董慧至上海后，公開身份是道亨銀行上海分行的一名普通職員，中共的大量情報經(jīng)費就以董慧名義在銀行里建立賬戶。她還利用往來于滬港之間專跑銀行業(yè)務的可靠同事或其他社會關(guān)系，把經(jīng)過包裝或密寫的重要材料(包括請示和指示文件)往返傳送。在五年多的時間里，她把秘密經(jīng)費的管理、秘密文件的傳遞和她公開的職員身份以及她家庭的特殊地位巧妙地結(jié)合起來，在十分尖銳復雜的環(huán)境下，從未出現(xiàn)過任何閃失。特別是太平洋戰(zhàn)爭爆發(fā)，香港淪陷，在經(jīng)費不足的緊要關(guān)頭，動用了自己的積蓄乃至董家私產(chǎn)，使香港的中共情報工作人員全部安全撤退和轉(zhuǎn)移。她一心為公的行為受到戰(zhàn)友們的敬重。

民國34年1月，董慧調(diào)回延安，在中共中央社會部機關(guān)工作。抗戰(zhàn)勝利，董慧調(diào)沈陽掩護潘漢年工作。國共和談破裂，董慧又隨潘漢年至香港。民國36年，29歲的董慧和潘漢年在香港董家舉行婚禮。

上海解放，董慧在中共華東局統(tǒng)戰(zhàn)部任秘書科長。當時潘漢年任中共上海市委副書記、常務副市長兼中共華東局統(tǒng)戰(zhàn)部部長，董慧從不以夫人身份出現(xiàn)，與部門同志相處融洽。1952年，中共上海市委統(tǒng)戰(zhàn)部成立，董慧任秘書處處長(兼管黨派處)。社會主義改造時期，董慧參加上海市宗教工作委員會工作。在對私營資本主義工商業(yè)進行社會主義改造工作進入高潮時，任中共上海市委統(tǒng)戰(zhàn)部下的工商處副處長。她曾深入工廠蹲點，調(diào)查勞資關(guān)系。1955年4月突然蒙冤，潘漢年、董慧被指控為"內(nèi)奸"而逮捕，從此開始了長達二十年的冤獄生涯。

經(jīng)七年審查并未查出董慧有任何"危害革命"的證據(jù)，但仍以"參與潘漢年內(nèi)奸活動"、"罪行輕、態(tài)度好"為名，宣布"免予追究刑事責任"，可以釋放，但必須居住在監(jiān)獄家屬區(qū)參加勞動。有人勸董慧和潘漢年離婚，自己就可恢復黨籍，分配工作；有人勸她申請回香港，但她選擇了等待潘漢年結(jié)案，同他共度患難余生的道路。1963年，董慧被遷到北京市南郊團河農(nóng)場與潘漢年同住，雖然冤屈未伸，但這四年是董慧夫婦蒙冤后過的一段最平靜的日子。

"文化大革命"開始，潘漢年重新收監(jiān)復查，董慧繼續(xù)因株連而重回監(jiān)獄，夫婦倆被分開關(guān)在秦城監(jiān)獄又是整整八年。1975年5月，董慧作為人民內(nèi)部矛盾處理，與內(nèi)定"無期徒刑"的潘漢年一起發(fā)配到湖南省茶陵江勞改農(nóng)場。此時，董慧在江青反革命集團的折磨下已患精神分裂癥，動脈硬化，左腿骨折，生活不能自理；潘漢年已患晚期肝癌和類風濕病。江青反革命集團被粉碎后，"潘案"尚未來得及重新處理，潘漢年病情惡化逝世，董慧仍留在農(nóng)場。

1979年2月24日病故于湖南。1982年8月，中共中央發(fā)出《關(guān)于為潘漢年同志平反昭雪恢復名譽的通知》，正式為潘、董平反昭雪。

董慧終于得到正確結(jié)論："董慧從1939年到上海解放止，在潘漢年領(lǐng)導下從事黨的情報工作，是有成績的。董慧同志是忠于黨的好黨員。"