抗日戰(zhàn)爭時(shí)期參加革命，曾任閩中抗日游擊隊(duì)?wèi)?zhàn)士，參加了閩中沿海地區(qū)抗日游擊戰(zhàn)爭。抗日戰(zhàn)爭結(jié)束后，國民黨當(dāng)局對閩中抗日武裝發(fā)動大規(guī)模的“清剿”，吳翊耀隨隊(duì)轉(zhuǎn)移到福清、長樂、莆田邊界山區(qū)發(fā)動群眾，堅(jiān)持游擊斗爭。1948年受命回到平潭組建革命武裝，任平潭人民游擊隊(duì)分隊(duì)長，參加了創(chuàng)建平潭游擊根據(jù)地的斗爭和第一次解放平潭縣城等戰(zhàn)斗。1949年5月平潭縣人民游擊隊(duì)奉命到閩中革命根據(jù)地整編，任閩淅贛邊區(qū)縱隊(duì)閩中支隊(duì)平潭大隊(duì)分隊(duì)長，隨后在閩中參加游擊戰(zhàn)爭。

1949年6月，福清縣國民黨軍保安團(tuán)“清剿”閩中根據(jù)地，閩中支隊(duì)在福清蔡安阻擊進(jìn)犯敵軍，吳翊耀奉命率5名戰(zhàn)士堅(jiān)守山頭陣地，在戰(zhàn)斗中頭部中彈壯烈犧牲。