博士學(xué)位論文《環(huán)境與人：江南傳染病史研究（1820-1953）》（導(dǎo)師：葛劍雄教授）入選2006年全國優(yōu)秀博士學(xué)位論文。入選2008年度教育部新世紀(jì)優(yōu)秀人才計(jì)劃。

《鼠疫：戰(zhàn)爭與和平：中國的環(huán)境與社會變遷（1230-1960年）》（與曹樹基合著，第二著者）獲2008年上海市哲學(xué)社會科學(xué)優(yōu)秀成果二等獎。

研究領(lǐng)域?yàn)闅v史地理學(xué)、疾病史和海洋環(huán)境史。

強(qiáng)調(diào)采用自然科學(xué)手段理解過去環(huán)境變動，并重新思考?xì)v史進(jìn)程。主持國家自然科學(xué)基金等項(xiàng)目多項(xiàng)。

近期主要研究計(jì)劃為中國寄生蟲病歷史和東亞海洋生物種群歷史。

主要講授中國歷史地理概論、中國環(huán)境史、中國社會史、歷史文獻(xiàn)學(xué)等課程。

“歷史上黃渤海鯡魚資源數(shù)量的變動及原因（1368-1985）”（國家自然科學(xué)基金）、“中國海洋生物種群歷史研究”（教育部新世紀(jì)優(yōu)秀人才計(jì)劃）和“明初以來江南的環(huán)境與寄生蟲�。�1368-1978）”（教育部高等學(xué)校全國優(yōu)秀博士學(xué)位論文作者專項(xiàng)資金）。

1、《海有豐歉：黃渤海的魚類與環(huán)境變遷（1368~1958）》，上海交通大學(xué)出版社2011年版。

2、《文化元素·國家·地方——以青島文化為例》，吉林大學(xué)出版社2009年版。（論文集，與孟華共同主編）

3、《鼠疫：戰(zhàn)爭與和平——中國的環(huán)境與社會變遷（1230~1960年）》，山東畫報(bào)出版社2006年版。（與曹樹基合著，第二著者）

1．李玉尚：《霍亂在中國的流行（1817-1821）》，《歷史地理》第十七輯，上海人民出版社，2001年，頁316-336。

2．李玉尚、曹樹基：《咸同年間云南的鼠疫流行與人口死亡》，《清史研究》2001年第2期，頁19-32。

3．李玉尚：《民國時期西北地區(qū)人口的疾病與死亡——以新疆、甘肅和陜西為例》，《中國人口科學(xué)》2002第1期，頁34-42。

4．李玉尚：《近代中國社會對鼠疫的應(yīng)對機(jī)制——以云南、廣東和福建為例》，《歷史研究》2002年第1期，頁114-127。

5．李玉尚：《近代民眾對鼠疫的觀察與命名》，《中華醫(yī)史雜志》2002年第3期，頁173-178。

6．李玉尚、曹樹基：《清代云南昆明的鼠疫流行》，《中華醫(yī)史雜志》2003年第1期，頁67-71。

7．李玉尚：《和平時期的鼠疫流行與人口死亡——以近代廣東、福建為例》，《史學(xué)月刊》2003年9期，頁82-94。

8．李玉尚：《傳染病對太平天國戰(zhàn)局的影響》，《中央研究院近代史研究所集刊》，2004年總45期，頁1-45。

9．李玉尚：《地理環(huán)境與近代江南地區(qū)的傳染病》，《社會科學(xué)研究》2005年第6期，頁133-141。

10．李玉尚：《上海城區(qū)霍亂病史研究——以“地方病”和“外來病”的認(rèn)識為中心》，曹樹基主編《田祖有神——明清以來的自然災(zāi)害及其社會應(yīng)對機(jī)制》，上海交通大學(xué)出版社2007年版，頁361-392。

11．李玉尚：《清代中后期江南的傳染病》，王利華主編《中國歷史上的環(huán)境與社會》，北京三聯(lián)書店2007年，頁343-392。

12．李玉尚、陳亮：《清代黃渤海鯡魚資源數(shù)量的變動——兼論氣候變遷與海洋漁業(yè)的關(guān)系》，《中國農(nóng)史》2007年第1期，頁24-32。

13．李玉尚、趙瑋：《明清以來嘉湖地區(qū)耕牛的變化》，《社會科學(xué)研究》，2008年4期，頁157-161。

14．李玉尚：《嶗山沙子口海廟與天后宮的變遷》，《民俗研究》2008年第2期，頁120-137。

15．李玉尚：《明清以來蘇松太地區(qū)耕牛的時空分布》，《中國農(nóng)史》2008年第4期，頁3-10。

16．李玉尚：《明初以降江南農(nóng)業(yè)結(jié)構(gòu)轉(zhuǎn)變與疾病變遷——以鉤蟲病為中心》，劉翠溶主編《自然與人為互動：環(huán)境史研究的視角》，臺北聯(lián)經(jīng)出版公司2009年，頁473-522。

17．李玉尚、陳亮：《明代黃渤海和朝鮮東部沿海鯡魚資源數(shù)量的變動及原因》，《中國農(nóng)史》2009年第2期，頁9-22。

18．李玉尚、韓志浩：《霍亂與商業(yè)社會中的人口死亡——以1919年的黃縣為例》，《中國歷史地理論叢》2009年第4期，頁135－145。

19．李玉尚：《黃海鯡的豐歉與1816年之后的氣候突變——兼論印尼坦博拉火山爆發(fā)的影響》，《學(xué)術(shù)界》2009年第5期，頁42－55。

20．李玉尚：《清末以來江南城市的生活用水與霍亂》，《社會科學(xué)》2010年第1期，頁150-160。

21．李玉尚：《1600年之后黃海鯡的旺發(fā)及其生態(tài)影響》，《中國農(nóng)史》2010年第3期，第10-21頁。

22．李玉尚、車群、陳亮：《清代以來黃渤海真鯛資源的分布、開發(fā)與變遷》，《中國歷史地理論叢》2010年第3期，第125-137頁。

23．李玉尚：《海灣環(huán)境變遷與黃海鯡中心產(chǎn)卵場內(nèi)部的變動》，《魯東大學(xué)學(xué)報(bào)》(社科版)2010年第5期，第85-88頁。

24．Li, Yu-shang, “The Elimination of Schistosomiasis in Jiaxing and Haining Counties, Public Health as Polical Movement”, Angela KC Leung and Charlotte Furth eds., Health and Hygience in Moedern Chinese East Asia, Duke University Press, 2010,pp.209-227.

25．李玉尚：《三江閘與1537年以來蕭紹平原的姜片蟲病》，《中國農(nóng)史》2011年第4期，頁93-106。

26．李玉尚：《感潮區(qū)變化與青浦沿湖地區(qū)的血吸蟲病——以任屯為中心》，《南開學(xué)報(bào)》（社科版）2011年第5期，頁40-50。

27．車群、李玉尚：《所反映的1600年前后氣候突變》，《中國農(nóng)史》2011年第1期，頁120-127。

28．王濤、李玉尚：《民國時期奉天地區(qū)度量衡考》，《上海交通大學(xué)學(xué)報(bào)》（社科版）2011年第3期，頁56-63。