1121年，忠通之父 忠實(shí)觸怒白河法皇，因而白河法皇將原屬 忠實(shí)的 關(guān)白、藤氏長(zhǎng)者轉(zhuǎn)授忠通。1122年，進(jìn) 從一位，拜 左大臣。1123年， 崇德天皇即位，忠通任攝政。1128年，拜太政大臣。

忠實(shí)偏愛次子賴長(zhǎng)，與忠通不合。1150年 忠實(shí)希望讓賴長(zhǎng)擔(dān)任內(nèi)覽，忠通則向鳥羽法皇表示反對(duì)，此舉令 忠實(shí)大感憤怒，認(rèn)為忠通“不孝”，派人至忠通家中，奪取朱器臺(tái)盤（藤氏長(zhǎng)者的信物），授予賴長(zhǎng)。其時(shí)忠通正欲為嫡子基實(shí)舉行加冠禮，因氏長(zhǎng)者的地位被奪而中止；而后嫡子基實(shí)元服禮、次子基房著袴禮，都只有少數(shù)公卿與會(huì)。在 近衛(wèi)天皇在位期間，賴長(zhǎng)（時(shí)任內(nèi)覽左大臣氏長(zhǎng)者）的權(quán)勢(shì)壓過(guò)任關(guān)白的忠通。

1156年，鳥羽法皇去世，爆發(fā) 保元之亂，賴長(zhǎng)與忠通分屬崇德上皇、 后白河天皇兩方陣營(yíng)。最后 后白河天皇一方得勝，賴長(zhǎng)死于亂中。忠通因而重任氏長(zhǎng)者。

忠通為人寬厚，而喜怒不形于色。擅長(zhǎng)寫文章、和歌、與書法。忠通之子基實(shí)、基房、兼實(shí)，分別為近衛(wèi)家、松殿家、 九條家的始祖。故忠通可謂 五攝家的共祖。