早年受業(yè)于著名學(xué)者嚴衍，學(xué)習(xí)經(jīng)史，砥礪名節(jié)，兼攻舉業(yè)。崇禎三年（1630），赴南京參加鄉(xiāng)試，成舉人。七年后，登科中進士，傳捷鄉(xiāng)里。不久，授任武昌府推官。在明朝，推官是知府的佐貳官，雖然只是七品銜，但掌刑名、贊計典，事務(wù)冗雜，關(guān)隘頗多，很能考驗一個人的能力和品質(zhì)。施鳳儀不負所學(xué)，在武昌期間，平理了多起冤獄，留下了廉潔賢能的美名，頗受上司賞識和器重。任滿后，奉詔回京述職，等待升遷，但未及覲見崇禎帝，京城就被大順軍攻破。崇禎自縊，百官惶亂，政局一時無法收拾。猝早國變，施鳳儀倉皇匿身于佛寺之中，事后乘機潛回南京。

這并不意味著施鳳儀貪生怕死，茍且偷生。他是在等待時機，準備挽救風(fēng)雨飄搖中明王朝，甚至不惜為之獻身殉節(jié)。當(dāng)時，史可法正督兵揚州，防堵清軍南下。施鳳儀前往投效，與史可法一見如故。史氏對其才能極為賞識，當(dāng)即疏請南明皇帝授予施鳳儀職方郎中之職，協(xié)助自己贊劃軍事，共守揚州。此時，業(yè)師嚴衍也寄詩勉勵他說：“吞刀可刮腸，飲灰能滌胃�！币簿褪钦f，現(xiàn)在時勢雖然艱難，卻正是你施展才能、揚名立節(jié)的好時候。施鳳儀亦答以壯語：“少卻項背一刀，以致風(fēng)波萬疊，儀不敢愛身以辱師命！”可見，施鳳儀對目睹北京淪陷而無能為力并倉皇逃歸南方的舊事耿耿于懷，發(fā)誓死守揚州，一雪前恥。

清順治二年（南明弘光元年，1645）四月，清軍壓境，史可法等力戰(zhàn)不敵，揚州危在旦夕。是時，施鳳儀奉命守北門，本可在城破之前全身而退，但他堅守“城存與存，城亡與亡”的誓言，與敵人周旋到底。直至最后一兵一卒陣亡，施鳳儀仍然毫不退卻，堅坐城上，最終死于亂兵之手。他的仆人也是忠義之士，悄悄將其尸身埋葬在揚州城邊的蒿草從中。兩年后，再去尋找，已尸骨無存，只剩下頭發(fā)了。所以，家人只能在羅店為其修建了一座衣冠冢。

在天崩地坼的在王朝更迭之際，是殉節(jié)舊朝，還是投身新朝，抑或是以遺民終老，這是適逢其變的士人都不能不面對的問題。施鳳儀選擇了第一種，保全了名節(jié)，留下寡妻幼子艱難地過活。友人慕其節(jié)義，紛紛作詩悼念，其中以嚴恒的《悼施職方》尤為凄清哀婉，特錄之如下：

山房紀夢字分明，自遘回飚地軸傾。

項背一刀全素志，風(fēng)波萬迭任輿情。

凄涼寡婦持門戶，辛苦諸孤屬友生。

蒿葬城隅惟發(fā)在，幽魂誰與薦杯羹？

施鳳儀生前亦愛吟詠，與同鄉(xiāng)文士王泰際、唐培等多有唱和。因故宅有“鄰竹山房”，遂將所作命名為《鄰竹山房稿》，今已佚。部分詩詞保留在清康熙間王輔銘編纂的《明練音續(xù)集》及光緒間潘履祥編纂的《羅店鎮(zhèn)志》中。