光緒十四年(1888)，他將設(shè)在袁江覺津寺的診所取名“化奇軒”，意要化難為易，創(chuàng)造醫(yī)學(xué)上的奇跡。從此，他白天接診，開方施藥，夜里孤燈伴讀，廣涉歷代名醫(yī)有關(guān)霍亂的論述，診治此病的醫(yī)案，分析霍亂的成因，探究預(yù)防醫(yī)治之道，有前人經(jīng)驗(yàn)的借鑒，加之自身的刻苦鉆研，他逐漸掌握了治療霍亂的很多方法。對(duì)染上是疫的上門求醫(yī)者，思文均能根據(jù)患者的不同年齡和性別，擇方施藥，故而治愈者眾。一時(shí)間，“走進(jìn)化奇軒，好似見著活神仙”的贊譽(yù)便廣為流傳，四方慕名而來的病人更是絡(luò)繹不絕。
醫(yī)名日隆的許思文并未因此而停止對(duì)診治霍亂之道的探究。他認(rèn)為“謀事皆應(yīng)從事前用力，預(yù)防重于診治�！睘轵�(yàn)證自己的預(yù)防霍亂是否有效，光緒二十年(1894)他自制了大量的中成藥，用麻袋盛裝，沉于淮河大閘之底，是年夏秋，雖然炎熱異常，但飲大閘下游之水的兩岸百姓卻很少染上霍亂之疫的。此舉使思文欣喜萬分。
長期的理論探索，多年的臨床實(shí)踐，許思文終于形成了一套較為完善的辨證防治霍亂的方法�？少F的是，他并未將此視為一己之私、奉為秘方不愿示人，而是以審慎的態(tài)度毫無保留地訴諸筆墨，期盼著自己的防治之道能給四海之內(nèi)的醫(yī)者以借鑒，給更多的患者以生機(jī)。

光緒二十八年(1902年)在友人的資助下，其畢生心血的結(jié)晶一一《黑羅痧問答論》一書終于刊行問世，實(shí)現(xiàn)了他濟(jì)世活人的愿望。
此書先述霍亂之狀：“初病吐瀉，繼而肢涼，卒然羅癟”；次析此病成因：“或四時(shí)寒濕凝滯于脈絡(luò)，或夏月濕熱郁遏于經(jīng)隧，或鼻聞臭味而陽逆經(jīng)氣，或內(nèi)因停積而壅塞府氣，陰陽錯(cuò)亂，得之于貪涼，得之于食冷，胃脘氣逆，因而發(fā)作。”后述辨證醫(yī)治之法．有論有方，對(duì)預(yù)防、急救、治療、內(nèi)服、外治、針灸等方面均有介紹。
此書的刊行，給當(dāng)時(shí)眾多的霍亂患者帶來了福音。正如吳公望先生在此書的后跋中所言：“但得是書者，味其說，遵其方，即遭其痰亦鮮有懼也!”