抗日戰(zhàn)爭(zhēng)爆發(fā)后，任八路軍一二O師三五九旅七一九團(tuán)參謀長(zhǎng)，參加了王震領(lǐng)導(dǎo)的著名的南泥灣大生產(chǎn)運(yùn)動(dòng)，1948年任三五九旅參謀長(zhǎng)。1949年2月任第一野戰(zhàn)軍步兵第五師參謀長(zhǎng)，后任第一野戰(zhàn)軍第一兵團(tuán)工兵團(tuán)團(tuán)長(zhǎng)、蘭州軍區(qū)工兵處主任，為人民解放軍西進(jìn)和新疆的建設(shè)作出了重大貢獻(xiàn)。

1957年2月，尹保仁轉(zhuǎn)業(yè)到黑龍江省鐵道兵農(nóng)墾局湯原農(nóng)場(chǎng)任場(chǎng)長(zhǎng)。同年10月調(diào)任湖南省大通湖農(nóng)場(chǎng)副場(chǎng)長(zhǎng)，12月，尹保仁指揮南縣民工2000多人圍筑北洲子?xùn)|大堤，1958年住在北洲子分場(chǎng)簡(jiǎn)陋的茅棚里指揮開(kāi)墾荒洲，為北洲子農(nóng)場(chǎng)的早期建沒(méi)作出了重大貢獻(xiàn)。1961年調(diào)任湖南省農(nóng)墾局付局長(zhǎng)，在十年動(dòng)亂中，尹保仁對(duì)黨和共產(chǎn)主義的信念始終堅(jiān)貞不渝，下放蹲點(diǎn)時(shí)，他自覺(jué)地投入到基層建設(shè)當(dāng)中，無(wú)怨無(wú)悔，保持著永不褪色的南泥灣精神。1980年，尹保仁響應(yīng)黨中央的號(hào)召，退出第一線的領(lǐng)導(dǎo)崗位，擔(dān)任湖南省農(nóng)業(yè)廳顧問(wèn)。1982年12月，經(jīng)湖南省委批準(zhǔn)，尹保仁離職休養(yǎng)。

1983年，已經(jīng)離休的尹保仁上京跟老上級(jí)王震請(qǐng)纓“去新疆王政委（王恩茂）那里再干幾年”。1984年，尹保仁回到闊別多年的新疆，被任命為新疆建設(shè)兵團(tuán)副參謀長(zhǎng)。1986年4月25日，尹保仁不幸病逝于烏魯木齊，終年71歲。王震得知后，十分悲痛，高度評(píng)價(jià)說(shuō)：“他是從戰(zhàn)爭(zhēng)烈火中鍛煉出來(lái)的革命老戰(zhàn)士，打仗一貫勇敢，不怕死，他打的很多硬仗，大多有勝無(wú)敗�！睍r(shí)任新疆維吾爾自治區(qū)區(qū)委書記的王恩茂親自主持了尹保仁的追悼會(huì)，給予他高度的評(píng)價(jià)。