曾任甘肅省農(nóng)業(yè)科學(xué)院副院長。

2019年4月，任甘肅省農(nóng)業(yè)科學(xué)院院長。

政協(xié)甘肅省第九屆、第十屆委員會委員，第十二屆全國政協(xié)委員

2018年1月24日，政協(xié)第十二屆全國委員會常務(wù)委員會第二十四次會議通過，任命馬忠明為中國人民政治協(xié)商會議第十三屆全國委員會委員。

2019年3月19日，中共甘肅省委組織部發(fā)布干部任前公示，馬忠明擬任省農(nóng)科院院長。

2019年4月1日，甘肅省人民政府決定：馬忠明任甘肅省農(nóng)業(yè)科學(xué)院院長。

中國干旱半干旱地區(qū)工業(yè)污染農(nóng)業(yè)土壤管理中荷技術(shù)轉(zhuǎn)移中心主任、中國土壤學(xué)會理事、中國植物營養(yǎng)與肥料學(xué)會理事、中國栽培研究委員會委員、甘肅省環(huán)境科學(xué)學(xué)會副理事長、甘肅省農(nóng)業(yè)機(jī)械化學(xué)會副理事長、甘肅省科技市場協(xié)會副會長、甘肅省科技創(chuàng)新研究會常務(wù)理事、甘肅省黨外知識分子聯(lián)誼會常務(wù)理事和公安部特邀監(jiān)督員，國家西甜瓜現(xiàn)代產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系土壤肥料崗位科學(xué)家等。

首批入選甘肅省“333”跨世紀(jì)學(xué)術(shù)技術(shù)帶頭人和甘肅省領(lǐng)軍人才，享受國務(wù)院政府特殊津貼。先后榮獲第三屆甘肅省青年科技獎、第七屆中國農(nóng)學(xué)會青年科技獎和第七屆中國青年科技獎。

2008年選為北京奧林匹克運(yùn)動會蘭州段火炬手，

2011年獲“第一次全國污染源普查先進(jìn)個人”榮譽(yù)稱號，

2012年獲第一屆“甘肅省優(yōu)秀科技工作者”榮譽(yù)稱號。

長期從事作物肥水高效利用和節(jié)水高產(chǎn)栽培理論與技術(shù)的研究和示范推廣工作。先后主持和承擔(dān)完成國際合作項(xiàng)目、國家863高科技項(xiàng)目、國家支撐計(jì)劃、國家基金項(xiàng)目、農(nóng)業(yè)部行業(yè)專項(xiàng)和省科技項(xiàng)目等20多項(xiàng)，通過省部級鑒定科技成果18項(xiàng)，獲科技成果獎13項(xiàng)。其中，國家科技進(jìn)步三等獎1項(xiàng)，中國科學(xué)院自然科學(xué)一等獎1項(xiàng)，甘肅省科技進(jìn)步一等獎1項(xiàng)，甘肅省科技進(jìn)步二等獎5項(xiàng)，甘肅省科技進(jìn)步三等獎1項(xiàng)，其它地廳級獎勵4項(xiàng)。先后在國際國內(nèi)學(xué)術(shù)會議與《Australian Journal of Soil Research》、《Bew?sserungs-wirtschaft》、《中國沙漠》、《生態(tài)學(xué)報》、《中國農(nóng)業(yè)科學(xué)》、《應(yīng)用生態(tài)學(xué)報》、《植物營養(yǎng)與肥料學(xué)報》和《灌溉排水學(xué)報》等國內(nèi)外學(xué)術(shù)期刊上發(fā)表論文90余篇，主編出版《甘肅農(nóng)業(yè)環(huán)境問題與保護(hù)技術(shù)》（中國農(nóng)業(yè)出版社）和《現(xiàn)代綠洲節(jié)水農(nóng)業(yè)與農(nóng)田水肥資源高效利用》（甘肅省科學(xué)技術(shù)出版社）專著2部，副主編出版《西甜瓜生產(chǎn)技術(shù)》（寧夏人民出版社）專著1部，參編出版《中國農(nóng)業(yè)環(huán)境》（科學(xué)出版社）專著1部，制定并發(fā)布地方技術(shù)標(biāo)準(zhǔn)15項(xiàng)，獲國家發(fā)明專利5項(xiàng)，新型實(shí)用專利3項(xiàng)，獲國家著作權(quán)2項(xiàng)，培養(yǎng)碩士博士研究生12名�，F(xiàn)主持農(nóng)業(yè)部行業(yè)專項(xiàng)、國家自然基金和國家現(xiàn)代產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系等項(xiàng)目