他在研讀一年法律后，仍念念不忘軍旅的召喚，在1886年再次接受任命，任第36兵團上尉。在其后的3年期間，他一直領銜上尉。這期間，他在一次狂歡節(jié)中遇到了一位美麗的姑娘瑪麗·平克妮·哈迪。他倆一見傾心，終身恩愛不渝。哈迪于1852年生于弗吉尼亞州，是一個有錢有勢的棉花商的14個子女之一。他們于1875年5月在這位富商巍峨雄偉的私邸——河畔大廈舉行婚禮。

1889年，他被提升為少校，到首都華盛頓陸軍司令部服務四年。在那里，他獲得法律學校的法律博士學位。之后，他再次被提升為中校。如果不是因為爆發(fā)了美國——西班牙戰(zhàn)爭，他很可能就會默默無聞地結束他的軍旅生涯。

1898年4月 美西戰(zhàn)爭爆發(fā)后，阿瑟被提升為準將，指揮一個步兵旅。這個旅被運到了菲律賓。在韋斯利·梅里特的第三軍編成內作戰(zhàn)，他率領全旅勇敢地投入了戰(zhàn)斗，和 艾米利奧·阿奎納多領導的菲律賓起義者作戰(zhàn)，1899年2月成功防守了馬尼拉。接著麥克阿瑟將軍又經過十幾次浴血奮戰(zhàn)，全面控制了菲律賓，美國的報紙以顯著版面報道了他的功績。他很快便成為美國駐菲律賓所有部隊的指揮官，并被任命為該群島的軍事總督。

這是阿瑟軍旅生涯的全盛時期。麥克阿瑟在他任軍事總督之職的14個月期間，實行許多項自由化改革，創(chuàng)建了免費的公立學校制度，根據(jù)他在法律方面的經驗，改革了古老而殘酷的司法制度。他發(fā)起一項雄心勃勃的經濟計劃，并奠定了建立軍事機構的基礎。

1901年7月，阿瑟·麥克阿瑟和菲律賓文職總督 威廉·霍華德·塔夫脫發(fā)生沖突被解職調回國內。在其后的數(shù)年間，先后在科羅拉多、湖區(qū)和東部軍區(qū)任司令， 日俄戰(zhàn)爭期間曾在日本當武官和高級軍事觀察員，1906年8月在亞洲各處巡游，觀察各國軍隊和軍事情況，回國后任太平洋軍區(qū)司令，晉升中將。由于他批評陸軍的現(xiàn)狀，以及和陸軍部長塔夫脫的爭吵，使他未能成為陸軍參謀長，他拒絕成為東部軍區(qū)司令，1909年6月升遷無望時他退役隱居了。3年后，他在向一批南北戰(zhàn)爭時期的老戰(zhàn)士發(fā)表演說時，猝然逝去，時年67歲。他的兒子就是大名鼎鼎的 道格拉斯·麥克阿瑟。