第三高等學(xué)校醫(yī)學(xué)部畢業(yè)，1898年入傳染病研究所，在所長(zhǎng)北里柴三郎制導(dǎo)下研究鼠疫八年。1907年留學(xué)德國(guó)，起先在柏林柯霍研究所受華賽爾曼教授指導(dǎo)，后師事保羅·埃爾利希博士，1909年同埃爾利希博士一道研究砒素要?jiǎng)┑男Я�，發(fā)現(xiàn)606號(hào)砒素劑對(duì)回歸熱最有效力，其后經(jīng)過(guò)多次動(dòng)物實(shí)驗(yàn)和人體實(shí)驗(yàn)，發(fā)現(xiàn)606號(hào)砒素劑對(duì)梅毒、瘧疾都有特效，秦當(dāng)時(shí)做了一千多種實(shí)驗(yàn)，被認(rèn)為是同埃爾利希共同研制606劑成功的人，1910年回國(guó)任職于傳染病研究所，1914年任北里研究所研究部長(zhǎng)。