明應(yīng)7年（1498年）改名為義尹（よしただ）、永正10年（1513年）當(dāng)復(fù)任為室町幕府征夷大將軍再改名為義稙（よしたね）。

1489年，年僅二十五歲的將軍 足利義尚在爭討六角高賴暴亂時(shí)死去；于是義材和義視一起上首都，義材被推薦為第十代將軍。

但是義視在當(dāng)時(shí)繼承人的事件中，曾經(jīng)與第9任將軍義尚母親日野富子有嫌隙，富子因此也連帶不喜歡義材。1491年義視過世后，富子開始謀畫更換將軍之事。1493年，富子與 細(xì)川政元合作，廢除義材的將軍之位，改立 堀越公方 足利政知之子 足利義澄當(dāng)將軍。（詳見 明應(yīng)之變）

義材經(jīng)過幽禁、逃走，最后投靠 大內(nèi)義興。永正5年（1508年）在大內(nèi)義興支持下回歸京城，廢去足利義澄，再任將軍直到1521年與 細(xì)川高國不合出走，被廢去將軍之職，直至1523年在 阿波國撫養(yǎng)（現(xiàn)在的 鳴門市）逝世，享年57歲。

文正元年七月三十日（1466年9月9日）出生在美濃，是 足利義視的兒子。其母親是里松重政（日野重政）的女兒，也是御臺(tái)所 日野富子的妹妹。長享3年（1489年）3月26日，從兄 足利義尚在征討 近江國六角高賴期間死去，足利義材隨父親義視一起到達(dá)京都，參加義尚的葬禮，并希望成為義尚的繼承人。同時(shí)從兄香嚴(yán)院清晃（后來的足利義澄）受到管領(lǐng) 細(xì)川政元的推舉，政元反對(duì)義材繼任將軍，因此執(zhí)政的 足利義政沒有指定繼任的將軍。翌年正月義政逝世后，義材受到了義政遺孀 日野富子的推舉，成為第10代將軍。

足利義材繼任初期，實(shí)權(quán)掌握在大御所 足利義視的手里。延德3年（1491年）正月，義視死去，足利義材同前管領(lǐng)畠山政長協(xié)調(diào)，欲獨(dú)斷幕政。然而這卻將擁立義材的 日野富子推向了對(duì)立面。同時(shí)管領(lǐng) 細(xì)川政元也反對(duì)義材并支持清晃，一時(shí)間許多 幕府高官都反對(duì)義材。同年8月，足利義材不顧 細(xì)川政元的反對(duì)，繼承前將軍義尚的事業(yè)征討六角高賴并成功將其驅(qū)逐。

畠山氏在應(yīng)仁之亂中分裂為畠山政長和畠山義就兩派。明應(yīng)2年（1493年）2月，畠山義就病逝，足利義材、畠山政長等率軍赴河內(nèi)，討伐其繼任者畠山義豐（基家）。

然而反對(duì)派趁足利義材在外之機(jī)發(fā)動(dòng)政變。4月，細(xì)川政元、 日野富子、 伊勢貞宗等人宣布廢黜足利義材，擁立足利義澄為將軍。隨后肅清了其在京都的黨羽，京都市中騷然。由于足利義材是被 后土御門天皇親自任命為將軍的，因此天皇非常憤怒，準(zhǔn)備退位，但被權(quán)大納言甘露寺親長勸阻。而根據(jù)《公卿補(bǔ)任》記載，直到 后土御門天皇駕崩之后，朝廷才承認(rèn)足利義澄的將軍之位。

政變發(fā)生后， 細(xì)川政元派人出兵河內(nèi)國，擊敗了足利義材。畠山政長自殺，足利義材持足利將軍家的兩件傳家寶：甲胄“御小袖”和“御劍”，前往 細(xì)川政元家臣上原元秀的軍中投降。隨后義材被押往京都，幽禁在 龍安寺。在此期間， 日野富子指示毒死義材，但失敗了。

足利義材在幽禁期間，得知自己將被流放到 小豆島，同年6月29日在側(cè)近人的幫助下逃離京都，到達(dá)畠山政長的領(lǐng)國越中國的放生津，并受到了政長家臣神保長誠的保護(hù)，在該地區(qū)豎立 幕府，稱為“越中公方”或“越中御所”。后世史學(xué)家稱之為“放生津 幕府”。此時(shí)足利義材僅僅只是沒有實(shí)力的亡命者。

明應(yīng)7年（1498年）9月，足利義材決定與 細(xì)川政元方面交涉，前往越前國受到朝倉貞景的庇護(hù)，改名義尹。同時(shí)得到了畠山 尚順（畠山政長之子）的支持，一起進(jìn)軍京都。又有延歷寺、根來寺和高野山僧兵的呼應(yīng)，一時(shí)進(jìn)逼 近江國。但在近江坂本遭六角高賴的擊敗，逃往河內(nèi)國時(shí)又為 細(xì)川政元所敗，足利義尹只得逃往周防國，投奔在應(yīng)仁之亂中曾支持父親義視的大內(nèi)氏，寄居 大內(nèi)義興的門下。畠山 尚順則逃往 紀(jì)伊國。

1507年（永正4年）， 細(xì)川政元遭到暗殺， 細(xì)川氏陷入內(nèi)訌（永正錯(cuò)亂）。義尹見機(jī)決定復(fù)辟，次年4月在大內(nèi)氏的支持下聯(lián)合 中國地方和 九州的 大名進(jìn)軍京都，并得到 細(xì)川高國等人的支持。6月占領(lǐng)京都，放逐了將軍足利義澄和管領(lǐng) 細(xì)川澄元，7月復(fù)位為將軍。

此后足利義尹派與足利義澄派發(fā)生戰(zhàn)爭，但在永正8年（1511年）8月船 岡山之戰(zhàn)爆發(fā)前義澄病死，而且此戰(zhàn)中義尹派勝利。足利義尹的將軍之位得到確定，改名義稙。足利義稙任命 細(xì)川高國、 大內(nèi)義興為管領(lǐng)代，并以大內(nèi)義興為軍事支持。然而由于足利義稙有很強(qiáng)的親政傾向，永正10年（1513年）3月，由于與 細(xì)川氏、大內(nèi)氏、 畠山氏等家族的對(duì)立，足利義稙逃往甲賀，并在當(dāng)?shù)厣�了病。一時(shí)間流傳著將軍死亡的說法，東寺和伊勢神宮為將軍的病愈而祈禱。同年5月義稙與各家族和解并回到京都。永正15年（1518年） 大內(nèi)義興以領(lǐng)內(nèi)有事為由，辭去管領(lǐng)代之職歸國。足利義稙同另一位管領(lǐng)代 細(xì)川高國發(fā)生很深的對(duì)立。

大永元年（1521年）3月，足利義稙再次出奔，到達(dá)和泉國的堺。由于同月將舉行 后柏原天皇即位儀式，將軍的出奔可能會(huì)使即位儀式推遲。因此天皇大怒，在沒有將軍參加的情況下照常舉行了即位儀式，命令 細(xì)川高國擔(dān)任警備事務(wù)。

在后柏原天皇的同意下， 細(xì)川高國擁立足利義澄的兒子 足利義晴為新任將軍。而足利義稙失去了朝廷的支持和信賴，逃亡淡路再次舉兵討伐高國，戰(zhàn)敗。大永3年4月9日（1523年5月23日）病逝于阿波國的撫養(yǎng)（今 德島縣 鳴門市），享年57歲。