于瑞海主要研究的方向是貝類繁育與遺傳育種，以及貝類苗種高產(chǎn)穩(wěn)產(chǎn)生產(chǎn)技術(shù)及養(yǎng)殖方面的研究工作。先后參加了九五國(guó)家高新研究發(fā)展計(jì)劃（ 863 計(jì)劃） -- 牡蠣三倍體育苗與養(yǎng)殖技術(shù)的研究，國(guó)家攀登 B 計(jì)劃 — 貝類性腺發(fā)育研究，國(guó)家自然科學(xué)基金：牡蠣三倍體快速生長(zhǎng)機(jī)理的研究和櫛孔扇貝雌核發(fā)育二倍體誘導(dǎo)技術(shù)研究；參加了十五國(guó)家 863 重大項(xiàng)目 — 扇貝優(yōu)良品種的改良；國(guó)家 863 青年基金：牡蠣四倍體培育技術(shù)，以及省市項(xiàng)目 3 項(xiàng)；在國(guó)家核心期刊上共發(fā)表論文 60 多篇，編寫(xiě)和參編著作 5 部。先后獲得省部級(jí)科技進(jìn)步一等獎(jiǎng) 2 項(xiàng)，三等獎(jiǎng) 2 項(xiàng)，市級(jí) 3 項(xiàng)，發(fā)明專利 2 項(xiàng)。