擅長感染病的診斷與治療，特別是艾滋病的診斷、治療、耐藥、機會性感染，合并相關性疾病，HIV陰性的藥物預防。

首都醫(yī)科大學附屬北京地壇醫(yī)院感染性疾病診療中心主任

首都醫(yī)科大學艾滋病診治和研究中心主任

首都醫(yī)科大學傳染病學系系副主任

中華傳染病與寄生蟲分會艾滋病學組副組長

國家衛(wèi)生計生委性病艾滋病協(xié)會專家委員會副主任委員

中國研究型醫(yī)院學會感染病學專業(yè)委員會常務委員

Lancet HIV（柳葉刀 HIV）國際委員

Journal of Acquired Immune Deficiency Syndromes（JAIDS）編委

Current HIV/AIDS Reports編委

Journal of Therapy and Management in HIV Infection編委

AIDS Patient Care and STDs編委

AIDS中文版副主編

主持國家“十五”、“十一五”和“十二五”科技重大專項，主持和參與美國國立衛(wèi)生研究院（NIH）的多項艾滋病研究及其他各種的科研項目，包括：

異源雙鏈泳動分析技術的建立及其在HIV-1基因變異和臨床中的應用研究

我國既往有償供血人群艾滋病流行病學與控制策略研究

2002年起在衛(wèi)生部的領導下負責組織、協(xié)調和實施國家的艾滋病免費抗病毒治療，治療HIV/AIDS超過60萬，挽救了大量病人生命，減少了HIV性傳播。

從事傳染病的臨床、教學和科研工作31年，是國內最早開展艾滋病抗病毒治療的醫(yī)生，領導中國首例黃熱病的治療和科研工作。

1．《傳染科疾病的誤診誤治與防范》丁靜秋，徐道振主編，科學技術文獻出版社， 2001年2月第1版，張福杰，腸阿米巴病.

2．《艾滋病的臨床診斷、治療及護理》曹韻貞主編，人民衛(wèi)生出版社，2002年1月第一版，張福杰，HIV/AIDS的抗病毒治療， 48~57，衛(wèi)生工作者職業(yè)暴露的危險性及藥物防范，91~94.

3．《艾滋病病毒感染的診斷與治療》邵一鳴，蔣巖，欒為民主譯，科學出版社 2002年2月第1版，張福杰譯，第六章 ，抗逆轉錄病毒藥物，173~203，張福杰校，第四章，抗逆轉錄病毒治療55~118.

4．《基層醫(yī)務人員艾滋病臨床診療手冊》程峰，張福杰主編，人民衛(wèi)生出版社，2002年12月第一版，ISBN 7-117-05292-9/R . 5293.

5．《基層醫(yī)務人員艾滋病臨床診療手冊培訓教材》程峰，張福杰主編，人民衛(wèi)生出版社，2002年12月第一版， ISBN 7-117-05291-9/R . 5292.

6．《傳染性非典型肺炎防治工作指南》中國疾病預防控制中心編，張福杰編審之一，中國協(xié)和醫(yī)科大學出版社，2003年6月第一版，ISBN 7-81072-404-5/R. 399.

7．《艾滋病的臨床治療與護理》中國疾病預防控制中心編，張福杰，抗逆轉錄病毒治療84~98，艾滋病母嬰傳播與阻斷100~111北京大學醫(yī)學出版社，2003年5月第一版，ISBN 7-81071-471-6.

8．《基層醫(yī)生艾滋病治療手冊》張福杰，趙紅心主編，人民衛(wèi)生出版社，2004年8月第一版，ISBN 7-117-06343-2.

9．《艾滋病》蔣巖主編，張福杰，陜西科學技術出版社，2005年1月.Ⅳ.R512.91-49.

10．《艾滋病兒童治療與關懷手冊》 王臨虹主編，編者張福杰等，人民衛(wèi)生出版社，2005年2月第一版. ISBN 7-117-066625-3.

11．《資源有限地區(qū)的抗艾滋病病毒治療指南》張福杰主譯，人民衛(wèi)生出版社，2005年2月第一版. ISBN 7-117-06608-3.

12. 《國家免費艾滋病抗病毒藥物治療手冊》張福杰編寫組長，人民衛(wèi)生出版社，2005年4月第一版. ISBN 7-117-06685-7/R 6686.

13．AIDS and Social Policy in China edited by Joan Kaufman, Arthur Kleinman, and Tony Saich 5 Initiation of the National Free Antiretroviral Therapy Program in Rural China 96 Fujie Zhang, Michael Hsu, Lan Yu, Yi Wen, and Jennifer Pan.

14．《中國艾滋病流行與控制》王隴德主編，第二十章抗艾滋病病毒治療工作進展227~237，張福杰，北京出版社2006年6月第以版 2006 ISBN 7 -200-06475-0.

15．[Fujie Zhang(s)]. (2008). [Country review: China]. In: Zuniga JM, Whiteside A, Ghaziani A, Bartlett JG, eds. A Decade of HAART. Oxford: Oxford University Press.

16.《 艾滋病診療學》張福杰主譯，人民衛(wèi)生出版社，2009.7 ISBN 978-7-117-11860-6.

17.《性傳播疾病新進展》張福杰等 74~79，和88~95， 人民軍醫(yī)出版社，2009.9 ISBN 978-7-5091-2809-1.

18. 《國家免費艾滋病抗病毒藥物治療手冊》張福杰編寫組長，人民衛(wèi)生出版社， 2012年第三版. ISBN 7-117-15365-2/R 15366.

發(fā)表中英文科學論文100余篇，包括：

Zhang F, Dou Z, Ma Y, et al. Effect of earlier initiation of antiretroviral treatment and increased treatment coverage on HIV-related mortality in China: a national observational cohort study. The Lancet infectious diseases 2011; 11(7): 516-24.

Zhang F, Zhu H, Wu Y, et al. HIV, hepatitis B virus, and hepatitis C virus co-infection in patients in the China National Free Antiretroviral Treatment Program, 2010u201312: a retrospective observational cohort study[J]. Lancet Infectious Diseases, 2014, 14(14):1065u20131072.

Jia Z, Mao Y, Zhang F, et al. Antiretroviral therapy to prevent HIV transmission in serodiscordant couples in China (2003u201311): a national observational cohort study[J]. Lancet, 2013, 382(9899):1195-1203.

Fujie Zhang, Zhihui Dou, Lan Yu, et al. The Effect of Highly Active Antiretroviral Therapy on Mortality in HIV-Infected Former Plasma Donors in China[J]. Clinical Infectious Diseases, 2008, 47(6):825-33.

Ye Ma and Fujie Zhang et al(Corresponding author) Monitoring HIV Drug Resistance Using Early Warning Indicators in China: Results From a Pilot Survey Conducted in 2008. Clin Infect Dis, 2012:54 (Suppl 4). PMID: 22544191.

Ye Ma, Fujie Zhang et al(Corresponding author). (2010). Predictors of Virological Failure in HIV-1u2013Infected Adults Receiving First-Line Antiretroviral Therapy in 8 Provinces in China. Clin Infect Dis, 50, 264u201371.

2003年獲北京市科學技術獎三等獎

2008年12月獲中華醫(yī)學科技獎一等獎