殿試，登戊戌進士，皇上親擢一甲第三名探花（注：一甲前兩名分別是狀元和榜眼），賜及第，授翰林院編修。主考于敏中讀其殿試對策，以為“使他人檢書為之，不能有此”，諭浙江同榜門生師事之。

乾隆四十三年秋，丁母憂，他居家整理舊作，寫成《禮記集解》(五十卷)，并主講溫州城內(nèi)中山書院，其生徒有黃大觀、石建章等。服滿，于四十六年春回京，補考散館一等，任武英殿分校官兼國史三通館纂修官。朝廷令他厘定《契丹國志》和《金國志》。孫希旦白天在國史館、三通館和繕書所�？薄队窈！�，晚上厘定契丹、金兩志，并起草《續(xù)通典凡例》。

由于他學(xué)識淵博，同館閣的同事和弟子常請他講解或解釋編纂中的疑問，工作十分辛苦。孫希旦終因食少事繁，積勞成疾，在任內(nèi)以痢疾去世。在彌留之際，口占七絕詩一首：

人禽相去只幾稀，物欲橫流天理微。

病里靜思半世事，茫茫四十九年非。

孫希旦墓在今浙江省瑞安縣碧山鎮(zhèn)馬河龍頭庵。

孫希旦平生不茍權(quán)勢，生活清貧淡泊，不求車馬衣冠之好。臥病時，以告假辭，不接受國史館送來之公費錢。會試前，杜門謝客，雖密友亦不接見。某翰林欲授以“關(guān)節(jié)”，笑而不受。文華殿大學(xué)士和珅很賞識他的才華，想把他拉到門下為自己效勞，派家丁到他寓所，邀他必到相國府一敘，被希旦拒絕，嘗說：“學(xué)道而以為名，吾所恥也�！倍∧笐n回鄉(xiāng)時，溫州知府和瑞安等縣知縣到他家鄉(xiāng)吊祭，見孫宅破舊，擬出銀為他修建新宅，他婉言加以謝絕；地方官員給他送禮，也被一一拒絕。

孫希旦的著作除上述的《禮記集解》(一九八九年中華書局列入《十三經(jīng)清人注疏》出版）外，還有甌風(fēng)社印本《敬軒詩存》傳世。

孫希旦堪稱后世楷模，碧山桐田孫氏后裔設(shè)“孫希旦紀(jì)念廳”，編《紀(jì)念孫希旦文集》，弘揚他“潔身不阿，清正廉明”的精神。

幼有奇慧，讀書三四過即能成誦。12歲，補縣學(xué)生員。

清乾隆二十七年（1762）中舉人。次年撰《周禮》注說《大祝九祭說》、《會同說》等10篇。浙江學(xué)政竇光鼐見其文，贊為“古作者”。余姚邵晉涵旅途同艙，聞其論經(jīng)史百家，滔滔不絕，大為嘆服，遂訂交。

三十四年會試，取中正榜，得內(nèi)閣中書，回家候缺，著《尚書顧命解》。

三十六年，赴京任職，著《禮記注疏駁誤》。續(xù)任《四庫全書》分校官，專校王應(yīng)麟《玉�！�。書成，丁父憂回鄉(xiāng)。

四十三年，應(yīng)禮部試，以一甲三名及第，授翰林院編修，總裁于敏中讀其殿試對策，以為“使他人檢書為之，不能有此”，諭同榜門生師事之。秋，丁母憂，家居整理舊作，成《禮記集解》50卷。主講溫州城內(nèi)中山書院，其生徒有黃大觀、石建章等。

四十六年春，服滿回京，補考散館一等，任武英殿分校官兼國史三通館纂修官，起草《續(xù)通典凡例》，校纂甚勤。厘正《契丹國志》、《金國志》，乾隆以為佳善，敕部議敘。因積勞成疾，

四十九年十一月九日卒，年僅49歲。瑞安城西外陶尖舊有少年讀書處，俗稱“探花樓”，已毀。墓葬在碧山鎮(zhèn)馬河村龍頭庵。

平生為學(xué)一宗程朱，矜持名節(jié)。大學(xué)士和珅聞其博學(xué)，愿得一見，謝不往；臥病家居，史館月致公費錢，因在假，辭不受。認為“學(xué)道而以為名，我所恥也”！于書無所不窺，旁涉天文、地輿、鐘律、歷算、卜筮，尤深于《三禮》，其后專治《小戴禮》。孫衣言記其行述，認為“其于名物制度，考察精詳，可以補漢儒所未及。而深明先王制作之意，以即乎人心之所未安，則又漢儒所不逮”。

遺著有《求放心齋詩文集》和《禮記集解》等�！都�解》一書，孫鏘鳴校于咸豐十年六月，共六十一卷，附《尚書顧命解》，同治七年三月刊成。中華書局列入《十三經(jīng)清人注疏》，1989年出版。