1947年9月參加革命工作，1949年1月加入中國共產(chǎn)黨。歷任陜西興平知行農(nóng)專校專、支前糧站區(qū)專、茂陵小學校長、郭區(qū)區(qū)長；咸陽區(qū)專員、公署民政科秘書；西北地質(zhì)局人事處秘書；甘肅地質(zhì)局黨組秘書、黨委辦公室副主任、測繪處副處長；甘肅綜合地質(zhì)大隊辦公室副主任；甘肅地質(zhì)局水文二隊副隊長、第一區(qū)測隊副隊長；甘肅區(qū)域地質(zhì)調(diào)查隊隊長、書記等職。

1985年12月離休。享受副地級待遇。

2013年10月11日，孔令謀同志因病逝世，享年87歲。