賀圣遂1993年調(diào)任出版社，任副社長；2000年出任社長，2008年4月兼任總編輯；2009年出版社改制完成，任復(fù)旦大學(xué)出版社有限公司董事長兼總編輯。依托學(xué)校優(yōu)秀的作者資源，出版社一直堅持高水準(zhǔn)一流教材與原創(chuàng)性學(xué)術(shù)著作的出版理念，推出了《中國文學(xué)史》、《中國思想史》、《中國人口史》等一大批廣受好評的一流學(xué)術(shù)著作，受到社會各界廣泛好評，其中部分著作榮獲國家級、省部級圖書獎勵，獲獎數(shù)量在全國大學(xué)出版界名列前茅。在獲得社會效益的同時，出版社產(chǎn)業(yè)規(guī)模和經(jīng)濟(jì)效益穩(wěn)定、持續(xù)上升，國有資產(chǎn)保值增值在上海市出版業(yè)名列前茅。企業(yè)發(fā)展的同時，員工的待遇也獲得同步提升，出版社呈現(xiàn)出團(tuán)結(jié)和諧、蓬勃向上的精神面貌。

新中國成立60年來，涌現(xiàn)出一大批社會責(zé)任感強(qiáng)、積極進(jìn)取、勇于開拓的新聞出版先進(jìn)人物，為樹立典范、鼓勵先進(jìn)，促進(jìn)新聞出版事業(yè)的進(jìn)一步大發(fā)展，新聞出版總署決定評選并表彰100位做出突出貢獻(xiàn)的出版企業(yè)家。此次“全國百名優(yōu)秀出版企業(yè)家”的評選涵蓋了圖書、報刊、電子、網(wǎng)絡(luò)、數(shù)字出版、發(fā)行、印刷等企業(yè)的高層管理人員，賀圣遂的入選即是對他個人成就的表彰，也是對復(fù)旦大學(xué)出版社多年來堅持正確出版方向、發(fā)揮特色優(yōu)勢、不斷發(fā)展壯大的成績的肯定。