生于德國波茨坦。早年在柏林、維爾茨堡和維也納學(xué)醫(yī)，獲柏林大學(xué)醫(yī)學(xué)博士學(xué)位。曾任耶魯大學(xué)動物學(xué)教授。是最早繪制動物系譜圖的學(xué)者之一。大力支持達(dá)爾文的進(jìn)化論，推動了繼達(dá)爾文之后生物學(xué)研究的開展，并通過對胚胎學(xué)、形態(tài)學(xué)與細(xì)胞理論的研究使生物學(xué)研究的范圍不斷擴(kuò)展。提出了“生態(tài)學(xué)”一詞。著有《生物體普通形態(tài)學(xué)》、《創(chuàng)造的歷史》、《 人類的進(jìn)化》、《宇宙之謎》、《放射蟲目》�！『？藸柋緛淼穆殑�(wù)是醫(yī)生，后來任比較解剖學(xué)的教授。他是最早將心理學(xué)看作是生理學(xué)的一個分支的人之一。他引入了一些今天在生物學(xué)中非常普遍的術(shù)語如 生態(tài)學(xué)、門等，他將政治學(xué)稱為是“應(yīng)用生物學(xué)”。他的一些理論和主張后來被納粹理論家利用，成為其種族主義和社會達(dá)爾文主義的理由。�？藸栆彩莾�(yōu)生學(xué)的先驅(qū)。

�？藸柋容^知名的文章主要是他的科普、嘲諷文章或者他的游記，但他的學(xué)術(shù)文章今天依然可以提供新的啟發(fā)。比如他1866年的《形態(tài)學(xué)大綱》是世界上第一部達(dá)爾文的進(jìn)化論的教科書，在他的1874年的《人類學(xué)》中他使用比較解剖學(xué)的方法來探討人從動物世界的進(jìn)化和人的來源。他的三卷長的《系統(tǒng)發(fā)生學(xué)》至今很少有人讀，這是一部從1894年到1896年發(fā)表的巨著，其中�？藸柮枋隽怂麑φ麄�動物世界的進(jìn)化和親屬關(guān)系的認(rèn)識。

1862年， �？藸栆�?yàn)閷Ψ派湎x的出色研究，升為德國耶拿大學(xué)的教授，并在這個職位上呆了足足四十二年。他是一位很有激情的演講者和作者，致力于推廣普及形態(tài)學(xué)研究和進(jìn)化論（達(dá)爾文的《物種起源》在1859年才發(fā)表，進(jìn)化論在當(dāng)時的德國基本上還是全新的）。然而，作為一個可能是過度文藝了的科學(xué)青年（1862年他只有二十八歲），他在嚴(yán)謹(jǐn)?shù)目蒲�、科學(xué)推廣還有藝術(shù)創(chuàng)作之間有些搖擺不定了。

19世紀(jì)50年代，是插圖大量進(jìn)入各學(xué)科教室的時期，而胚胎學(xué)無疑又是最依賴圖像教學(xué)的學(xué)科，因?yàn)樗�所關(guān)注的細(xì)節(jié)往往極其微小而陌生，因此模式圖——教會學(xué)生如何去看、要尋找哪些特征——成為至關(guān)重要的手段。反過來，圖像作為科研的工具和證據(jù)還沒有那么普遍。海克爾正是在這里模糊了科普和科研的界限。在他看來，科研著作的插圖，正如在教學(xué)中一樣，不是證據(jù)，只是換一種方式來展現(xiàn)他由其他途徑得到的結(jié)論而已，因此為了追求展現(xiàn)模式，他犧牲了對具體標(biāo)本的忠實(shí)性；另外，插圖的其它一些細(xì)節(jié)（比如標(biāo)本學(xué)名、來源、胚胎具體大小和階段）也沒有被他重視。

可是，由于研究條件所限，海克爾手中的研究材料并不很多，由此得出的不少結(jié)論也頗有偏差，所謂的“模形圖”并沒能如他希望的那樣表達(dá)出真實(shí)的情形。更糟的是，先前的模式圖幾乎全部是線條圖，�？藸枀s憑他出色的美術(shù)技巧把他心目中的“模式圖”全畫成了生動的陰影圖；他的同行大多認(rèn)為這些圖是對真實(shí)標(biāo)本的忠實(shí)再現(xiàn)。因此，當(dāng)同行逐漸意識到這些圖和他們自己觀察到的現(xiàn)象有所差異時，他們并沒有指責(zé)�？藸柕睦碚撚姓`，而是指責(zé)他造假。

海克爾認(rèn)為生物學(xué)在許多方面與藝術(shù)類似。自然界中的對稱，比如單細(xì)胞生物中的放射蟲對他的藝術(shù)天賦有很大的啟發(fā)。尤其著名的是他畫的浮游生物和海母的畫，這些圖畫生動地體現(xiàn)了生物世界的美。不論是在他的學(xué)術(shù)著作還是在他的科普著作中他都畫有優(yōu)美的插圖。他的圖畫對20世紀(jì)初的藝術(shù)也有影響。新藝術(shù)運(yùn)動就是從他的一些插圖中獲得啟發(fā)形成的。

海克爾在耶拿的住宅和那里的一個他資助的博物館的建筑也體現(xiàn)出了他的藝術(shù)天才。

�？藸柗浅Ｇ趧�。僅使用英國的“挑戰(zhàn)號”的數(shù)據(jù)他描寫了3500多個放射蟲的種。他的這份報告共三卷，2750頁，包括140個非常細(xì)膩的放射蟲的圖像。尤其是他的第一位夫人逝世后他往往每天工作18小時。

�？藸枌τ趥�體發(fā)育和種系遺傳學(xué)的平行觀察促使他提出了個體發(fā)育與進(jìn)化過程中的因果關(guān)系的理論。這就是所謂的復(fù)演說。今天這個理論已被推翻。

由于海克爾對進(jìn)化論的證明不精確，而且他本人將自然科學(xué)的認(rèn)識與宗教對立起來，因此他的理論成為試圖駁倒進(jìn)化論的創(chuàng)造論者的攻擊對象。他也受到后來的生物學(xué)家如史蒂芬·杰·古爾德的批評。在哲學(xué)上他持一元論，認(rèn)為“世界與上帝是同一的”。在他的《世界疑問》中他寫道：

隨著每年我們對自然的認(rèn)識的發(fā)展過去的對立不斷縮小，因此最基本的世界觀問題的解決也越來越近了。我們可以希望在將來的20世紀(jì)越來越多這些對立統(tǒng)一起來，越來越多的人接受這個希求的世界觀的統(tǒng)一的一元論。

�？藸柌⒎菄�(yán)格的無神論者。他雖然反對創(chuàng)世論，但他出生于一個基督教家庭，他認(rèn)為世界萬物（包括無機(jī)的礦物）是有靈魂的。他的唯物主義是一個有靈魂的物質(zhì)的物質(zhì)主義。他認(rèn)為上帝與萬能的自然規(guī)律是同一的。他使用“細(xì)胞記憶”和“晶體靈魂”之類的詞語。

�？藸枱o疑是德國優(yōu)生論的啟發(fā)人。在他的《生命奇跡》中他寫道：“我們的文明國家人為地養(yǎng)育著成千上萬得了不治之癥的人，比如神經(jīng)病者、麻風(fēng)病人、癌癥病人等等，這對這些人本身和對整個社會沒有任何好處�！睆�1905年起�？藸柺恰皟�(yōu)生論社團(tuán)”的成員。

在�？藸柕奈恼轮谐３ｓw現(xiàn)出他的德國民族沙文主義。比如在他的《永久》中他寫道：“每個教育良好的德國戰(zhàn)士……在智慧和道德價值上要比上百個英國、法國、俄國和意大利所能提供的原始的自然人要高�！痹凇缎螒B(tài)學(xué)大綱》中他說：“高等人與低等人之間的差別比低等人與高級動物之間的差別要大。”

這些和其它許多�？藸柕难哉撌顾�在德國思想史上起了一個非常不光彩的作用：他是納粹主義的鋪路人。尤其是�？藸柪�用他在學(xué)術(shù)界的權(quán)威地位來普及他的政治觀點(diǎn)。

�？藸柕睦碚搶�進(jìn)化論的歷史非常重要。�？藸栆彩翘岢錾鷳B(tài)學(xué)這個概念的人。尤其他在解剖學(xué)上的知識給進(jìn)化論提供了很多新的觀點(diǎn)。他還描述了上百新的物種。此外他引入了使用家譜圖來描寫生物學(xué)中的進(jìn)化關(guān)系的表示方式。不過今天這樣的家譜圖已經(jīng)被認(rèn)為是過時和不準(zhǔn)確的。他提出了所有生物是從共同的祖先發(fā)展出來的設(shè)想。他推測這些祖先可能分三個組。大多數(shù)他的理論今天已經(jīng)過時了。

從現(xiàn)代的生物學(xué)來看，�？藸�1866年推出的復(fù)演說是錯誤的，這個理論并非自然規(guī)律。雖然如此這個觀察依然有一定的意義。它雖然不是一個自然規(guī)律，但是一個經(jīng)常發(fā)生的現(xiàn)象。由于�？藸栕屗�的哲學(xué)觀點(diǎn)影響他的學(xué)術(shù)觀點(diǎn)，因此他的一些生物的圖畫部分故意畫錯。從哲學(xué)上來說，他更加偏向拉馬克的用進(jìn)廢退的理論。他有時故意錯誤地描寫自然現(xiàn)象或者至少不精確嚴(yán)格地從各個方面來觀察這些現(xiàn)象來使得他的描寫更加符合他的一元論的哲學(xué)理論。

在動物學(xué)方面，海克爾主要研究放射蟲、海綿體等低等海洋動物的系統(tǒng)分類，描述了近4000個新種。1862年出版的《放射蟲目》專著，按照親緣關(guān)系，建立自然分類系統(tǒng)，并努力尋找原始型。

傳播達(dá)爾文的進(jìn)化論是他一生學(xué)術(shù)活動中的重要內(nèi)容。堅信進(jìn)化學(xué)說并把進(jìn)化論作為反對當(dāng)時社會上和宗教方面保守主義思想的主要武器，先后出版了《創(chuàng)造的歷史》、《人類的進(jìn)化》等著作，通俗地介紹了達(dá)爾文的進(jìn)化論。并根據(jù)形態(tài)學(xué)、胚胎學(xué)和古生物學(xué)的證據(jù)，提出了人類起源于動物的看法。主要著作《生物體普通形態(tài)學(xué)》呈現(xiàn)了達(dá)爾文進(jìn)化論的有力證據(jù)。該書提出了反映動、植物演化關(guān)系的系統(tǒng)樹，以及生態(tài)學(xué)、生物地理學(xué)等名詞及定義；同時還強(qiáng)調(diào)：“個體發(fā)育是系統(tǒng)發(fā)育的簡短而迅速的重演”，而且是由“遺傳（繁殖）和適應(yīng)（營養(yǎng)）的生理功能所決定的”。1872年，他把這種曾由德國解剖學(xué)家J.F.梅克爾提出過的關(guān)系，稱為生物發(fā)生律，亦即重演律。此后，他又進(jìn)一步提出海綿體早期胚胎所經(jīng)歷的內(nèi)陷過程——原腸形成，也發(fā)生在多細(xì)胞動物中，認(rèn)為所有多細(xì)胞動物都是從一個共同的原始型——原腸祖演化來的，這就是科學(xué)史上有名的“原腸祖說”。他的這些觀點(diǎn)雖然在歷史上對進(jìn)化論的宣傳和普及起過積極作用，但它本質(zhì)上是機(jī)械的，不盡符合實(shí)際，比如生物的個體發(fā)育，大體上類似于系統(tǒng)發(fā)育，但決不是系統(tǒng)發(fā)育的重演。 年老后，由對科學(xué)事實(shí)的探討轉(zhuǎn)至哲學(xué)。認(rèn)為正確的研究方法是“哲學(xué)上的經(jīng)驗(yàn)論”、歸納與演繹的相互作用。用機(jī)械的因果關(guān)系取代“教條的”或“生機(jī)論與目的論”的自然觀，支持“一元論”的觀點(diǎn)，認(rèn)為精神與物質(zhì)是統(tǒng)一的。

1834年2月16日 出生于德國波茨坦市。 1852～1858年 在維爾茨堡和柏林等地學(xué)醫(yī)。 1857年 完成專著《論甲殼動物的組織》，獲博士學(xué)位。 1858年 通過國家醫(yī)學(xué)考試；到耶拿動物研究所工作。 1859～1860年 到意大利作考察旅行，著重研究原生動物放射蟲。 1860年 在德國宣傳和捍衛(wèi)達(dá)爾文進(jìn)化論，并建立“一元論哲學(xué)”。 1861年 到耶拿大學(xué)任教。 1862年 任耶拿大學(xué)動物學(xué)與比較解剖學(xué)教授。直到1909年退休。 1919年8月9日 卒于耶拿。