曾任廣東惠州司理，從政有方，惠民清廉，嚴(yán)刑峻法，將數(shù)名貪贓枉法者查處究辦，郡治肅然。癸酉（1633）分典鄉(xiāng)試文武闈兩元皆出其門，名聲大震。制府重其才，委他剿九連山寇，希哲設(shè)奇制勝，威震東粵。復(fù)上方略建城以守，為四省保障，上聞將其擢行取會巨寇劉香，時(shí)巨寇出沒海濱，制府命哲相機(jī)觀變，哲應(yīng)命啟行入海豐界，開誠示信，寇遣人持密揭饋白鏹（成串銀錢）三十萬兩為壽，哲卻不受。時(shí)賊陳兵仗兇挾道擄掠，過往船艘因懼怕，均送錢財(cái)撫人情，吳希哲使計(jì)，喬裝貨船覊縻之（謂寵絡(luò)使不生異心），而暗修戰(zhàn)備，約閩師會戰(zhàn)。并策劃出奇制勝，占風(fēng)縱火焚擊寇艦，盡殲余黨，海事悉平。

丙子（1636）應(yīng)江右聘分試鄉(xiāng)闈所拔皆名士，丁丑（1637）內(nèi)召敷奏詳明，御筆親擢刑科給事。條陳邊防十策，切中當(dāng)局之謬。已卯（1639）邊圍孔棘（邊疆清兵侵?jǐn)_），希哲奉命督浙直餉，時(shí)東南賦役繁重，疲民不堪命。希哲撫民而查處墨吏賕賄（貪官污吏贓物錢糧）以佐軍需。報(bào)完復(fù)命，以年例調(diào)外，因事母，陳情終養(yǎng)而歸。時(shí)桑梓淳邑京絹駁觧困苦，希哲上疏改折色（即本色初制品）永為定例。淳人德之，為其建起高山書院。時(shí)縣令高秉衡在縣城隍廟左本擬建祠以祀，希哲不許而建高山書院，云峰也建了世進(jìn)士坊，縣志將其入載“名臣”篇，并入鄉(xiāng)賢祠。

吳希哲著作甚豐，有《云起堂集》十六卷、《春秋明微》二十四卷、《刪評二十一史》一卷、《連年方略》一卷、《明允錄》一卷。