萬歷八年(1580)進(jìn)士，授松江(今屬上海市)府推官。富豪陰結(jié)殺人埋尸者，觸犯法網(wǎng)，抓捕時(shí)，狡窟自匿。徐民式到任時(shí)，抓捕神速，諸豪都膽懾。時(shí)宰輔子弟在松江仗勢(shì)欺人，官吏只能聽之任之。徐民式對(duì)這些子弟予以依法裁決。后改任南京戶部江西司主事，升為山西司郎中，出任安慶(今屬安徽)府知府，聽斷公平，非重犯不忍逮系，以至訴訟極少，郡齋寂如。他捐俸購(gòu)置郡縣學(xué)田，又建預(yù)備倉(cāng)，積米百萬石，以備災(zāi)年。大學(xué)士陳于升為他請(qǐng)獎(jiǎng)，舉循良二千石，處于京堂官，尚書孫丕揚(yáng)疏薦擢民式為南京光祿寺少卿，歷通政司參議轉(zhuǎn)太仆寺少卿，升都察院右僉都御史、巡撫江南。當(dāng)時(shí)吳中(今江蘇一帶)田地百分之九十歸縉紳家，稱作官戶，有些人就投托到官戶，以逃避重役。民式下令各府進(jìn)行清查，除例應(yīng)優(yōu)免外，其余全部要受役并請(qǐng)于朝廷，著為令。他巡撫江南6年，以母年高，6次上疏請(qǐng)回籍養(yǎng)親。明萬歷四十五年八月報(bào)升戶部侍郎，但徐民式已于五月卒于家。著有《撫吳疏草》12卷。