天啟四年(1624年)，在主持湖廣地區(qū)地方鄉(xiāng)試向考生提問時事時，發(fā)策有“巨珰大蠹”語，得罪朝中大奸臣魏忠賢的爪牙，因而被誣陷削職回到家中。崇禎年間，奸黨被除后，方逢年又重新被起用，在朝中擔(dān)任日講官，后又升至國子監(jiān)祭酒(官名)、禮部尚書兼東閣大學(xué)士。入閣輔政。 后罷歸。

甲申國變后，安宗時復(fù)原官，不奉召。魯王用其議稱監(jiān)國，流落在海島上，逢年追趕不及，監(jiān)國魯元年（隆武二年，1646年）清軍破紹興，方假意向清軍投降，暗中將書信密封在蠟丸中，把清軍動向告訴在福建的隆武帝，但這件事做得不夠機(jī)密，事情泄露后方逢年被清軍捕殺。方逢年著有《雪滌齋集》一卷。

《明史》卷二百五十三 列傳第一百四十一 方逢年傳

方逢年，遂安人。萬歷四十四年進(jìn)士。天啟四年，以編修典湖廣試，發(fā)策有“巨珰大蠹”語，且云“宇內(nèi)豈無人焉？有薄士大夫而覓皋、夔、稷、契于黃衣閹尹之流者”。魏忠賢見之，怒，貶三秩調(diào)外。御史徐復(fù)陽希指劾之，削籍為民。

崇禎初，起原官，累遷禮部侍郎。十一年詔廷臣舉邊才，逢年以汪喬年應(yīng)。未幾，擢禮部尚書，入閣輔政。其冬，刑科奏摘參未完疏，逢年以犯贓私者，人亡產(chǎn)絕，親戚坐累，幾同瓜蔓，遂輕擬以上。而帝意欲罪刑部尚書劉之鳳，責(zé)逢年疏忽。逢年引罪，即罷歸。

福王時，復(fù)原官，不召。魯王三召之，用其議，定稱魯監(jiān)國。紹興破，王航海，逢年追不及，與方國安等降于我大清。已而以蠟丸書通閩，事泄被誅。