生平
即位
587年（用明天皇2年）4月，用明天皇去世。大連物部守屋欲擁立穴穗部皇子即位。同年6月，大臣蘇我馬子先下手為強，奉炊屋姬（敏達天皇的皇后，即后來的推古天皇）詔，殺死了穴穗部皇子。同年7月，蘇我馬子與群臣商議后，決定消滅物部氏，組成了由諸皇子、諸豪族的聯(lián)合大軍。聯(lián)合大軍進攻在河內(nèi)國涉川郡的物部守屋的居所，經(jīng)過一番苦戰(zhàn)，物部守屋被射殺，聯(lián)合大軍獲勝。物部氏就此沒落。同年8月，蘇我馬子擁立泊瀨部皇子即位，即崇峻天皇。炊屋姬成為皇太后。
興隆佛教
隨著物部氏的沒落，欽明天皇以來的崇佛廢佛之爭終結(jié)，蘇我馬子、廄戶皇子（即圣德太子）等崇佛派獲得全勝。百濟遣使贈送倭國佛舍利及律師、寺工、畫工等。蘇我馬子向百濟僧求教受戒之法，并派以善信尼等赴百濟學(xué)習(xí)佛教及其它學(xué)問。蘇我馬子在飛鳥興建了法興寺（今飛鳥寺）。
暗殺
崇峻天皇即使即位了，政治的實權(quán)仍然在蘇我馬子手中，崇峻天皇感到不滿。公元592年（崇峻天皇5年）10月4日，有人向崇峻天皇進獻了一只豬。崇峻天皇拔出發(fā)笄，刺進豬的眼睛，說：“總有一天要像砍掉豬頭一樣，殺死我所憎恨的人。”并且崇峻天皇開始多設(shè)兵仗，有異于常。蘇我馬子聽到后，開始警惕崇峻天皇對他的憎惡，指使部下東漢直駒暗殺了崇峻天皇。
佐藤長門認為雖然“弒王”（當(dāng)時倭國君主尚未自稱“天皇”，而是被稱為大王）屬于日本歷史上的異常事態(tài)，但暗殺崇峻天皇之后內(nèi)外的政治格局并沒有發(fā)生動蕩，所以“弒王”并不是蘇我馬子一己的策劃與行動，而很可能是在多數(shù)的王族及群臣的同意之下發(fā)生的一起宮廷政變。
家族關(guān)系
祖：繼體天皇
外祖：蘇我稻目
父：欽明天皇
母：蘇我小姉君。
舅：蘇我馬子
妃：大伴小手子（大伴糠手子之女）
嬪及表妹：蘇我河上娘（蘇我馬子之女）
異母兄：敏達天皇
異母兄：用明天皇
異母妹：推古天皇
表弟：蘇我蝦夷
子：蜂子皇子（大伴小手子之子）
女：錦代皇女（大伴小手子之女）
侄：廄戶皇子（即圣德太子，用明天皇之子）
侄：押坂彥人大兄皇子（敏達天皇之子）
