1399年，己卯，七月燕王朱棣殺張謝貴等，舉兵稱“靖難”。丘福與朱能、張玉一起率先攻奪九門。大戰(zhàn)真定，突入子城。戰(zhàn)于白溝河，他率勁卒直搗敵軍中堅(jiān)。夾河、滄州、靈璧諸場(chǎng)大戰(zhàn)。丘福都為前鋒。盛庸軍扼守淮河，數(shù)千艘戰(zhàn)艦排列淮河岸邊。丘福與朱能率領(lǐng)數(shù)百人，西行二十里，從上游悄悄渡過淮河，突然進(jìn)逼南軍。盛庸大驚而逃，燕軍奪取全部戰(zhàn)艦，使大軍得以渡河。丘福累升至中軍都督同知。

　　丘福為人樸實(shí)憨厚，十分勇猛，出謀劃策不如張玉，敢沖敢戰(zhàn)卻與朱能相同。每打勝仗諸如將都爭(zhēng)相獻(xiàn)上所俘獲的東西，丘福卻獨(dú)落其后，成祖朱棣每次都嘆道：“丘將軍之功，我心里明白�！奔次缓螅�大封功臣，將丘福排在首位。授為奉天靖難推誠(chéng)宣力武臣，特進(jìn)榮祿大夫、右柱國(guó)、中軍都督府左都督，封為淇國(guó)公，食祿二千五百石，并被授予世襲憑證，成祖下令商議諸功臣的封賞，及第次奉命議政，丘福均排在首位。

　　漢王高煦多次率軍有功，成祖很疼愛他。丘福是個(gè)武人，與高煦關(guān)系很好，多次勸皇上立他為太子�；噬溪q豫再三，最終立仁宗朱高熾為太子，命丘福為太子太師。六年（1408年），丘福增加食祿一千石。隨即受命與蹇義、金忠等輔導(dǎo)皇長(zhǎng)孫。永樂七年（1409年）七月，丘福率大軍出塞，至臚朐河，被韃靼本雅失里誘入重圍，受困乏力戰(zhàn)陣亡。

　　在此之前，本雅失里處死使臣郭驥，皇上大怒，發(fā)兵聲討。命丘福佩征虜大將軍印，充任總兵官，武城侯王聰、同安侯火真為左、右副將，靖安侯王忠、安平侯李遠(yuǎn)為左、右參將，率十萬(wàn)騎兵前往�；噬蠐�(dān)心丘福輕敵，囑咐道：“兵事必須慎重。自開平以北，即使未見賊寇，也應(yīng)時(shí)時(shí)如臨敵兵，相機(jī)進(jìn)退，不可固執(zhí)一見，一戰(zhàn)末捷，可圖再舉。”出發(fā)之后，又接連賜詔，說軍中如果有人認(rèn)為敵兵，容易攻取，千萬(wàn)不要相信。

　　丘福出塞后，率千余人先至臚朐河之南。遇上敵軍游騎，擊敗之，遂流河。俘獲其一名尚書，給他酒喝，并詢問本雅失里現(xiàn)在何處。尚書說：“聽說大軍來到，他惶恐北逃，現(xiàn)在大概離這三十里�！鼻鸶４笙驳溃骸皯�(yīng)當(dāng)馬上去將他擒獲�！敝T將請(qǐng)求等諸軍齊集，并偵察虛實(shí)后再出兵。丘福不聽。以尚書為向?qū)�，直逼敵營(yíng)。交戰(zhàn)二日，每次作戰(zhàn)，敵軍總是佯裝戰(zhàn)敗退去。丘福急于想乘機(jī)取之。李遠(yuǎn)勸道：“將軍輕敵人之言，毫無把握地率軍轉(zhuǎn)戰(zhàn)，敵人故意示弱引誘我軍深入，我軍前進(jìn)必然不利，后退則恐怕為敵所乘，所以只能結(jié)營(yíng)自固。白天揚(yáng)旗擊鼓，出奇兵向敵人挑戰(zhàn)；夜里則燃炬鳴炮，聲張軍勢(shì)，使敵人摸不著頭腦。待我軍全部趕到，合力而攻，必定獲勝，否則也可以全軍而返。當(dāng)初皇上對(duì)將軍說了些什么，你難道都忘了嗎？”王聰也力言不可。丘福都聽不進(jìn)去，并厲聲說道：“違命者斬！”隨即率先驅(qū)馬前進(jìn)，命士卒隨后行，騎馬的人都哭了。諸將不得已與他同行。不久，敵軍大至，將他們重重包圍起來，王聰戰(zhàn)死，丘福及諸將都被俘遇害，丘福當(dāng)時(shí)六十歲，全軍覆沒。消息傳至朝廷，成祖朱棣為之震怒，因?yàn)橹T將中無人能承擔(dān)此任，決定親征。并剝奪丘福的世襲爵位，將其家遷徙海南。