明末清初，時(shí)人費(fèi)密在《荒書》中說：“(樊)一衡嘗為陜西邊道，(趙)榮貴、賀珍皆在部下。一衡還蜀，二人親送之，有舊恩。”樊一茜是在崇禎十二年寧夏巡撫任上被幼丟官回四川老家的，這說明當(dāng)時(shí)的賀珍是明朝軍官。他是什么時(shí)候歸降李自成的？崇禎十二、三年間，李自成被明朝官軍困在漢南、川東的萬山叢中，勢孤力弱，賀珍極不可能在這期間去投奔李。崇禎十四年正月，李自成破洛陽、殺福王，天下震動。從此以后連戰(zhàn)連捷，迅速攀上了勝利的巔峰。賀珍歸降李自成應(yīng)是崇禎十四年春至十六年秋之間的事。

1645年（順治二年、弘光元年），二月，李自成倉促撤離關(guān)中后,滿清重兵入陜。賀珍夥同羅岱、黨孟安、郭登先以漢中之地投降清朝，由英親王阿濟(jì)格札授漢中總兵。隨后，陜北等地大順軍在李過、高一功、李友、田虎等率領(lǐng)下取道漢中入川時(shí)，賀珍率部阻擊。

1645年六月初,賀珍入川與張獻(xiàn)忠大西軍作戰(zhàn)，大敗張獻(xiàn)忠三萬大軍。

1645年十二月初，賀珍在漢中重舉義旗抗清,自稱奉天倡義大將軍(這是李自成用過的頭銜)，以示繼承李自成的事業(yè)，率勁兵兩萬出連云棧，一舉攻占鳳翔。當(dāng)?shù)伛v軍武大定、石國璽與寶雞駐軍高汝礪都舉兵反正，響應(yīng)賀珍，攻下隴州、固原等地，殺清總兵何世元。隨即靜寧、靈臺、關(guān)中各地義軍群起響應(yīng)。

1646年（順治三年）一月三十一日，賀珍部攻破郿縣。殺縣令宋永譽(yù)、典史傅弼等。

1646年夏，賀珍、孫守法與大順軍劉體純部在陜南會師，攻占興安(今安康市)及其屬縣，并建立抗清政權(quán)，但不久在優(yōu)勢清軍圍攻下失敗。

1647年，清軍攻五郎山，孫守法遇難，賀珍退到川東繼續(xù)堅(jiān)持抗清斗爭。

1651年(順治八年)底，賀珍、劉體純、袁宗第、塔天寶、李來亨、郝?lián)u旗等人率領(lǐng)的大順軍余部，先后轉(zhuǎn)移到川東地區(qū)，與當(dāng)?shù)乜骨逦溲b相結(jié)合，組成了著名的“夔東十三家”。

1662年，賀珍病死在抗清的根據(jù)地大寧。

《明史·文安之傳》記桂王永歷政權(quán)太子太保兼吏兵二部尚書、總督川湖諸處軍務(wù)文安之(湖廣夷陵人)聯(lián)絡(luò)夔東十三家“共獎王室”，永歷帝“進(jìn)諸將王光興、郝永忠、劉體仁、袁宗第、李來亨、王友進(jìn)、塔天寶、馬云翔、郝珍、李復(fù)榮、譚弘、譚詣、譚文、黨守素等公侯爵，即令安之賚赦印行”

賀珍駐大寧縣(今重慶巫溪縣)，袁宗第駐大昌縣(今重慶巫山縣大昌鎮(zhèn))，郝?lián)u旗駐房縣羊角寨，李來亨駐興山縣七連坪，黨守素駐巴東縣，劉體純、馬騰云駐巴縣陳家坡，塔天寶駐巴東縣平陽壩，譚文、譚詣、譚弘駐萬縣天生城，王光興駐施州衛(wèi)。他們都接受了永歷政權(quán)的封賜，“用永歷年，假故明封號”。其中李來亨封臨國公，劉體純封皖國公，郝?lián)u旗封益國公，袁宗第封靖國公，馬騰云封桐城侯(一作陽城侯)，塔天寶封宜都侯，黨守素封興平侯，賀珍封岐侯；王光興封南漳伯，譚文封涪侯，譚詣封仁壽侯。